Teseptimavirus - Teseptimavirus
| Teseptimavirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Autographiviridae |
| Podčeleď: | Studiervirinae |
| Rod: | Teseptimavirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Escherichia T7 | |
Teseptimavirus (synonyma Fágová skupina T7, Fágy podobné T7, Viry podobné T7, T7likevirus) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Autographiviridae, v podčeledi Studiervirinae. Bakterie slouží jako přirozený hostitel s přenosem dosaženým pasivní difúzí. V současné době existuje v tomto rodu 17 druhů, včetně druhů druhů Virus Escherichia T7.[1][2][3]
Taxonomie
Rozeznávají se tyto druhy:[2]
- Virus enterobakterií IME390
- Virus Escherichia 13a
- Virus Escherichia 64795ec1
- Virus Escherichia C5
- Virus Escherichia CICC80001
- Virus Escherichia Ebrios
- Virus Escherichia EG1
- Virus Escherichia HZ2R8
- Virus Escherichia HZP2
- Virus Escherichia N30
- Virus Escherichia NCA
- Virus Escherichia T7
- Virus Salmonella 3A8767
- Virus Salmonella Vi06
- Virus Stenotrophomonas IME15
- Virus Yersinia YpPY
- Virus Yersinia YpsPG
Struktura
Sp6likeviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava má ikosahedrickou symetrii (T = 7) o průměru přibližně 60 nm. Ocas je nestahovatelný a má šest krátkých subterminálních vláken.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Teseptimavirus | Hlava-ocas | T = 7 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Genom
Genomy jsou lineární, mají délku přibližně 40–42 kB.[1] Genomy všech tří virů byly plně sekvenovány a jsou k dispozici na webových stránkách NCBI. Pohybují se mezi 37 000 až 40 000 nukleotidů s 42 až 60 proteiny. K dispozici jsou všechny tři úplné genomy a několik dalších „neklasifikovaných“ virových genomů tady[3]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se pomocí ocasních vláken váže na receptory adheze hostitelských buněk a prostřednictvím virové DNA vysílá do periplazmy hostitele systém krátkého ocasu. Geny třídy I jsou transkribovány RNA polymerázou hostitelské buňky dříve, než virový genom zcela opustí kapsidu. Geny třídy II jsou poté transkribovány T7 RNA polymerázou a hostitelský genom je degradován. Genomická DNA je replikována T7 DNA polymerázou a před přepisem genů třídy III se tvoří konkatemery. Nakonec se procapsid sestaví a zabalí, ocas se sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Teseptimavirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Dějiny
Podle ICTV je druhá zpráva v roce 1976 rod T7likevirus byl poprvé přijat pod jménem Fágová skupina T7, nepřiřazeno k objednávce, rodině nebo podskupině. Ve třetí zprávě ICTV v roce 1981 byl rod zařazen do rodiny Poloviridae. Fágová skupina T7 byl přejmenován na Fágy podobné T7 v šestá zpráva v roce 1995. V roce 1998 byla celá rodina přesunuta do nově vytvořeného řádu Caudovirales a rod byl znovu přejmenován na sedmá zpráva v letech 1999 až Viry podobné T7. V roce 2009 se rod přesunul do nově vytvořené podčeledi Autographivirinae, a to bylo znovu přejmenováno v 2012 na T7likevirus.[2] Rod byl později přejmenován na Teseptimavirus pod nově založenou rodinou Autographiviridae a podčeleď Studiervirinae.
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 17. února 2015.
- ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 4. května 2020.
- ^ A b NCBI. "T7linkevirus Complete Genomes". Citováno 17. února 2015.