Ipomovirus - Ipomovirus
| Ipomovirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Orthornavirae |
| Kmen: | Pisuviricota |
| Třída: | Stelpaviricetes |
| Objednat: | Patatavirales |
| Rodina: | Potyviridae |
| Rod: | Ipomovirus |
| Zadejte druh | |
| Virus sladké brambory se slabou skvrnou | |
Ipomovirus je rod viry, v rodině Potyviridae. V současné době existuje sedm druhů tohoto rodu, včetně druhů druhů Virus sladké brambory se slabou skvrnou.[1][2] Infikují rostliny a jsou přenášeny bílými muškami (Bemisia tabaci ). Název rodu je odvozen od Ipomoea - obecný název sladkých brambor.
Taxonomie
Skupina: ssRNA (+)
Struktura
Viry v Ipomoviru nejsou neobalené, mají pružnou a vláknitou geometrii. Průměr je kolem 12-15 nm a může mít různé délky v závislosti na druhu (200-300 nanometrů (nm): 500-600 nm: 650-900 nm).[1] Kapsida má spirálovou symetrii s roztečí 3,4 nm. Indukují charakteristická inkluzní tělíska (větrníky) v infikovaných rostlinných buňkách.
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Ipomovirus | Vláknité | Spirálovitý | Neobalené | Lineární | Segmentované |
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace následuje model replikace pozitivního řetězce viru RNA. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku virovým pohybem vedeným tubuly. Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Virus se přenáší pomocí vektoru (bílá muška). Přenosové cesty jsou vektorové a mechanické.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ipomovirus | Rostliny | Žádný | Virové hnutí; mechanické očkování | Virové hnutí | Cytoplazma | Cytoplazma | Mechanické očkování: bílá muška |
Genom
Genom je monpartní lineární jednořetězcový genom RNA s pozitivní polaritou o délce přibližně 10–11 kilobází. 3 'konec má poly (A) trakt a 5' konec má genomový protein (VPg).[1]
Kóduje jeden polypeptid s předpokládanou molekulovou hmotností 390 kilogramůDaltoni (kDa), která je štěpena na ~ 10 bílkoviny. V pořadí 5'-3 'jsou tyto proteiny
- P1 (a serin proteáza ): 83 kDa
- HC (proteáza): 51 kDa
- P3: 34 kDa
- 6K1: 5 kDa
- Cl (helikáza ): 71 kDa
- 6K2: 6 kDa
- VPg (5 'vazebný protein): 20 kDa
- NIa-Pro (proteáza): 27 kDa
- NIb (RNA závislá RNA polymeráza ): 57 kDa
- Kapsidový protein: 34 kDa
Může existovat určitá variace v počtu proteinů v závislosti na druhu.
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.