SORBS1 - SORBS1 - Wikipedia

SORBS1
Protein SORBS1 PDB 2dl3.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySORBS1, CAP, FLAF2, R85FL, SH3D5, SH3P12, SORB1, sorbin a SH3 doména obsahující 1
Externí IDOMIM: 605264 MGI: 700014 HomoloGene: 83252 Genové karty: SORBS1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 10 (lidský)
Chr.Chromozom 10 (lidský)[1]
Chromozom 10 (lidský)
Genomické umístění pro SORBS1
Genomické umístění pro SORBS1
Kapela10q24.1Start95,311,771 bp[1]
Konec95,561,414 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE SORBS1 211705 s na fs.png

PBB GE SORBS1 211819 s na fs.png

PBB GE SORBS1 218087 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

10580

20411

Ensembl

ENSG00000095637

ENSMUSG00000025006

UniProt

Q9BX66

Q62417

RefSeq (mRNA)

NM_001034962
NM_001034963
NM_001034964
NM_009166
NM_178362

RefSeq (protein)

NP_001030134
NP_001030135
NP_001030136
NP_033192
NP_848139

Místo (UCSC)Chr 10: 95,31 - 95,56 MbChr 19: 40,29 - 40,51 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

CAP / Ponsin protein, také známý jako Sorbin a protein obsahující doménu SH3 1 je protein že u lidí je kódován SORBS1 gen.[5][6][7] CAP / Ponsin je součástí malé rodiny adaptorových proteinů, které regulují buněčná adheze, růstový faktor signalizace a cytoskeletální formace. CAP / Ponsin je vyjádřen hlavně v srdce, kosterní sval, játra, tukové tkáň a makrofágy; ve pruhované svalové tkáni je lokalizován CAP / Ponsin costamere struktur.

Struktura

CAP / Ponsin může existovat jako třináct alternativně sestřižených izoforem v rozmezí od 81 kDa do 142 kDa.[8] CAP / Ponsin je součástí rodiny adaptačních proteinů ArgBP2 a vinexin jsou také součástí.[9] Tyto proteiny obsahují doménu konzervované sorbinové homologie (SOHO) a tři SH3 domény a CAP / Ponsin je vyjádřen v srdce, kosterní sval, játra, tukové tkáň a makrofágy.[8][10][11]

Funkce

Ve svalech hraje CAP / Ponsin roli při tvorbě dospělých náklady z ohnisková adheze kontakty podobné při montáži kontraktilní aparát, protože nadměrná exprese CAP / Ponsin narušila normální morfologii kontaktu buněčné matrice.[12] V myším modelu viru myokarditida kvůli Coxsackievirus infekce, antivirový typ I stabilizovaný CAP / Ponsin interferon výroby a byl proti apoptóza a cytotoxicita.[13] CAP / Ponsin se také ukázal být hlavním regulátorem inzulín -stimulovaná signalizace a regulace absorpce glukózy potencováním inzulín -indukovaný fosforylace a nábor CBL do a lipidový vor signalizační komplex zahrnující flotillin.[14] Role pro CAP / Ponsin v makrofág funkce byla osvětlena zjištěním, že myši ukrývají SORBS1- nedostatečné makrofágy v kostní dřeň byl ochranný proti stravě s vysokým obsahem tuku rezistence na inzulín a ukázal se snížený zánět.[11] V nesvalových buňkách CAP / Ponsin inhibuje šíření buněk a ohnisková adheze obrat, jako jeho siRNA zprostředkovaný knockdown vyústil ve vylepšený PAK /MEK /ERK aktivace a migrace buněk.[15]

Klinický význam

Bylo prokázáno, že CAP / Ponsin je v konečné fázi down-regulován srdeční selhání pacientů; účinek, který byl obnoven po mechanickém vyložení.[12] A polymorfismus jednoho nukleotidu v SORBS1 bylo zjištěno, že je spojen s cukrovka typu 2 a obezita.[16]

