TIMM50 - TIMM50

TIMM50
Identifikátory
Aliasy	TIMM50„TIM50, TIM50L, translokáza vnitřní mitochondriální membrány 50, MGCA9
Externí ID	OMIM: 607381 MGI: 1913775 HomoloGene: 57031 Genové karty: TIMM50
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	39,493,785 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	28,312,072 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita protein serin / threonin fosfatáza; • vazba na receptor interleukinu-2; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • aktivita protein tyrosin fosfatázy; • vazba ribonukleoproteinového komplexu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • jaderná skvrna; • membrána; • TIM23 mitochondriální import translokázového komplexu vnitřní membrány; • nukleoplazma; • mitochondrie; • mitochondriální vnitřní membrána; • buněčné jádro;
Biologický proces	• defosforylace bílkovin; • import proteinů do mitochondriální matrice; • transport bílkovin; • organizace mitochondriální membrány; • uvolňování cytochromu c z mitochondrií; • peptidyl-tyrosin defosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	92609
	66525
	ENSG00000105197
	ENSMUSG00000003438
	Q3ZCQ8
	Q9D880
	NM_001001563; NM_001329559
	NM_025616
	NP_001001563; NP_001316488; NP_001001563.1
	NP_079892
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Mitochondriální import vnitřní membránové translokázové podjednotky TIM50 je protein že u lidí je kódován TIMM50 gen. Tim50 je podjednotka translokázového komplexu Tim23 ve vnitřní mitochondriální membráně.^[5]^[6] Mutace v TIMM50 může vést k epilepsie, těžké mentální postižení a 3-methylglutakonová acidurie.^[7] TIMM50 exprese je zvýšena v buňkách rakoviny prsu^[8] a snížil se v hypertrofických srdcích.^[9]

Struktura

The TIMM50 Gen se nachází na rameni q chromozom 19 na pozici 13,2 a zabírá 13 373 párů bází.^[6] Gen produkuje 39,6 kDa protein složený z 353 aminokyseliny.^[10]^[11] Tento gen kóduje podjednotku TIM23 translokázový komplex vnitřní mitochondriální membrány, který zprostředkovává translokaci tranzitních proteinů obsahujících peptid přes mitochondriální vnitřní membrána.^[6]

Funkce

Protein Tim50 funguje jako receptorová podjednotka, která rozpoznává mitochondriální cílový signál nebo předvolbu na proteinovém nákladu, který je určen pro mitochondriální vnitřní membránu a matice. Tento gen v lidských buňkách vede k uvolňování cytochrom c a apoptóza.^[6] Tento protein hraje roli při udržování bariéry prostupnosti membrány. The mezimembránový prostor doména Tim50 indukuje uzavření translokačního póru kanálu TIM23.^[5]^[6]

Klinický význam

Missense mutace v TIMM50 často vedou k epilepsii nebo epileptickému záchvatu encefalopatie, závažné mentální postižení, variabilní deficit mitochondriálního komplexu V a 3-methylglutakonová acidurie, která je klíčovým biomarkerem defektů mitochondriální membrány a mitochondriální dysfunkce. Dědičnost TIMM50 je autosomálně recesivní.^[7] Exprese genu TIMM50 se zvyšuje v rakovina prsu buňky. V takových buňkách je nadměrná exprese proteinu Tim50 spojena s nedostatkem buněčné apoptózy a zvýšenou rychlostí proliferace.^[8] Snížení TIMM50 exprese v srdečních buňkách může vést k srdeční hypertrofie.^[9]

Byli představeni dva pacienti, sourozenci mužského a ženského pohlaví, kteří se narodili příbuzným beduínským rodičům, vykazující mimovolní abnormální pohyby, neprospívání, hypsarytmie, bilaterální optická atrofie, 3-methylglutakonová acidurie a mírně zvýšená plazma laktát úrovně. Oba začali chodit samostatně jen za 3 roky a zpočátku byli příznivě přijati ACTH terapie až do přechodu na léčbu Valproát buď Sabril nebo Topamax, což mělo za následek úplné vymizení záchvatů. Byli také představeni dva další pacienti, sourozenci mužského a ženského pohlaví, kteří se narodili rodičům muslimského původu bratranců prvního bratrance. EEG, atrofie mozku, opožděná psychomotorický vývoj a 3-methylglutakonová acidurie. Léčba Lamictal v kombinaci s valproátem bylo účinné při kontrole záchvatů.^[7]

