Picovirinae - Picovirinae - Wikipedia

Picovirinae
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Duplodnaviria
Království:Heunggongvirae
Kmen:Uroviricota
Třída:Caudoviricetes
Objednat:Caudovirales
Rodina:Podoviridae
Podčeleď:Picovirinae
Rody[1]
Synonyma[2]
  • Nanovirinae

Picovirinae je podčeleď viry v pořadí Caudovirales, v rodině Podoviridae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje devět druhů v této podčeledi, rozdělených mezi 3 rody, přičemž dva z těchto druhů nejsou přiřazeny k rodu.[3][4]

Taxonomie

Rozpoznávají se tyto rody:[4]

Následující druhy nejsou přiřazeny k rodu:[4]

Bylo zjištěno, že dva bakteriofágy v této rodině infikují a lyžují Clostridium perfringens.[5] Další virus (Weissella phage phiYS61), který byl izolován, je tak odlišný od známých členů, že může patřit do nového rodu.[6]

Struktura

Viry v Picovirinae jsou neobalené, s ikosahedrickými nebo prolátovými hlavami o průměru asi 50–55 nm a krátkými ocasy. Genomy jsou lineární dvouvláknová DNA a jsou relativně malé (mezi 16–20 kbp) - odtud termín pico-virinae. Picoviry se skládají z lineárních monomerních genomů s terminálním proteinem kovalentně připojeným ke každému konci.[3]

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne adsorpcí do hostitelské buňky. Replikace sleduje model vytěsnění řetězce DNA. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[3] Používají také typický základní protein DNA polymeráza pro replikaci vlastnost sdílená s rodinou Tectiviridae.[Citace je zapotřebí ]

Reference

  1. ^ „Mezinárodní výbor pro taxonomii virů“. ictvonline.org. Virologická divize IUMS. 2014. Citováno 14. srpna 2014.
  2. ^ Lavigne, R .; Seto, D .; Mahadevan, P .; Ackermann, H. W .; Kropinki, A. M. (2008). „Sjednocení klasické a molekulární taxonomické klasifikace: analýza Podoviridae pomocí nástrojů založených na BLASTP“. Výzkum v mikrobiologii. 159 (5): 406–14. doi:10.1016 / j.resmic.2008.03.005. PMID  18555669.
  3. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
  4. ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 4. května 2020.
  5. ^ Volozhantsev NV, Oakley BB, Morales CA, Verevkin VV, Bannov VA, Krasilnikova VM, Popova AV, Zhilenkov EL, Garrish JK, Schegg KM, Woolsey R, Quilici DR, linka JE, Hiett KL, Siragusa GR, Svetoch EA, Seal BS (2012). "Molekulární charakterizace podovirových bakteriofágů virulentních pro Clostridium perfringens a jejich srovnání s členy Picovirinae “. PLOS One. 7 (5): e38283. Bibcode:2012PLoSO ... 738283V. doi:10.1371 / journal.pone.0038283. PMC  3362512. PMID  22666499.
  6. ^ Kleppen HP, Holo H, Jeon SR, Nes IF, Yoon SS (2012). "Nové bakteriofágy čeledi Podoviridae Weissella cibaria izolovaný od Kimchi ". Appl. Environ. Microbiol. 78 (20): 7299–308. doi:10.1128 / AEM.00031-12. PMC  3457107. PMID  22885743.

externí odkazy