SDHAF2 - SDHAF2
Faktor sestavení komplexu sukcinát dehydrogenázy 2, dříve známý jako SDH5 a také známý jako Faktor montáže SDH 2 nebo SDHAF2 je protein že u lidí je kódován SDHAF2 gen. Tento gen kóduje a mitochondriální protein potřebný k dochucení a komplex sukcinát dehydrogenázy podjednotka požadovaná pro činnost komplexu. Mutace v tomto genu jsou spojeny s feochromocytom a paraganglioma.[5]
Struktura
SDHAF2 se nachází na q rameno z Chromozom 11 na pozici 12,2 a zabírá 16 642 párů bází.[5] The SDHAF2 Gen produkuje 6,7 kDa protein složený ze 65 aminokyselin.[6][7] Tento vysoce konzervovaný protein je kofaktorem flavin adenin dinukleotid (FAD).[8] Struktura představuje svazek pěti šroubovic s oblastí dobře definovaných konzervovaných povrchových zbytků. Tato konzervovaná oblast zahrnuje záporně nabitý obvod a kladně nabitý povrch a náplast, která je hydrofobní. Tento region se nachází v α-šroubovice I, II a spojovací pásmo.[9]
Funkce
The SDHAF2 gen kóduje mitochondriální protein spojené s komplex sukcinát dehydrogenázy (SDH) (mitochondriální komplex II) v mitochondriální dýchací řetězec, který hraje zásadní roli jak v řetězci transportu elektronů, tak v Krebsův (kyselina trikarboxylová) cyklus. SDHAF2 je nedílnou součástí správné funkce SDH komplex, hlavně v dýchání závislém na SDH, a interaguje s katalytickou podjednotkou komplexu. SDHAF2 se podílí na ochucení SDH1 (SDHA), další podjednotka SDH komplex. Činí tak začleněním flavin adenin dinukleotid (FAD) kofaktor do SDHA. Taková příchuť je nutná pro plně funkční SDH komplex. Vyřazení SDHAF2 vede ke ztrátě funkce SDH komplex, snížení stability komplexu enzymů a podstatné snížení všech podjednotek. Bylo také zjištěno, že SDHAF2 funguje jako a supresor nádoru.[10][11][12][13]
Klinický význam
SDHAF2 je gen potlačující nádor. Ústavní mutace v této genové příčině dědičný paraganglioma, neuroendokrinní nádor, o kterém se dříve vědělo, že je spojen s mutacemi podjednotky SDH. paraganglioma je nádor neurální lišty obvykle odvozený od chemoreceptor tkáň a paraganglion a mohou se vyvíjet na různých místech těla, včetně hlavy, krku, hrudník a břicho. Nejčastěji se nacházejí v oblasti hlavy a krku, konkrétně u karotická bifurkace, krční foramen, vagový nerv a v střední ucho.[14] Fenotypy zahrnují nadměrné množství katecholamin indukovaný hypertenze, dysfunkce hlavních krevních cév a lebeční nervy, významné nemocnost, pocení, a bušení srdce. V případech lokalizace nadledvin se může nádor otočit metastazující a agresivní. Ztráta SDH komplex je známo, že tato funkce je odpovědná za paraganglioma.[12][11][10] Mutace v tomto genu se nacházejí v DNA pouze malá část pacientů s tímto onemocněním.[11]
Interakce
SDHAF2 interaguje s SDHA v katalytickém dimeru SDH. Navíc SDHA, SDHAF2 má 17 interakce protein-protein, včetně interakcí s proteiny, jako jsou IMMT, SUCLG2, UBINEDDSUMO1, SSX2IP, a další.[15]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167985 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024668 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b "Entrez Gene: Succinate dehydrogenase complex assembly factor 2".
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ Yao, Daniel. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-07-23.
- ^ Starker LF, Delgado-Verdugo A, Udelsman R, Björklund P, Carling T (prosinec 2010). "Exprese a somatické mutace SDHAF2 (SDH5), nového endokrinního tumor supresorového genu v příštítných tělísek primární hyperparatyreózy". Endokrinní. 38 (3): 397–401. doi:10.1007 / s12020-010-9399-0. PMID 20972721. S2CID 25914943.
- ^ Eletsky A, Jeong MY, Kim H, Lee HW, Xiao R, Pagliarini DJ, Prestegard JH, Winge DR, Montelione GT, Szyperski T (říjen 2012). „Roztoková NMR struktura kvasinkového sukcinátdehydrogenázového flavinylačního faktoru Sdh5 odhaluje domnělé vazebné místo Sdh1“. Biochemie. 51 (43): 8475–7. doi:10.1021 / bi301171u. PMC 3667956. PMID 23062074.
