S100A12 - S100A12

S100A12
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1E8A, 1GQM, 1ODB, 2M9G, 2WC8, 2WCB, 2WCE, 2WCF
Identifikátory
Aliasy	S100A12, CAAF1, CAGC, CGRP, ENRAGE, MRP-6, MRP6, p6, S100 protein vázající vápník A12, EN-RAGE
Externí ID	OMIM: 603112 HomoloGene: 48361 Genové karty: S100A12
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	153,375,621 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na RAGE receptor; • vazba iontů mědi;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • buněčná membrána; • extracelulární oblast; • cytoskelet; • buněčné jádro; • lumen sekreční granule;
Biologický proces	• aktivace žírných buněk; • pozitivní regulace zánětlivé reakce; • pozitivní regulace aktivity MAP kinázy; • chemotaxe monocytů; • proces imunitního systému; • sekrece cytokinů; • obranná reakce na houby; • chemotaxe neutrofilů; • obranná reakce na bakterii; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • xenobiotický metabolický proces; • vrozený imunitní systém; • zánětlivá reakce; • degranulace neutrofilů; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • zabíjení buněk jiného organismu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6283
	n / a
	ENSG00000163221
	n / a
	P80511
	n / a
	NM_005621
	n / a
	NP_005612
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

S100 protein vázající vápník A12 (S100A12) je protein že u lidí je kódován S100A12 gen.^[3]^[4] Lidský S100A12, také známý jako kalgranulin C, byl poprvé popsán v roce 1995.^[5]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinů S100 obsahující 2 EF ruka motivy vázající vápník.

Funkce

Obecně má S100A12 významný antiinfekční a antibakteriální role, která souvisí s jeho schopností absorbovat ionty. Například inhibuje šíření a virulence z H. pylori.^[6]^[7]

Distribuce tkání

Neutrofily a monocyty / makrofágy jsou důležitým zdrojem S100A12 v buňce^[8] i když někteří epiteliální buňky a dendritické buňky jsou schopny jeho sekrece.^[9] Některé tkáně jsou bohaté na tyto buňky, a tak i na tento protein. Mezi ně patří slezina nebo plíce. Vyskytuje se intracelulárně, ale je také produkován do extracelulárního prostředí, kde hraje hlavní roli. Vyskytuje se v extracelulárním prostředí jako homodimer nebo hexamer.^[10]

Klinický význam

Jeho přítomnost je spojena s kardiovaskulární a onemocnění ledvin.^[10] Stejně jako ostatní proteiny S100, signály S100A12 procházejí přes RAGE receptor a TLR. Obecně tato signalizace vede k cytokin Výroba, chemotaxe a zvýšil oxidační stres. V endotelových buňkách vede tato signalizace k aktivaci NFκB, pod kterým je výroba adhezní molekuly jako ICAM, VCAM nebo selectins se zvyšuje.^[10] Navrhuje se, aby byl tento protein zapojen do specifické závislosti na vápníku signální transdukce cesty a jeho regulační účinek na cytoskeletální komponenty mohou modulovat různé aktivity neutrofilů.^[4]

