Salasvirus - Salasvirus
| Salasvirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Podoviridae |
| Podčeleď: | Picovirinae |
| Rod: | Salasvirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Bacillus phi29 | |
Salasvirus (synonyma Fágy podobné Phi29, Viry podobné Phi29, Phi29likevirus) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Podoviridae, v podčeledi Picovirinae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existují čtyři druhy tohoto rodu, včetně druhů druhů Virus Bacillus phi29.[1][2][3]
Taxonomie
Skupina: dsDNA
- Rodina: Podoviridae
- Podrodina: Picovirinae
Struktura
Salasviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava má symetrii T = 3, Q = 5 a je přibližně 45 nm x 54 nm. Ocas je nestahovatelný a má límec s dvanácti přídavky.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Salasvirus | Hlava-ocas | T = 3, Q = 5 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Genom
Genomy jsou lineární o délce přibližně 20 kB.[1] Tři ze čtyř genomů virů byly plně sekvenovány a jsou k dispozici na webových stránkách NCBI. Pohybují se v rozmezí 18 až 22 tisíc nukleotidů s 17 až 35 proteiny. K dispozici jsou kompletní genomy tady[3]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se pomocí ocasních vláken váže na receptory adheze hostitelských buněk a vylučuje virovou DNA do periplazmy hostitele. Replikace sleduje model vytěsnění řetězce DNA. Transkripce založená na DNA je metoda transkripce. Jakmile je virová DNA replikována, procapsid je sestaven a zabalen a ocas je sestaven. Nakonec se zralé viriony uvolní pomocí lýzy. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Salasvirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Dějiny
Podle ICTV rod Phi29likevirus byl poprvé přijat pod jménem phi29 podobné fágy v 1996, přiřazeno pouze rodině Podoviridae. Rodina byla přesunuta do nově vytvořeného řádu Caudovirales v roce 1998. V roce 1999 ICTV sedmá zpráva přejmenoval rod na viry podobné phi29. Rod byl přesunut do nově vytvořené podskupiny Picovirinae v roce 2009 a znovu přejmenován na 2012, tentokrát k Phi29likevirus[4] Rod byl později přejmenován na Salasvirus.
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b NCBI. „Phi29likevirus Complete Genomes“. Citováno 17. února 2015.
- ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2013 Release“. Citováno 17. února 2015.