Tequatrovirus - Tequatrovirus

Tequatrovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Duplodnaviria
Království:Heunggongvirae
Kmen:Uroviricota
Třída:Caudoviricetes
Objednat:Caudovirales
Rodina:Myoviridae
Podčeleď:Tevenvirinae
Rod:Tequatrovirus
Zadejte druh
Virus Escherichia T4
Druh

Viz text

Tequatrovirus je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Myoviridae, v podčeledi Tevenvirinae. Gramnegativní bakterie slouží jako přirozený hostitel s přenosem dosaženým pasivní difúzí. V současné době existuje v tomto rodu 21 druhů, včetně druhů druhů Virus Escherichia T4.[1][2][3]

Taxonomie

Následující seznam je mapou města Tequatrovirus druh podle ICTV Seznam hlavních druhů (MSL) 2018b v2:[4][5]

Skupina: dsDNA

  • Rod: Tequatrovirus (dříve T4virus)

Struktura

Druhy T4virus jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava je a prolate sféroid přibližně 120 nm na délku a 86 nm na šířku, s prodlouženou ikosahedrickou symetrií (T = 13, Q = 21) složenou ze 152 celkem kapsomerů. Ocas má šest dlouhých koncových vláken, šest krátkých hrotů a malou základní desku. Ocas je uzavřen v pouzdře, které se při kontrakci uvolňuje a klouže kolem jádra ocasu.[1]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
TequatrovirusHlava-ocasT = 13 Q = 21NeobalenéLineárníMonopartitní

Genom

Genomy jsou lineární, mají délku přibližně 169 kB. Genom kóduje 300 proteinů.[1] Dvanáct ze čtrnácti druhů bylo plně sekvenováno a jsou k dispozici u ICTV. Pohybují se mezi 159 000 až 235 000 nukleotidů s 242 až 292 proteiny. Kompletní genomy jsou k dispozici na internetu Národní centrum pro biotechnologické informace, spolu s kompletními genomy pro desítky dalších podobných neklasifikovaných kmenů virů.[3]

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se připojuje k hostitelské buňce pomocí svých koncových vláken a používá virový exolyzin k degradaci buněčné stěny natolik, aby vysunul virovou DNA do hostitelské cytoplazmy kontrakcí ocasního obalu. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou a Holin /endolysin / spaninové proteiny. Jakmile jsou virové geny replikovány, je prokapsid shromážděn a zabalen. Ocas se poté sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy. Gramnegativní bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
TequatrovirusBakterie: gramnegativníŽádnýInjekceLyzaCytoplazmaCytoplazmaPasivní difúze

Dějiny

The ICTV První zpráva (1971) obsahovala rod T-sudé fágy, nepřiřazeno k objednávce, rodině nebo podrodině. Rod byl přejmenován v roce 1976 na Skupina fágů T-even, se přestěhovala do nově vytvořené rodiny Myoviridae v roce 1981. V roce 1993 byl znovu přejmenován na Fágy podobné T4, a byl přesunut do nově vytvořené objednávky Caudovirales v roce 1998. Příští rok (1999) byl přejmenován na Viry podobné T4. Rod byl znovu přesunut do nově vytvořené podčeledi Tevenvirinae v letech 2010-11 přejmenován na T4likevirus v roce 2012 a opět přejmenována na T4virus v roce 2015. Návrhy před rokem 1993 a od roku 1998 nejsou online k dispozici. Ostatní návrhy jsou k dispozici zde: 1993, 1999, 2010, 2012.[2]

Reference

  1. ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 11. února 2015.
  2. ^ A b „Virus Taxonomy: 2015 Release“. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 4. března 2017.
  3. ^ A b NCBI. „T4virus Complete Genomes“. Citováno 13. února 2015.
  4. ^ https://talk.ictvonline.org/files/master-species-lists/m/msl/7992 ICTV MSL 2018a v1]
  5. ^ Andrew M. Kropinski et al.: Upravit členství rodu T4likevirusa vytvořte šest (6) nových rodů v podčeledi Tevenvirinae, on: ICTV Online

externí odkazy