V případě mohou hrát důležitou roli kaskády, které jsou spouštěny interakcí S100A12 s RAGE selhání ledvin v hemodialýza pacientů. Vztah mezi S100A12 a dialýzou ledvin úmrtnost bylo opakovaně hlášeno. S100A12 může hrát roli v monitorování SLE pacientů jako marker poškození ledvin v glomerulonefritida.^[11]^[12] Je také spojován s gastrointestinální nemoci. v zánětlivá onemocnění střev, významně koreluje s aktivitou choroby a spolu s dalšími proteiny rodiny 100S může předpovídat relaps onemocnění.^[13]^[14]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163221 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wicki R, Marenholz I, Mischke D, Schäfer BW, Heizmann CW (prosinec 1996). „Charakterizace lidského genu S100A12 (kalgranulin C, p6, CAAF1, CGRP), nového člena klastru genu S100 na chromozomu 1q21“. Buněčný vápník. 20 (6): 459–64. doi:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID 8985590.
^ ^A ^b "Entrez Gene: S100A12 S100 protein vázající vápník A12".
^ Wicki R, Marenholz I, Mischke D, Schäfer BW, Heizmann CW (prosinec 1996). „Charakterizace lidského genu S100A12 (kalgranulin C, p6, CAAF1, CGRP), nového člena klastru genu S100 na chromozomu 1q21“. Buněčný vápník. 20 (6): 459–64. doi:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID 8985590.
^ Yang Z, Yan WX, Cai H, Tedla N, Armishaw C, Di Girolamo N a kol. (Leden 2007). „S100A12 vyvolává aktivaci žírných buněk: potenciální cesta amplifikace u astmatu a vrozená imunita“. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 119 (1): 106–14. doi:10.1016 / j.jaci.2006.08.021. PMID 17208591.
^ Li D, Zeng Z, Yu T, Qin J, Wu J, Song JC a kol. (Květen 2016). "Exprese a klinické důsledky S100A12 u karcinomu žaludku". Biologie nádorů. 37 (5): 6551–9. doi:10.1007 / s13277-015-4460-5. PMID 26638166.
^ Khorramdelazad H, Bagheri V, Hassanshahi G, Karami H, Moogooei M, Zeinali M, Abedinzadeh M (2015-04-14). „Exprese S100A12 a RAGE v karcinomu přechodných buněk lidského měchýře: role osy ligand / RAGE v progresi nádoru?“. Asian Pacific Journal of Cancer Prevention. 16 (7): 2725–9. doi:10.7314 / APJCP.2015.16.7.2725. PMID 25854354.
^ Bagheri V, Hassanshahi G, Zeinali M, Abedinzadeh M, Khorramdelazad H (březen 2016). „Zvýšené hladiny S100A12 v semenné plazmě neplodných mužů s varikokélou“. Mezinárodní urologie a nefrologie. 48 (3): 343–7. doi:10.1007 / s11255-015-1188-5. PMID 26725070.
^ ^A ^b ^C Nazari A, Khorramdelazad H, Hassanshahi G, Day AS, Sardoo AM, Fard ET a kol. (Prosinec 2017). „S100A12 při renálních a kardiovaskulárních onemocněních“. Humanitní vědy. 191: 253–258. doi:10.1016 / j.lfs.2017.10.036. PMID 29080693.
^ Shiotsu Y, Mori Y, Nishimura M, Hatta T, Imada N, Maki N a kol. (Leden 2013). „Prognostická užitečnost plazmatických hladin S100A12 k vytvoření nového skórovacího systému pro predikci úmrtnosti u pacientů s udržovací hemodialýzou: dvouletá prospektivní observační studie v Japonsku“. BMC nefrologie. 14 (1): 16. doi:10.1186/1471-2369-14-16. PMC 3552940. PMID 23324110.
^ Tydén H, Lood C, Gullstrand B, Jönsen A, Ivars F, Leanderson T, Bengtsson AA (únor 2017). „Prozánětlivé proteiny S100 jsou spojeny s glomerulonefritidou a anti-dsDNA protilátkami u systémového lupus erythematodes“. Lupus. 26 (2): 139–149. doi:10.1177/0961203316655208. PMID 27407135.
^ Foell D, Kucharzik T, Kraft M, Vogl T, Sorg C, Domschke W, Roth J (červen 2003). „Lidský S100A12 získaný z neutrofilů (EN-RAGE) je silně exprimován během chronického aktivního zánětlivého onemocnění střev“. Střevo. 52 (6): 847–53. doi:10,1136 / gut. 52.6.847. PMC 1773692. PMID 12740341.
^ Wright EK, De Cruz P, Gearry R, den AS, Kamm MA (září 2014). „Fekální biomarkery v diagnostice a monitorování Crohnovy choroby“. Zánětlivá onemocnění střev. 20 (9): 1668–77. doi:10.1097 / MIB.0000000000000087. PMID 24918319.

