T4 holin - T4 holin
The Rodina T4 Holin (TC # 1.E.8 ) je skupina domnělých proteinů tvořících póry, která nepatří do jedné ze sedmi holinských superrodin. T-sudý fág, jako je T4, používá pro hostitele systém holin-endolysin lýza buněk. Ačkoli endolysin z fág T4 kódovaný genem e (lysozym E) byl identifikován v roce 1961, holin (produkt genu t a nazývaný T-holin) byl charakterizován až v roce 2001.[1] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny holinů T4 lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.[2]
Struktura
Holín T4 je poměrně velký, má délku přibližně 218 aminoacylových zbytků (aas). Protein je vysoce hydrofilní se 49 kyselými a zásaditými zbytky distribuovanými po jeho délce a jedním domnělým transmembránovým segmentem (TMS) poblíž jeho délky. N-konec, přičemž většina bílkovin v periplazma.[3]
Funkce
Ten velký periplazmatický Doména je hlavním determinantem v časovacím mechanismu a podílí se na inhibici lýzy (LIN).[4] LIN zahrnuje antiholinový rI protein T4 (viz TC # 1.E.8.1.1 ).[5] Inhibice lýzy je účinná strategie pro koordinaci načasování lýzy se zráním fágových částic a pro vyloučení jiných fágů.[6] C-koncová periplazmatická doména T4 holinu váže periplazmatickou doménu T4 antiholinu (RI; 97 aas), která stejně jako holin jednou překlenuje membránu.[3] T-holin fága T4 tvoří komplex 1: 1 s inhibitorem RI, který blokuje agregaci a tvorbu pórů.[7]
Homologie
Fág T4 T-holin (lyzační protein ) je totožný s Holin z fága K3 a téměř identický s fágem ARI. Zbytky 35-96 jsou 28% identické se zbytky 436-495 K+ absorpční protein z Lactococcus lactis (gbAAK04721; TC # 2.A.72; KUP), což naznačuje evoluční vztah mezi holinem a transportérem. Holiny mají 1 až 4 TMS a krátký C-terminál doména bohatá na základní zbytky.
Viz také
Reference
- ^ Ramanculov, E .; Young, R. (01.04.2001). "Funkční analýza fága T4 holin v kontextu lambda". Molekulární genetika a genomika: MGG. 265 (2): 345–353. doi:10,1007 / s004380000422. ISSN 1617-4615. PMID 11361346. S2CID 40455691.
- ^ „1.E.8 Rodina T4 Holin (T4 Holin)“. Databáze klasifikace transportérů. Citováno 2016-03-26.
- ^ A b Tran, Tram Anh T .; Struck, Douglas K .; Young, Ry (10.10.2005). „Periplazmatické domény definují interakce holinu a antiholinu v inhibici lýzy t4“. Journal of Bacteriology. 187 (19): 6631–6640. doi:10.1128 / JB.187.19.6631-6640.2005. ISSN 0021-9193. PMC 1251592. PMID 16166524.
- ^ Ramanculov, E .; Young, R. (03.03.2001). "Genetická analýza holinu T4: načasování a topologie". Gen. 265 (1–2): 25–36. doi:10.1016 / s0378-1119 (01) 00365-1. ISSN 0378-1119. PMID 11255004.
- ^ Ramanculov, E .; Young, R. (01.08.2001). "Starodávný hráč odhalen: T4 rI kóduje specifický antiholin t". Molekulární mikrobiologie. 41 (3): 575–583. doi:10.1046 / j.1365-2958.2001.02491.x. ISSN 0950-382X. PMID 11532126. S2CID 25273199.
- ^ Miller, Eric S .; Kutter, Elizabeth; Mosig, Gisela; Arisaka, Fumio; Kunisawa, Takashi; Rüger, Wolfgang (01.03.2003). "Bacteriophage T4 genom". Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 67 (1): 86–156, obsah. doi:10.1128 / mmbr. 67.1.86-156.2003. ISSN 1092-2172. PMC 150520. PMID 12626685.
- ^ Moussa, Samir H .; Kuzněcov, Vladimír; Tran, Tram Anh T .; Sacchettini, James C .; Young, Ry (01.04.2012). "Proteinové determinanty inhibice lýzy fágového T4". Věda o bílkovinách. 21 (4): 571–582. doi:10.1002 / pro.2042. ISSN 1469-896X. PMC 3375757. PMID 22389108.
Další čtení
- Catalão MJ, Gil F, Moniz-Pereira J, São-José C, Pimentel M (2013). „Rozmanitost v systémech bakteriální lýzy: bakteriofágy ukazují cestu“. Recenze mikrobiologie FEMS. 37 (4): 554–571. doi:10.1111/1574-6976.12006. PMID 23043507.
- Moussa SH, Lawler JL, Young R (2014). "Genetická disekce lysie T4". Journal of Bacteriology. 196 (12): 2201–2209. doi:10.1128 / JB.01548-14. PMC 4054191. PMID 24706740.
- Saier MH, Reddy BL, Margolin W (2015). „Holins in Bacteria, Eukaryotes, and Archaea: Multifunctional Xenologues with Potential Biotechnological and Biomedical Applications“. Journal of Bacteriology. 197 (1): 7–17. doi:10.1128 / JB.02046-14. PMC 4288690. PMID 25157079.
- Tran TA, Struck DK, Young R (2005). „Periplazmatické domény definují interakce holinu a antiholinu při inhibici lýzy T4“. Journal of Bacteriology. 187 (19): 6631–6640. doi:10.1128 / JB.187.19.6631-6640.2005. PMC 1251592. PMID 16166524.
- Tran TA, Struck DK, Young R (2007). „T4 RI antiholin má doménu uvolnění kotvy signálu N-terminálu, která ji cílí na degradaci pomocí DegP“. Journal of Bacteriology. 189 (21): 7618–7625. doi:10.1128 / JB.00854-07. PMC 2168732. PMID 17693511.
- Wang I, Smith DL, Young R (2000). "Holins: The Protein Clocks of Bacteriophage Infection". Výroční přehled mikrobiologie. 54 (1): 799–825. doi:10,1146 / annurev.micro. 54.1.799. PMID 11018145.
Do tato úprava, tento článek používá obsah z „1.E.8 Rodina T4 Holin (T4 Holin)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.