- ^ A b Hao HX, Khalimonchuk O, Schraders M, Dephoure N, Bayley JP, Kunst H, Devilee P, Cremers CW, Schiffman JD, Bentz BG, Gygi SP, Winge DR, Kremer H, Rutter J (srpen 2009). „SDH5, gen potřebný k ochucení sukcinátdehydrogenázy, je mutován v paragangliomu“. Věda. 325 (5944): 1139–42. Bibcode:2009Sci ... 325.1139H. doi:10.1126 / science.1175689. PMC 3881419. PMID 19628817.
- ^ A b C Bayley JP, Kunst HP, Cascon A, Sampietro ML, Gaal J, Korpershoek E, Hinojar-Gutierrez A, Timmers HJ, Hoefsloot LH, Hermsen MA, Suárez C, Hussain AK, Vriends AH, Hes FJ, Jansen JC, Tops CM, Corssmit EP, de Knijff P, Lenders JW, Cremers CW, Devilee P, Dinjens WN, de Krijger RR, Robledo M (duben 2010). "SDHAF2 mutace v rodinném a sporadickém paragangliomu a feochromocytomu". Lancet. Onkologie. 11 (4): 366–72. doi:10.1016 / S1470-2045 (10) 70007-3. PMID 20071235.
- ^ A b Kugelberg J, Welander J, Schiavi F, Fassina A, Bäckdahl M, Larsson C, Opocher G, Söderkvist P, Dahia PL, Neumann HP, Gimm O (březen 2014). „Role SDHAF2 a SDHD u feochromocytomů souvisejících s von Hippel-Lindau“. World Journal of Surgery. 38 (3): 724–32. doi:10.1007 / s00268-013-2373-2. PMID 24322175. S2CID 11895429.
- ^ Pagon RA, Adam MP, Ardinger HH a kol. (1993). „Hereditary Paraganglioma-Pheochromocytoma Syndromes“. PMID 20301715. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ „SDHAF2 - sukcinátdehydrogenáza, montážní faktor 2, mitochondriální“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-18.
- ^ Kerrien S, Alam-Faruque Y, Aranda B, Bancarz I, Bridge A, Derow C, Dimmer E, Feuermann M, Friedrichsen A, Huntley R, Kohler C, Khadake J, Leroy C, Liban A, Lieftink C, Montecchi-Palazzi L, Orchard S, Risse J, Robbe K, Roechert B, Thorneycroft D, Zhang Y, Apweiler R, Hermjakob H (leden 2007). „IntAct - zdroj otevřeného zdroje pro data molekulární interakce“. Výzkum nukleových kyselin. 35 (Problém s databází): D561-5. CiteSeerX 10.1.1.279.8196. doi:10.1093 / nar / gkl958. PMC 1751531. PMID 17145710.
Další čtení
- Baysal BE, Farr JE, Rubinstein WS, Galus RA, Johnson KA, Aston CE, Myers EN, Johnson JT, Carrau R, Kirkpatrick SJ, Myssiorek D, Singh D, Saha S, Gollin SM, Evans GA, James MR, Richard CW (Leden 1997). „Jemné mapování otisknutého genu pro familiární nechromafinové paragangliomy na chromozomu 11q23“. American Journal of Human Genetics. 60 (1): 121–32. PMC 1712548. PMID 8981955.
- Gaal J, Burnichon N, Korpershoek E, Roncelin I, Bertherat J, Plouin PF, de Krijger RR, Gimenez-Roqueplo AP, Dinjens WN (březen 2010). „Mutace izocitrátdehydrogenázy jsou u feochromocytomů a paragangliomů vzácné“. The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 95 (3): 1274–8. doi:10.1210 / jc.2009-2170. PMID 19915015.
- Mariman EC, van Beersum SE, Cremers CW, Struycken PM, Ropers HH (leden 1995). „Jemné mapování předpokládaného otisku genu pro familiární nechromafinové paragangliomy na chromozom 11q13.1: důkaz genetické heterogenity“. Genetika člověka. 95 (1): 56–62. doi:10.1007 / bf00225075. hdl:2066/22047. PMID 7814027. S2CID 2324475.
- Kunst HP, Rutten MH, de Mönnink JP, Hoefsloot LH, Timmers HJ, Marres HA, Jansen JC, Kremer H, Bayley JP, Cremers CW (leden 2011). „SDHAF2 (PGL2-SDH5) a dědičný paraganglioma hlavy a krku“. Klinický výzkum rakoviny. 17 (2): 247–54. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-0420. PMID 21224366.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.