Interakce

V komplexu TIM23 podjednotka Tim50 přímo interaguje s TIMM23. Komplex TIM23 interaguje s TIMM44 složka komplexu PAM a s DNAJC15. Izoforma Tim50 interaguje s CÍVKA a snRNP.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105197 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003438 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Yamamoto H, Esaki M, Kanamori T, Tamura Y, Nishikawa S, Endo T (listopad 2002). „TIM50 je podjednotka komplexu Tim23, která spojuje translokaci proteinů přes vnější a vnitřní mitochondriální membrány“. Buňka. 111 (4): 519–28. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 01053-X. PMID 12437925. S2CID 18869447.
^ ^A ^b ^C ^d ^E "Entrez Gene: TIMM50 translokáza vnitřní mitochondriální membrány 50 homolog (S. cerevisiae)".
^ ^A ^b ^C Shahrour MA, Staretz-Chacham O, Dayan D, Stephen J, Weech A, Damseh N a kol. (Květen 2017). „Mitochondriální epileptická encefalopatie, 3-methylglutakonová acidurie a variabilní deficit V komplexu spojený s mutacemi TIMM50“. Klinická genetika. 91 (5): 690–696. doi:10.1111 / cge.12855. PMID 27573165. S2CID 22348518.
^ ^A ^b Gao SP, Sun HF, Jiang HL, Li LD, Hu X, Xu XE, Jin W (leden 2016). „Ztráta TIM50 potlačuje proliferaci a vyvolává apoptózu u rakoviny prsu“. Biologie nádorů. 37 (1): 1279–87. doi:10.1007 / s13277-015-3878-0. PMID 26289846. S2CID 36502903.
^ ^A ^b Tang K, Zhao Y, Li H, Zhu M, Li W, Liu W a kol. (Duben 2017). „Translocase of the Inside Membrane 50 Functions as a Novel Ochranný regulátor patologické srdeční hypertrofie“. Journal of the American Heart Association. 6 (4): e004346. doi:10.1161 / JAHA.116.004346. PMC 5532988. PMID 28432072.
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
^ "Mitochondriální import vnitřní membránové translokázové podjednotky TIM50". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
^ „TIMM50 - mitochondriální import vnitřní membránové translokázové podjednotky předchůdce TIM50 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein TIMM50“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-25.

Další čtení

Xu H, Somers ZB, Robinson ML, Hebert MD (červenec 2005). „Tim50a, nukleární izoforma mitochondriálního Tim50, interaguje s proteiny zapojenými do biogeneze snRNP“. Buněčná biologie BMC. 6 (1): 29. doi:10.1186/1471-2121-6-29. PMC 1177934. PMID 16008839.
Guo Y, Cheong N, Zhang Z, De Rose R, Deng Y, Farber SA, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (červen 2004). „Tim50, součást mitochondriálního translokátoru, reguluje mitochondriální integritu a buněčnou smrt“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (23): 24813–25. doi:10,1074 / jbc.M402049200. PMID 15044455.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K a kol. (Únor 2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Přírodní buněčná biologie. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Yuryev A, Wennogle LP (únor 2003). „Nové interakce raf kináza-protein-protein nalezené vyčerpávající kvasinkovou dvouhybridní analýzou“. Genomika. 81 (2): 112–25. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 00008-3. PMID 12620389.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105197 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003438 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12437925-5] A ^b Yamamoto H, Esaki M, Kanamori T, Tamura Y, Nishikawa S, Endo T (listopad 2002). „TIM50 je podjednotka komplexu Tim23, která spojuje translokaci proteinů přes vnější a vnitřní mitochondriální membrány“. Buňka. 111 (4): 519–28. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 01053-X. PMID 12437925. S2CID 18869447.

[entrez-6] A ^b ^C ^d ^E "Entrez Gene: TIMM50 translokáza vnitřní mitochondriální membrány 50 homolog (S. cerevisiae)".

[Shahrour_2017-7] A ^b ^C Shahrour MA, Staretz-Chacham O, Dayan D, Stephen J, Weech A, Damseh N a kol. (Květen 2017). „Mitochondriální epileptická encefalopatie, 3-methylglutakonová acidurie a variabilní deficit V komplexu spojený s mutacemi TIMM50“. Klinická genetika. 91 (5): 690–696. doi:10.1111 / cge.12855. PMID 27573165. S2CID 22348518.

[Gao_2016-8] A ^b Gao SP, Sun HF, Jiang HL, Li LD, Hu X, Xu XE, Jin W (leden 2016). „Ztráta TIM50 potlačuje proliferaci a vyvolává apoptózu u rakoviny prsu“. Biologie nádorů. 37 (1): 1279–87. doi:10.1007 / s13277-015-3878-0. PMID 26289846. S2CID 36502903.

[Tang_2017-9] A ^b Tang K, Zhao Y, Li H, Zhu M, Li W, Liu W a kol. (Duben 2017). „Translocase of the Inside Membrane 50 Functions as a Novel Ochranný regulátor patologické srdeční hypertrofie“. Journal of the American Heart Association. 6 (4): e004346. doi:10.1161 / JAHA.116.004346. PMC 5532988. PMID 28432072.

[COPaKB-10] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.

[url_COPaKB-11] "Mitochondriální import vnitřní membránové translokázové podjednotky TIM50". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).

[12] „TIMM50 - mitochondriální import vnitřní membránové translokázové podjednotky předchůdce TIM50 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein TIMM50“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-25.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]