SDHAF1 - SDHAF1

SDHAF1
Identifikátory
AliasySDHAF1, LYRM8, faktor sestavy komplexu sukcinát dehydrogenázy 1
Externí IDOMIM: 612848 MGI: 1915582 HomoloGene: 67970 Genové karty: SDHAF1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 19 (lidský)
Chr.Chromozom 19 (lidský)[1]
Chromozom 19 (lidský)
Genomické umístění pro SDHAF1
Genomické umístění pro SDHAF1
Kapela19q13.12Start35,995,199 bp[1]
Konec35,996,315 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

644096

68332

Ensembl

ENSG00000205138

ENSMUSG00000074211

UniProt

A6NFY7

Q3U276

RefSeq (mRNA)

NM_001042631

NM_001033140

RefSeq (protein)

NP_001036096

NP_001028312

Místo (UCSC)Chr 19: 36 - 36 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Komplex sukcinátdehydrogenázy, komplex 1 (SDHAF1), také známý jako Protein 8 obsahující LYR motiv (LYRM8), je protein že u lidí je kódován SDHAF1, nebo LYRM8, gen. SDHAF1 je a chaperonový protein podílí se na shromáždění sukcinát dehydrogenáza (SDH) komplex (komplex II ). Mutace v tomto genu jsou spojeny s SDH-defektním infantilním leukoencefalopatie a nedostatek mitochondriálního komplexu II.[4][5][6]

Struktura

SDHAF1 se nachází na q rameno z chromozom 19 na pozici 13.12 a má 1 exon.[4] The SDHAF1 Gen produkuje 12,8 kDa protein složený ze 115 aminokyseliny.[7][8] SDHAF1 je všudypřítomně exprimován a patří do komplexní rodiny I LYR a podrodiny SDHAF1.[5] Jako takový je SDHAF1 jedním z nejméně osmi proteinů, které mají LYR tripeptid motiv, považovaný za důležitý pro metabolismus Fe-S.[6] SDHAF1 také obsahuje N-terminál sekvence cílení mitochondrií, která se po importu do mitochondrií nerozštěpí. Zakódovaný protein je spravedlivý hydrofilní a neobsahuje a transmembránová doména.[9]

Funkce

SDHAF1 je nezbytný pro montáž sukcinát dehydrogenáza (SDH) komplex (komplex II ), komplex enzymů, který je součástí obou cyklus trikarboxylové kyseliny (TCA) a mitochondriální elektronový transportní řetězec, a které páry oxidace z sukcinát na fumarát se snížením ubichinon (koenzym Q) do ubichinol.[5] Komplex sukcinátdehydrogenázy (SDH) mitochondriálního respiračního řetězce se skládá ze 4 jednotlivých podjednotek. Protein kódovaný SDHAF1 gen se nachází v mitochondrie, a je nezbytný pro montáž SDH, ale fyzicky se nespojuje s komplexem in vivo.[4] Konkrétně SDHAF1 zprostředkovává a podporuje zrání SDHB podjednotka SDH katalytického dimeru. The železo-sírový (Fe-S) protein pro funkční sukcinát dehydrogenázu je vyžadována podjednotka SDHB. Chrání SDHB před poškozením oxidanty „SDHAF1 hraje zásadní roli při sestavování a stabilitě sukcinát dehydrogenázy (SDH).[10][9][5] Alternativně může SDHAF1 usnadnit získání klastru Fe-S pomocí SDHB přímou vazbou na kochaperon HSC20, který je základní součástí biogenetického aparátu Fe-S, který usnadňuje přenos protetické skupiny Fe-S z hlavního proteinu lešení ISCU příjemcům apo-proteinů (tj. SDHB),[6]

Klinický význam

Varianty SDHAF1 byly spojovány s nedostatkem mitochondriálního komplexu II a infantilní leukoencefalopatie. Nedostatek mitochondriálního komplexu II je porucha mitochondriálního respiračního řetězce s heterogenními klinickými projevy. Mezi klinické příznaky patří psychomotorická regrese u kojenců, špatný růst s nedostatečným rozvojem řeči, závažné spastická quadriplegia, dystonie, progresivní leukoencefalopatie, svalová slabost, nesnášenlivost cvičení a kardiomyopatie. Někteří pacienti se projevují Leighův syndrom nebo Kearns-Sayreho syndrom. Missense mutace c.164 G> C, p.Arg55Pro a c.170 G> A, p.Gly57Glu, homozygot transverze 169G-C, s. Gly57-Arg, homozygotní nesmyslná mutace c.103G> T (p. Glu35X) a homozygotní nesmyslná mutace c.22C> T, p.Gln8X byly spojeny s nedostatkem mitochondriálního komplexu II kvůli disfunkci SDHAF1.[5][9][11][6]

Interakce

SDHAF1 má 27 interakcí protein-protein, přičemž 15 z nich je interakcí komplexních. HSCB, SDHB, ccdc136, KRT27, CIDEB, HSPA9, a ISCU bylo zjištěno, že všichni interagují s SDHAF1.[12][6]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000205138 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ A b C "Entrez Gene: Succinate dehydrogenase complex assembly factor 1". Citováno 2018-07-30.
  5. ^ A b C d E Přístupové číslo univerzálního zdroje bílkovin A6NFY7 pro „SDHAF1“ v UniProt. Konsorcium UniProt (leden 2017). „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  6. ^ A b C d E Maio N, Ghezzi D, Verrigni D, Rizza T, Bertini E, Martinelli D, Zeviani M, Singh A, Carrozzo R, Rouault TA (únor 2016). „Nemoci způsobující mutace SDHAF1 narušují přenos klastrů Fe-S na SDHB“. Buněčný metabolismus. 23 (2): 292–302. doi:10.1016 / j.cmet.2015.12.005. PMC  4749439. PMID  26749241.
  7. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  8. ^ Yao D. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-07-30.
  9. ^ A b C Ghezzi D, Goffrini P, Uziel G, Horvath R, Klopstock T, Lochmüller H, D'Adamo P, Gasparini P, Strom TM, Prokisch H, Invernizzi F, Ferrero I, Zeviani M (červen 2009). „SDHAF1 kódující specifický montážní faktor komplexu LYR II je mutován v SDH defektní infantilní leukoencefalopatii“. Genetika přírody. 41 (6): 654–6. doi:10,1038 / ng.378. PMID  19465911. S2CID  11595312.
  10. ^ Na U, Yu W, Cox J, Bricker DK, Brockmann K, Rutter J, Thummel CS, Winge DR (srpen 2014). „Faktory LYR SDHAF1 a SDHAF3 zprostředkovávají zrání podjednotky železo-síra sukcinát dehydrogenázy.“. Buněčný metabolismus. 20 (2): 253–66. doi:10.1016 / j.cmet.2014.05.014. PMC  4126850. PMID  24954417.
  11. ^ Ohlenbusch A, Edvardson S, Skorpen J, Bjornstad A, Saada A, Elpeleg O, Gärtner J, Brockmann K (září 2012). „Leukoencefalopatie s nahromaděným sukcinátem svědčí o nedostatku komplexu II souvisejícího s SDHAF1“. Orphanet Journal of Rare Diseases. 7: 69. doi:10.1186/1750-1172-7-69. PMC  3492161. PMID  22995659.
  12. ^ „Bylo nalezeno 27 binárních interakcí pro hledaný výraz SDHAF1“. Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-25.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.