Další čtení

Roth J, Vogl T, Sorg C, Sunderkötter C (duben 2003). „Fagocytově specifické proteiny S100: nová skupina prozánětlivých molekul“. Trendy v imunologii. 24 (4): 155–8. doi:10.1016 / S1471-4906 (03) 00062-0. PMID 12697438.
Guignard F, Mauel J, Markert M (červenec 1995). „Identifikace a charakterizace nového lidského neutrofilního proteinu souvisejícího s rodinou S100“. The Biochemical Journal. 309 (Pt 2) (2): 395–401. doi:10.1042 / bj3090395. PMC 1135745. PMID 7626002.
Schäfer BW, Wicki R, Engelkamp D, Mattei MG, Heizmann CW (únor 1995). „Izolace klonu YAC pokrývající shluk devíti genů S100 na lidském chromozomu 1q21: zdůvodnění nové nomenklatury rodiny proteinů vázajících vápník S100“. Genomika. 25 (3): 638–43. doi:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.
Yamamura T, Hitomi J, Nagasaki K, Suzuki M, Takahashi E, Saito S a kol. (Duben 1996). "Lidský gen CAAF1 - molekulární klonování, genová struktura a mapování chromozomů". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 221 (2): 356–60. doi:10.1006 / bbrc.1996.0600. PMID 8619860.
Marti T, Erttmann KD, Gallin MY (duben 1996). „Interakce hostitel-parazit u lidské onchocerkózy: identifikace a sekvenční analýza nového lidského kalgranulinu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 221 (2): 454–8. doi:10.1006 / bbrc.1996.0616. PMID 8619876.
Ilg EC, Troxler H, Bürgisser DM, Kuster T, Markert M, Guignard F a kol. (Srpen 1996). "Stanovení aminokyselinové sekvence lidského S100A12 (P6, kalgranulin C, CGRP, CAAF1) pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 225 (1): 146–50. doi:10.1006 / bbrc.1996.1144. PMID 8769108.
Hofmann MA, Drury S, Fu C, Qu W, Taguchi A, Lu Y a kol. (Červen 1999). „RAGE zprostředkovává novou prozánětlivou osu: centrální buněčný povrchový receptor pro polypeptidy S100 / kalgranulin“. Buňka. 97 (7): 889–901. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80801-6. PMID 10399917.
Moroz OV, Antson AA, Dodson GG, Wilson KS, Skibshoj I, Lukanidin EM, Bronstein IB (únor 2000). „Krystalizace a předběžná rentgenová difrakční analýza lidského proteinu vázajícího vápník S100A12“. Acta Crystallographica. Sekce D, Biologická krystalografie. 56 (Pt 2): 189–91. doi:10.1107 / S0907444999014936. PMID 10666601.
Moroz OV, Antson AA, Murshudov GN, Maitland NJ, Dodson GG, Wilson KS a kol. (Leden 2001). „Trojrozměrná struktura lidské S100A12“. Acta Crystallographica. Sekce D, Biologická krystalografie. 57 (Pt 1): 20–9. doi:10.1107 / S090744490001458X. PMID 11134923.
Cole AM, Kim YH, Tahk S, Hong T, Weis P, Waring AJ, Ganz T (srpen 2001). „Kalcitermin, nový antimikrobiální peptid izolovaný ze sekrece lidských dýchacích cest“. FEBS Dopisy. 504 (1–2): 5–10. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02731-4. PMID 11522286.
Moroz OV, Antson AA, Dodson EJ, Burrell HJ, Grist SJ, Lloyd RM a kol. (Březen 2002). "Struktura S100A12 v hexamerní formě a její navrhovaná role v signalizaci receptoru". Acta Crystallographica. Sekce D, Biologická krystalografie. 58 (Pt 3): 407–13. doi:10.1107 / S0907444901021278. PMID 11856825.
Strauss GI, Edvinsson L, Larsen FS, Møller K, Knudsen GM (2002). "Cirkulující hladiny neuropeptidů (CGRP, VIP, NPY) u pacientů s fulminantním selháním jater". Neuropeptidy. 35 (3–4): 174–80. doi:10.1054 / npep.2001.0861. PMID 11884208.
Maayan C, Becker Y, Gesundheit B, Girgis SI (2002). "Peptid příbuzný genu pro kalcitonin v familiární dysautonomii". Neuropeptidy. 35 (3–4): 189–95. doi:10.1054 / npep.2001.0863. PMID 11884210.
Filipek A, Jastrzebska B, Nowotny M, Kuznicki J (srpen 2002). „CacyBP / SIP, kalcyklin a protein interagující se Siah-1, váže proteiny EF-hand z rodiny S100“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (32): 28848–52. doi:10,1074 / jbc.M203602200. PMID 12042313.
Ryckman C, Robichaud GA, Roy J, Cantin R, Tremblay MJ, Tessier PA (září 2002). „Transkripce HIV-1 a produkce virů jsou zvýrazněny prozánětlivými proteiny souvisejícími s myeloidy v lidských CD4 + T lymfocytech.“. Journal of Immunology. 169 (6): 3307–13. doi:10,4049 / jimmunol.169.6.3307. PMID 12218151.
Foell D, Ichida F, Vogl T, Yu X, Chen R, Miyawaki T a kol. (Duben 2003). „S100A12 (EN-RAGE) při monitorování Kawasakiho choroby“. Lanceta. 361 (9365): 1270–2. doi:10.1016 / S0140-6736 (03) 12986-8. PMID 12699958.
Foell D, Kucharzik T, Kraft M, Vogl T, Sorg C, Domschke W, Roth J (červen 2003). „Lidský S100A12 získaný z neutrofilů (EN-RAGE) je silně exprimován během chronického aktivního zánětlivého onemocnění střev“. Střevo. 52 (6): 847–53. doi:10,1136 / gut. 52.6.847. PMC 1773692. PMID 12740341.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163221 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8985590-3] Wicki R, Marenholz I, Mischke D, Schäfer BW, Heizmann CW (prosinec 1996). „Charakterizace lidského genu S100A12 (kalgranulin C, p6, CAAF1, CGRP), nového člena klastru genu S100 na chromozomu 1q21“. Buněčný vápník. 20 (6): 459–64. doi:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID 8985590.

