Senecavirus - Senecavirus

Senecavirus
3CJI Senecavirus.png
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Pisoniviricetes
Objednat:Picornavirales
Rodina:Picornaviridae
Rod:Senecavirus
Zadejte druh
Senecavirus A
Synonyma
  • Virus Seneca Valley
  • Virus Seneca Valley-001

Senecavirus je rod viry v pořadí Picornavirales, v rodině Picornaviridae. Prase a možná i kráva slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje pouze jeden druh v tomto rodu: druh typu Senecavirus A.[1][2] Senecavirus je replikačně kompetentní onkolytický pikornavirus. Má selektivní tropismus pro rakoviny s neuroendokrinními rysy včetně malobuněčného karcinomu plic (SCLC) a několik pediatrických solidních nádorů včetně retinoblastomu, neuroblastomu a medulloblastomu.[3] Fáze I klinické zkoušky Senecavirus u dospělých s neuroendokrinními nádory ukázalo, že senecavirus je zjevně bezpečný při podávání v dávkách až 1E11 vp / kg.[4]Má to potenciál antineoplastický aktivita.[5][6]

Struktura

Viry v Senecavirus jsou neobalené, s ikosahedrickou, sférickou a kulatou geometrií, se symetrií T = pseudo3. Průměr je kolem 30 nm. Genomy jsou lineární a nesegmentované, mají délku přibližně 7,3 kB.[1]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
SenecavirusIcosahedralPseudo T = 3NeobalenéLineárníMonopartitní

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne připojením viru k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají endocytózu. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou a viroporiny. Jako přirozený hostitel slouží prase a možná i kráva.[1]

Receptor viru Seneca Valley byl identifikován jako antraxový toxinový receptor 1.[7]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
SenecavirusPrasata, krávaOnkolytickýEndocytóza buněčných receptorůLyzaCytoplazmaCytoplazmaNeznámý

Taxonomie

Skupina: ssRNA (+)

[2]

Objev a původ

Kompletní sekvence genomu senecaviru byla dokončena v roce 2008.[8]

V roce 2012 byl hlášen infekční klon senecaviru.[9]

Senecavirus byl navržen k napadení rakovinných kmenových buněk.[10]

Proti senecaviru byly vytvořeny diagnostické monoklonální protilátky.[11]

Zatímco sekvence genomu kódujícího protein SVV je nejvíce podobná členům v Kardiovirus rod, nekódující RNA interní místo vstupu ribozomu (IRES) je nejvíce podobný těm z Pestivirus rod, včetně viru klasického moru prasat, a - Hepacivirus rod, včetně Virus hepatitidy C..[12]

RNA SVV IRES sdílí podobnosti v sekvenci, struktuře a funkci s virem IRES viru hepatitidy C. Subdoména IIa SVV a HCV IRES sdílí podobnou strukturu a funkci vazby ligandu, jak je vidět na její krystalové struktuře.[13] Tato oblast IIa subdomény je klasifikována jako přepínač RNA reagující na ligand, který přijímá dobře definované ligandové a vázané konformace bez rozbití nebo vytvoření jakýchkoli párů bází ve své sekundární struktuře po vzájemné přeměně mezi těmito dvěma stavy.[14] Tento přepínač RNA z SVV IRES byl začleněn do trojúhelníkových RNA nanostruktur.[15]

Klinické testy

Počáteční izolát je vyvíjen jako protinádorové léčivo virtuální společnost Neotropix, Inc. pod názvem NTX-010.

Fáze I

  • Studie bezpečnosti senecaviru u pacientů se solidními nádory s neuroendokrinními rysy.[16] Tato studie byla publikována v roce 2011 a data ukazují, že virus byl dobře tolerován 30 pacienty a byly pozorovány některé známky protinádorové aktivity. Údaje vyžadovaly další vyšetřování viru ve studii fáze II v roce 2006 malobuněčný karcinom plic.[4]

Fáze II

Replikace virů

Předpokládá se, že senecavirus se internalizuje internalizací zprostředkovanou receptorem, ale dosud nebyl identifikován žádný hostitelský receptor.