Interakce

SORBS1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095637 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025006 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C Mandai K, Nakanishi H, Satoh A, Takahashi K, Satoh K, Nishioka H, ​​Mizoguchi A, Takai Y (březen 1999). „Ponsin / SH3P12: protein vázající l-afadin a vinculin lokalizovaný na spojích adherens buňka-buňka a buněčná matice“. The Journal of Cell Biology. 144 (5): 1001–17. doi:10.1083 / jcb.144.5.1001. PMC  2148189. PMID  10085297.
  6. ^ A b Baumann CA, Ribon V, Kanzaki M, Thurmond DC, Mora S, Shigematsu S, Bickel PE, Pessin JE, Saltiel AR (září 2000). „CAP definuje druhou signální cestu potřebnou pro transport glukózy stimulované inzulínem“ (PDF). Příroda. 407 (6801): 202–7. doi:10.1038/35025089. hdl:2027.42/62940. PMID  11001060. S2CID  4334519.
  7. ^ „Entrez Gene: SORBS1 sorbin a SH3 doména obsahující 1“.
  8. ^ A b Lin WH, Huang CJ, Liu MW, Chang HM, Chen YJ, Tai TY, Chuang LM (květen 2001). „Klonování, mapování a charakterizace humánního sorbinu a genu SH3 obsahujícího 1 (SORBS1): protein spojený s c-Abl během inzulínové signalizace v buněčné linii hepatomu Hep3B“. Genomika. 74 (1): 12–20. doi:10.1006 / geno.2001.6541. PMID  11374898.
  9. ^ Kioka N, Ueda K, Amachi T (únor 2002). „Vinexin, CAP / ponsin, ArgBP2: nová rodina adaptorových proteinů regulujících cytoskeletální organizaci a signální transdukci“. Funkce buněčné struktury. 27 (1): 1–7. doi:10.1247 / csf.27.1. PMID  11937713.
  10. ^ Ribon V, Printen JA, Hoffman NG, Kay BK, Saltiel AR (únor 1998). „Nový, multifunkční protein vázající c-Cbl v signalizaci inzulínového receptoru v adipocytech 3T3-L1“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (2): 872–9. doi:10,1128 / mcb.18.2.872. PMC  108798. PMID  9447983.
  11. ^ A b Lesniewski LA, Hosch SE, Neels JG, de Luca C, Pashmforoush M, Lumeng CN, Chiang SH, Scadeng M, Saltiel AR, Olefsky JM (duben 2007). „Delece Cap genů specifická pro kostní dřeň chrání před inzulinovou rezistencí vyvolanou stravou s vysokým obsahem tuku“. Přírodní medicína. 13 (4): 455–62. doi:10,1038 / nm1550. PMID  17351624. S2CID  22210202.
  12. ^ A b C Gehmlich K, Pinotsis N, Hayess K, van der Ven PF, Milting H, El Banayosy A, Körfer R, Wilmanns M, Ehler E, Fürst DO (červen 2007). "Paxillin a ponsin interagují v rodících se kostamerách svalových buněk". Journal of Molecular Biology. 369 (3): 665–82. doi:10.1016 / j.jmb.2007.03.050. PMID  17462669.
  13. ^ Valaperti A, Nishii M, Liu Y, Yang H, Naito K, Liu PP, Eriksson U (květen 2014). „Adaptérový protein spojený s c-Cbl (CAP) chrání před akutní myokarditidou zprostředkovanou CVB3 stabilizací produkce interferonu typu I a sníženou cytotoxicitou.“ (PDF). Základní výzkum v kardiologii. 109 (3): 411. doi:10.1007 / s00395-014-0411-3. PMID  24763933. S2CID  23062795.
  14. ^ Baumann CA, Ribon V, Kanzaki M, Thurmond DC, Mora S, Shigematsu S, Bickel PE, Pessin JE, Saltiel AR (září 2000). „CAP definuje druhou signální cestu potřebnou pro transport glukózy stimulované inzulínem“ (PDF). Příroda. 407 (6801): 202–7. doi:10.1038/35025089. hdl:2027.42/62940. PMID  11001060. S2CID  4334519.
  15. ^ Zhang M, Liu J, Cheng A, Deyoung SM, Chen X, Dold LH, Saltiel AR (listopad 2006). „CAP interaguje s cytoskeletálními proteiny a reguluje aktivaci a motilitu zprostředkovanou adhezí ERK“. Časopis EMBO. 25 (22): 5284–93. doi:10.1038 / sj.emboj.7601406. PMC  1636617. PMID  17082770.
  16. ^ Lin WH, Chiu KC, Chang HM, Lee KC, Tai TY, Chuang LM (srpen 2001). „Molekulární skenování lidského sorbinu a genu obsahujícího SH3-doménu-1 (SORBS1): pozitivní asociace polymorfismu T228A s obezitou a diabetem 2. typu“. Lidská molekulární genetika. 10 (17): 1753–60. doi:10,1093 / hmg / 10.17.1753. PMID  11532984.
  17. ^ A b Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (květen 2004). „Nábor Pyk2 a Cbl na lipidové rafty zprostředkovává signály důležité pro reorganizaci aktinu v rostoucích neuritech“. Journal of Cell Science. 117 (Pt 12): 2557–68. doi:10.1242 / jcs.01148. PMID  15128873.
  18. ^ A b Vandenbroere I, Paternotte N, Dumont JE, Erneux C, Pirson I (leden 2003). „Protein asociovaný s c-Cbl a c-Cbl jsou dva noví partneři inositol polyfosfát 5-fosfatázy SHIP2 obsahující SH2“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 300 (2): 494–500. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 02894-2. PMID  12504111.
  19. ^ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (červenec 2001). „Doména homologie sorbinu: motiv pro cílení proteinů na lipidové rafty“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (16): 9098–103. doi:10.1073 / pnas.151252898. PMC  55379. PMID  11481476.
  20. ^ Xie J, Cai T, Zhang H, Lan MS, Notkins AL (červenec 2002). „Transkripční faktor INSM1 se zinkovým prstem je exprimován během vývoje embrya a interaguje s proteinem spojeným s Cbl.“. Genomika. 80 (1): 54–61. doi:10.1006 / geno.2002.6800. PMC  1237014. PMID  12079283.

Další čtení