[entrez-4] A ^b "Entrez Gene: S100A12 S100 protein vázající vápník A12".

[5] Wicki R, Marenholz I, Mischke D, Schäfer BW, Heizmann CW (prosinec 1996). „Charakterizace lidského genu S100A12 (kalgranulin C, p6, CAAF1, CGRP), nového člena klastru genu S100 na chromozomu 1q21“. Buněčný vápník. 20 (6): 459–64. doi:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID 8985590.

[6] Yang Z, Yan WX, Cai H, Tedla N, Armishaw C, Di Girolamo N a kol. (Leden 2007). „S100A12 vyvolává aktivaci žírných buněk: potenciální cesta amplifikace u astmatu a vrozená imunita“. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 119 (1): 106–14. doi:10.1016 / j.jaci.2006.08.021. PMID 17208591.

[7] Li D, Zeng Z, Yu T, Qin J, Wu J, Song JC a kol. (Květen 2016). "Exprese a klinické důsledky S100A12 u karcinomu žaludku". Biologie nádorů. 37 (5): 6551–9. doi:10.1007 / s13277-015-4460-5. PMID 26638166.

[8] Khorramdelazad H, Bagheri V, Hassanshahi G, Karami H, Moogooei M, Zeinali M, Abedinzadeh M (2015-04-14). „Exprese S100A12 a RAGE v karcinomu přechodných buněk lidského měchýře: role osy ligand / RAGE v progresi nádoru?“. Asian Pacific Journal of Cancer Prevention. 16 (7): 2725–9. doi:10.7314 / APJCP.2015.16.7.2725. PMID 25854354.

[9] Bagheri V, Hassanshahi G, Zeinali M, Abedinzadeh M, Khorramdelazad H (březen 2016). „Zvýšené hladiny S100A12 v semenné plazmě neplodných mužů s varikokélou“. Mezinárodní urologie a nefrologie. 48 (3): 343–7. doi:10.1007 / s11255-015-1188-5. PMID 26725070.

[:0-10] A ^b ^C Nazari A, Khorramdelazad H, Hassanshahi G, Day AS, Sardoo AM, Fard ET a kol. (Prosinec 2017). „S100A12 při renálních a kardiovaskulárních onemocněních“. Humanitní vědy. 191: 253–258. doi:10.1016 / j.lfs.2017.10.036. PMID 29080693.

[11] Shiotsu Y, Mori Y, Nishimura M, Hatta T, Imada N, Maki N a kol. (Leden 2013). „Prognostická užitečnost plazmatických hladin S100A12 k vytvoření nového skórovacího systému pro predikci úmrtnosti u pacientů s udržovací hemodialýzou: dvouletá prospektivní observační studie v Japonsku“. BMC nefrologie. 14 (1): 16. doi:10.1186/1471-2369-14-16. PMC 3552940. PMID 23324110.

[12] Tydén H, Lood C, Gullstrand B, Jönsen A, Ivars F, Leanderson T, Bengtsson AA (únor 2017). „Prozánětlivé proteiny S100 jsou spojeny s glomerulonefritidou a anti-dsDNA protilátkami u systémového lupus erythematodes“. Lupus. 26 (2): 139–149. doi:10.1177/0961203316655208. PMID 27407135.

[13] Foell D, Kucharzik T, Kraft M, Vogl T, Sorg C, Domschke W, Roth J (červen 2003). „Lidský S100A12 získaný z neutrofilů (EN-RAGE) je silně exprimován během chronického aktivního zánětlivého onemocnění střev“. Střevo. 52 (6): 847–53. doi:10,1136 / gut. 52.6.847. PMC 1773692. PMID 12740341.

[14] Wright EK, De Cruz P, Gearry R, den AS, Kamm MA (září 2014). „Fekální biomarkery v diagnostice a monitorování Crohnovy choroby“. Zánětlivá onemocnění střev. 20 (9): 1668–77. doi:10.1097 / MIB.0000000000000087. PMID 24918319.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]