Viz také

Reference

  1. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  2. ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
  3. ^ Reddy, P. S .; Burroughs, K. D .; Hales, L. M .; Ganesh, S .; Jones, B. H .; Idamakanti, N .; Hay, C .; Li, S. S .; Skele, K. L .; Vasko, A. -J .; Yang, J .; Watkins, D. N .; Rudin, C. M .; Hallenbeck, P. L. (2007). „Virus v údolí Seneca, systémově dostupný onkolytický pikoravirus a léčba neuroendokrinních rakovin“. JNCI Journal of the National Cancer Institute. 99 (21): 1623–1633. doi:10.1093 / jnci / djm198. PMC  5261858. PMID  17971529.
  4. ^ A b Rudin CM, Poirier JT, Senzer NN, Stephenson J, Loesch D, Burroughs KD, Reddy PS, Hann CL, Hallenbeck PL (15. února 2011). „Fáze I klinické studie viru Seneca Valley (SVV-001), replikantně kompetentního pikoraviru, u pokročilých solidních nádorů s neuroendokrinními rysy“. Klinický výzkum rakoviny. 17 (4): 888–95. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-1706. PMC  5317273. PMID  21304001. Citováno 30. května 2013.
  5. ^ Národní onkologický institut Definice viru Seneca Valley-001. Národní onkologický institut Citováno 2008-10-09.
  6. ^ Morton CL, Houghton PJ, Kolb EA a kol. (Srpen 2010). „Počáteční testování replikačně kompetentního viru Seneca Valley (NTX-010) pediatrickým předklinickým testovacím programem“. Pediatrická rakovina krve. 55 (2): 295–303. doi:10,1002 / pbc.22535. PMC  3003870. PMID  20582972.
  7. ^ Miles LA, Burga LN, Gardner EE, Bostina M, Poirier JT, Rudin CM (2017) Toxinový receptor 1 Anthrax je buněčný receptor pro virus v údolí Seneca. J Clin Invest
  8. ^ Hales, L. M .; Knowles, N.J .; Reddy, P. S .; Xu, L .; Hay, C .; Hallenbeck, P. L. (2008). „Kompletní analýza sekvence genomu viru Seneca Valley-001, nového onkolytického pikornaviru“. Journal of General Virology. 89 (5): 1265–1275. doi:10.1099 / vir.0.83570-0. PMID  18420805.
  9. ^ Poirier, J. T .; Reddy, P. S .; Idamakanti, N .; Li, S. S .; Stump, K.L .; Burroughs, K. D .; Hallenbeck, P.L .; Rudin, C. M. (2012). „Charakterizace infekčního klonu cDNA plné délky a reportérového derivátu GFP onkolytického pikornaviru SVV-001“. Journal of General Virology. 93 (Pt 12): 2606–2613. doi:10.1099 / vir.0.046011-0. PMID  22971818.
  10. ^ Friedman, G. K .; Cassady, K. A .; Beierle, E. A .; Markert, J. M .; Gillespie, G. Y. (2012). „Cílení na dětské rakovinné kmenové buňky onkolytickou viroterapií“. Pediatrický výzkum. 71 (4–2): 500–510. doi:10.1038 / pr.2011.58. PMC  3607376. PMID  22430386.
  11. ^ Yang, M .; Van Bruggen, R .; Xu, W. (2011). "Generování a diagnostická aplikace monoklonálních protilátek proti viru Seneca Valley". Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 24 (1): 42–50. doi:10.1177/1040638711426323. PMID  22362934.
  12. ^ Willcocks, M. M .; Locker, N .; Gomwalk, Z .; Royall, E .; Bakhshesh, M .; Belsham, G. J .; Idamakanti, N .; Burroughs, K. D .; Reddy, P. S .; Hallenbeck, P.L .; Roberts, L. O. (2011). „Strukturální rysy prvku pro vstup do vnitřního ribozomu viru v údolí Seneca (IRES): Pikornavirus s IRES podobným pestivirům“. Journal of Virology. 85 (9): 4452–4461. doi:10.1128 / JVI.01107-10. PMC  3126232. PMID  21325406.
  13. ^ Boerneke, Mark; Dibrov, Sergey; Gu, Jing; Wyles, David; Hermann, Thomas (11. listopadu 2014). „Funkční ochrana navzdory strukturální divergenci v přepínačích RNA reagujících na ligand“. Proc Natl Acad Sci U S A. 111 (45): 15952–7. Bibcode:2014PNAS..11115952B. doi:10.1073 / pnas.1414678111. PMC  4234586. PMID  25349403.
  14. ^ Boerneke, Mark; Hermann, Thomas (srpen 2015). "Mechanické spínače RNA reagující na ligand". RNA Biology. 12 (8): 780–786. doi:10.1080/15476286.2015.1054592. PMC  4615790. PMID  26158858.
  15. ^ Boerneke, Mark; Dibrov, Sergey; Hermann, Thomas (23. února 2016). „Návrh krystalicky strukturovaných samomontážních RNA nanotrianglů“. Angew Chem Int Ed Engl. 55 (12): 4097–100. doi:10.1002 / anie.201600233. PMC  4824544. PMID  26914842.
  16. ^ „Studie bezpečnosti viru Seneca Valley u pacientů se solidními nádory s neuroendokrinními vlastnostmi“.
  17. ^ „Virus Seneca Valley-001 po chemoterapii při léčbě pacientů s malobuněčným karcinomem plic v rozsáhlém stadiu“.
  18. ^ „Virus Seneca Valley-001 a cyklofosfamid při léčbě mladých pacientů s relabujícím nebo refrakterním neuroblastomem, rhabdomyosarkomem nebo vzácnými nádory s neuroendokrinními rysy“.

externí odkazy