REV1 - REV1
REV1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
Identifikátory | |||||||||||||||||
Aliasy | REV1, REV1L, AIBP80, DNA řízená polymeráza, REV1 DNA řízená polymeráza | ||||||||||||||||
Externí ID | OMIM: 606134 MGI: 1929074 HomoloGene: 32309 Genové karty: REV1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||
RefSeq (protein) | |||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr 2: 99,4 - 99,49 Mb | Chr 1: 38,05 - 38,13 Mb | |||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||
DNA opravný protein REV1 je protein že u lidí je kódován REV1 gen.[5][6]
Tento gen kóduje protein s podobností s S. cerevisiae mutageneze protein Rev1. Proteiny Rev1 obsahují a BRCT doména, což je důležité v interakce protein-protein. Navrhovaná role pro lidský protein podobný Rev1 je jako lešení, které získává DNA polymerázy zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho syntéza překladů (TLS) poškozené DNA. Byly nalezeny dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu, které kódují různé proteiny.[6]
Rev1 je a Y rodina DNA polymerázy; někdy se označuje jako a deoxycytidyltransferáza protože pouze vkládá deoxycytidin (dC) naproti lézím. Zda G, A, T, C, nebo abasic site, Rev1 vždy přidá C. Rev1 má schopnost vždy přidat C, protože používá arginin jako šablona, která se dobře doplňuje s C.[7] Přesto se tomu věří[kým? ] že Rev1 zřídka využívá svoji polymerázovou aktivitu; spíše se předpokládá, že primární role Rev1 je jako přistávací plocha pro proteiny, čímž pomáhá řídit nábor proteinů TLS, zejména Pol ζ (Rev3 / Rev7).
Interakce
REV1 bylo prokázáno komunikovat s MAD2L2.[8] Předpokládá se, že Rev1 může interagovat s PCNA jednou všudypřítomný kvůli lézi a pomozte získat Pol ζ (Rev3 / Rev7) polymeráza rodiny B zapojená do TLS.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135945 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026082 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Lin W, Xin H, Zhang Y, Wu X, Yuan F, Wang Z (prosinec 1999). „Lidský gen REV1 kóduje dCMP transferázu závislou na templátu“. Nucleic Acids Res. 27 (22): 4468–75. doi:10.1093 / nar / 27.22.4468. PMC 148731. PMID 10536157.
- ^ A b „Entrez Gene: REV1 REV1 homolog (S. cerevisiae)“.
- ^ Nair, DT (30. září 2005). „Rev1 využívá nový mechanismus syntézy DNA s použitím proteinového templátu“. Věda. 309 (5744): 2219–22. Bibcode:2005Sci ... 309.2219N. doi:10.1126 / science.1116336. PMID 16195463. S2CID 35378034.
- ^ Murakumo, Y; Ogura Y; Ishii H; Numata S; Ichihara M; Croce CM; Fishel R; Takahashi M (září 2001). „Interakce s proteiny hREV1, hREV3 a hREV7 náchylné k chybám po replikaci“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (38): 35644–51. doi:10,1074 / jbc.M102051200. ISSN 0021-9258. PMID 11485998.
Další čtení
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Wixler V, Laplantine E, Geerts D a kol. (1999). "Identifikace nových interakčních partnerů pro konzervovanou membránovou proximální oblast cytoplazmatických domén alfa-integrinu". FEBS Lett. 445 (2–3): 351–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00151-9. PMID 10094488. S2CID 9218762.
- Gibbs PE, Wang XD, Li Z a kol. (2000). "Funkce lidského homologu Saccharomyces cerevisiae REV1 je vyžadována pro mutagenezi vyvolanou UV zářením". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (8): 4186–91. Bibcode:2000PNAS ... 97.4186G. doi:10.1073 / pnas.97.8.4186. PMC 18191. PMID 10760286.
- Wixler V, Geerts D, Laplantine E a kol. (2000). „LIM-only protein DRAL / FHL2 se váže na cytoplazmatickou doménu několika alfa a beta integrinových řetězců a je přijímán do adhezních komplexů“. J. Biol. Chem. 275 (43): 33669–78. doi:10,1074 / jbc.M002519200. PMID 10906324.
- Masuda Y, Takahashi M, Tsunekuni N, et al. (2001). „Aktivita deoxycytidyltransferázy lidského proteinu REV1 je úzce spojena se zachovanou doménou polymerázy“. J. Biol. Chem. 276 (18): 15051–8. doi:10,1074 / jbc.M008082200. PMID 11278384.
- Murakumo Y, Ogura Y, Ishii H a kol. (2001). „Interakce s proteiny hREV1, hREV3 a hREV7 náchylné k chybám po replikaci“. J. Biol. Chem. 276 (38): 35644–51. doi:10,1074 / jbc.M102051200. PMID 11485998.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Masuda Y, Ohmae M, Masuda K, Kamiya K (2003). "Struktura a enzymatické vlastnosti stabilního komplexu lidských proteinů REV1 a REV7". J. Biol. Chem. 278 (14): 12356–60. doi:10,1074 / jbc.M211765200. PMID 12529368.
- Clark DR, Zacharias W, Panaitescu L, McGregor WG (2004). „Inhibice REV1 zprostředkovaná ribozymem snižuje frekvenci UV indukovaných mutací v lidském genu HPRT“. Nucleic Acids Res. 31 (17): 4981–8. doi:10,1093 / nar / gkg725. PMC 212819. PMID 12930947.
- Guo C, Fischhaber PL, Luk-Paszyc MJ a kol. (2004). „Myší protein Rev1 interaguje s více DNA polymerázami zapojenými do translesionální syntézy DNA“. EMBO J.. 22 (24): 6621–30. doi:10.1093 / emboj / cdg626. PMC 291821. PMID 14657033.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Ohashi E, Murakumo Y, Kanjo N a kol. (2005). "Interakce hREV1 se třemi lidskými DNA polymerázami z rodiny Y". Geny buňky. 9 (6): 523–31. doi:10.1111 / j.1356-9597.2004.00747.x. PMID 15189446. S2CID 24470762.
- Tissier A, Kannouche P, Reck MP a kol. (2005). „Co-localization in replication foci and interaction of human Y-family members, DNA polymerase pol eta and REVl protein“. Oprava DNA (Amst.). 3 (11): 1503–14. doi:10.1016 / j.dnarep.2004.06.015. PMID 15380106.
- Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005 Natur.434..724H. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
- Lin X, Okuda T, Trang J, Howell SB (2006). „Lidský REV1 moduluje cytotoxicitu a mutagenitu cisplatiny v buňkách lidského karcinomu vaječníků“. Mol. Pharmacol. 69 (5): 1748–54. doi:10,1124 / mol. 105,020446. PMID 16495473. S2CID 22316155.
- Masuda Y, Kamiya K (2006). „Role jednořetězcové DNA při cílení REV1 na konce primeru“. J. Biol. Chem. 281 (34): 24314–21. doi:10,1074 / jbc.M602967200. PMID 16803901.
- Yuasa MS, Masutani C, Hirano A a kol. (2006). „Komplex lidské DNA polymerázy eta obsahující Rad18, Rad6 a Rev1; proteomická analýza a cílení komplexu na frakci buněk vázaných na chromatin zadržovaných replikační vidlicí“. Geny buňky. 11 (7): 731–44. doi:10.1111 / j.1365-2443.2006.00974.x. PMID 16824193. S2CID 32695133.