Salasvirus - Salasvirus

Salasvirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Duplodnaviria
Království:Heunggongvirae
Kmen:Uroviricota
Třída:Caudoviricetes
Objednat:Caudovirales
Rodina:Podoviridae
Podčeleď:Picovirinae
Rod:Salasvirus
Zadejte druh
Virus Bacillus phi29

Salasvirus (synonyma Fágy podobné Phi29, Viry podobné Phi29, Phi29likevirus) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Podoviridae, v podčeledi Picovirinae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existují čtyři druhy tohoto rodu, včetně druhů druhů Virus Bacillus phi29.[1][2][3]

Taxonomie

Skupina: dsDNA

[2]

Struktura

Salasviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava má symetrii T = 3, Q = 5 a je přibližně 45 nm x 54 nm. Ocas je nestahovatelný a má límec s dvanácti přídavky.[1]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
SalasvirusHlava-ocasT = 3, Q = 5NeobalenéLineárníMonopartitní

Genom

Genomy jsou lineární o délce přibližně 20 kB.[1] Tři ze čtyř genomů virů byly plně sekvenovány a jsou k dispozici na webových stránkách NCBI. Pohybují se v rozmezí 18 až 22 tisíc nukleotidů s 17 až 35 proteiny. K dispozici jsou kompletní genomy tady[3]

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se pomocí ocasních vláken váže na receptory adheze hostitelských buněk a vylučuje virovou DNA do periplazmy hostitele. Replikace sleduje model vytěsnění řetězce DNA. Transkripce založená na DNA je metoda transkripce. Jakmile je virová DNA replikována, procapsid je sestaven a zabalen a ocas je sestaven. Nakonec se zralé viriony uvolní pomocí lýzy. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
SalasvirusBakterieŽádnýInjekceLyzaCytoplazmaCytoplazmaPasivní difúze

Dějiny

Podle ICTV rod Phi29likevirus byl poprvé přijat pod jménem phi29 podobné fágy v 1996, přiřazeno pouze rodině Podoviridae. Rodina byla přesunuta do nově vytvořeného řádu Caudovirales v roce 1998. V roce 1999 ICTV sedmá zpráva přejmenoval rod na viry podobné phi29. Rod byl přesunut do nově vytvořené podskupiny Picovirinae v roce 2009 a znovu přejmenován na 2012, tentokrát k Phi29likevirus[4] Rod byl později přejmenován na Salasvirus.

Reference

  1. ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
  2. ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 1. července 2015.
  3. ^ A b NCBI. „Phi29likevirus Complete Genomes“. Citováno 17. února 2015.
  4. ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2013 Release“. Citováno 17. února 2015.

externí odkazy