Picovirinae - Picovirinae - Wikipedia
| Picovirinae | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Podoviridae |
| Podčeleď: | Picovirinae |
| Rody[1] | |
| Synonyma[2] | |
| |
Picovirinae je podčeleď viry v pořadí Caudovirales, v rodině Podoviridae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje devět druhů v této podčeledi, rozdělených mezi 3 rody, přičemž dva z těchto druhů nejsou přiřazeny k rodu.[3][4]
Taxonomie
Rozpoznávají se tyto rody:[4]
- Cepunavirus (dříve Cp1virus, s druhy Streptokokový virus Cp1 aka Complutense fág 1, Cp-1)
- Negarvirus
- Salasvirus
Následující druhy nejsou přiřazeny k rodu:[4]
Bylo zjištěno, že dva bakteriofágy v této rodině infikují a lyžují Clostridium perfringens.[5] Další virus (Weissella phage phiYS61), který byl izolován, je tak odlišný od známých členů, že může patřit do nového rodu.[6]
Struktura
Viry v Picovirinae jsou neobalené, s ikosahedrickými nebo prolátovými hlavami o průměru asi 50–55 nm a krátkými ocasy. Genomy jsou lineární dvouvláknová DNA a jsou relativně malé (mezi 16–20 kbp) - odtud termín pico-virinae. Picoviry se skládají z lineárních monomerních genomů s terminálním proteinem kovalentně připojeným ke každému konci.[3]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne adsorpcí do hostitelské buňky. Replikace sleduje model vytěsnění řetězce DNA. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[3] Používají také typický základní protein DNA polymeráza pro replikaci vlastnost sdílená s rodinou Tectiviridae.[Citace je zapotřebí ]
Reference
- ^ „Mezinárodní výbor pro taxonomii virů“. ictvonline.org. Virologická divize IUMS. 2014. Citováno 14. srpna 2014.
- ^ Lavigne, R .; Seto, D .; Mahadevan, P .; Ackermann, H. W .; Kropinki, A. M. (2008). „Sjednocení klasické a molekulární taxonomické klasifikace: analýza Podoviridae pomocí nástrojů založených na BLASTP“. Výzkum v mikrobiologii. 159 (5): 406–14. doi:10.1016 / j.resmic.2008.03.005. PMID 18555669.
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 4. května 2020.
- ^ Volozhantsev NV, Oakley BB, Morales CA, Verevkin VV, Bannov VA, Krasilnikova VM, Popova AV, Zhilenkov EL, Garrish JK, Schegg KM, Woolsey R, Quilici DR, linka JE, Hiett KL, Siragusa GR, Svetoch EA, Seal BS (2012). "Molekulární charakterizace podovirových bakteriofágů virulentních pro Clostridium perfringens a jejich srovnání s členy Picovirinae “. PLOS One. 7 (5): e38283. Bibcode:2012PLoSO ... 738283V. doi:10.1371 / journal.pone.0038283. PMC 3362512. PMID 22666499.
- ^ Kleppen HP, Holo H, Jeon SR, Nes IF, Yoon SS (2012). "Nové bakteriofágy čeledi Podoviridae Weissella cibaria izolovaný od Kimchi ". Appl. Environ. Microbiol. 78 (20): 7299–308. doi:10.1128 / AEM.00031-12. PMC 3457107. PMID 22885743.