Parechovirus - Parechovirus

Parechovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Pisoniviricetes
Objednat:Picornavirales
Rodina:Picornaviridae
Rod:Parechovirus
Druh

A viz text

Parechovirus je rod z viry v rodině Picornaviridae. Lidé, fretky a různí hlodavci slouží jako přirození hostitelé. Rod se v současné době skládá ze šesti přijatých druhů. Lidské parechoviry mohou způsobit gastrointestinální nebo respirační onemocnění u kojenců a byly zahrnuty v případech myokarditida a encefalitida.[1]

Taxonomie

Bylo identifikováno osmnáct typů lidského parechoviru: lidský parechovirus 1 (dříve HPeV1 echovirus 22), lidský parechovirus 2 (dříve echovirus 23) a HPeV3 až HPeV18.[2][3][4][5] V současné době je rozpoznáno celkem 15 genotypů.[6]

Druh

ICTV rozpoznává následujících šest druhů:[1][7]

Další dva druhy jsou rozpoznávány Picornaviridae.com, ale ne ICTV:[7]

  • Ljungan / Sebokele podobný parechovirus (LCLPV) (hostitel sokola, Maďarsko)
  • Manhattan parechovirus (MPeV) (hlodavec hostitel, Spojené státy)[8]

Struktura

Parechoviry jsou neobalené, s ikosahedrickou, sférickou a kulatou geometrií a T = pseudo3 symetrií. Průměr je kolem 30 nm. Genomy jsou lineární a nesegmentované, mají délku přibližně 7,3 kB.[9]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
ParechovirusIcosahedral[9]Pseudo T = 3NeobalenéLineárníMonopartitní

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne připojením viru k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají endocytózu. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou a viroporiny.[10]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
ParechovirusLidéDýchací trakt; gastrointestinální traktEndocytóza buněčných receptorůLyzaCytoplazmaCytoplazmaNeznámý

Klinické informace

Lidské parechoviry způsobují mírné, gastrointestinální nebo respirační nemoci, ale byly zapleteny v případech myokarditida a encefalitida. Lidské parechoviry se běžně šíří a více než 95% lidských případů je infikováno v raném věku, ve věku od dvou do pěti let.[11][12] Parechovirus B byl navržen jako zoonotický virus spojený s cukrovka a nitroděložní smrt plodu u lidí.[13][14] Data týkající se těchto funkcí jsou však v současné době omezená a je třeba je potvrdit. Parechovirus je organismus biologické bezpečnosti úrovně 2.

Dějiny

První parechoviry (E22 a E23) byly izolovány v roce 1956 a uznány jako nový rod v roce 1996.[15][16] Parechovirus B byl poprvé izolován z bankovní hraboši (Myodes glareolus, dříve Clethrionomys glareolus) v polovině 90. let.[17] Lidský parechovirus typu 3 (HPeV3) byl nalezen u nejméně 20 mladých kojenců v USA v roce 2014. Tato čísla zahrnují sadu identických tripletů z centrální Wisconsin, kteří dostali virus a byli diagnostikováni téměř o dva měsíce později po návalu testů, protože to byl první známý případ v těchto zdravotnických systémech.[18] Vypuknutí v roce 2014 je vyšší počet, než se očekávalo, a předpokládá se, že souvisí s přenosem z matky na plod.[19]

Reference

  1. ^ A b „Seznam hlavních druhů ICTV 2018a v1“. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 15. prosince 2018.
  2. ^ Ito M, Yamashita T, Tsuzuki H, Takeda N, Sakae K (2004). „Izolace a identifikace nového lidského parechoviru“. J. Gen. Virol. 85 (2): 391–398. doi:10.1099 / vir.0.19456-0. PMID  14769896.
  3. ^ Al-Sunaidi M, Williams CH, Hughes PJ, Schnurr DP, Stanway G (2007). „Analýza nového lidského parechoviru umožňuje definici typů parechovirů a identifikaci strukturních domén RNA“. J. Virol. 81 (2): 1013–21. doi:10.1128 / JVI.00584-06. PMC  1797470. PMID  17005640.
  4. ^ Watanabe K, Oie M, Higuchi M, Nishikawa M, Fujii M (červen 2007). „Izolace a charakterizace nového lidského parechoviru z klinických vzorků“. Emerg Infect Dis. 13 (6): 889–95. doi:10,3201 / eid1306,060896. PMC  2792847. PMID  17553229.
  5. ^ „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 7. května 2020.
  6. ^ Chieochansin T, Vichiwattana P, Korkong S, Theamboonlers A, Poovorawan Y (2011) Molekulární epidemiologie, charakterizace genomu a událost rekombinace lidského parechoviru. Virologie
  7. ^ A b "Parechovirus". Picornaviridae.com. Citováno 15. února 2019.
  8. ^ Picornaviridae.com: Manhatten PeV genové sekvence
  9. ^ A b Shakeel, Shabih; Westerhuis, Brenda M .; Ora, Ari; Koen, Gerrit; Bakker, Arjen Q .; Claassen, Yvonne; Wagner, Koen; Beaumont, Tim; Wolthers, Katja C .; Butcher, Sarah J. (2015). „Strukturální základ neutralizace lidského parechoviru lidskými monoklonálními protilátkami“. Journal of Virology. 89 (18): 9571–9580. doi:10.1128 / JVI.01429-15. PMC  4542383. PMID  26157123.
  10. ^ „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  11. ^ Stanway G, Joki-Korpela P, Hyypiä T (2000). "Lidské parechoviry - biologie a klinický význam". Rev. Med. Virol. 10 (1): 57–69. doi:10.1002 / (SICI) 1099-1654 (200001/02) 10: 1 <57 :: AID-RMV266> 3.0.CO; 2-H. PMID  10654005.
  12. ^ Joki-Korpela P, Hyypiä T (2001). „Parechoviry, nová skupina lidských pikornavirů“. Ann. Med. 33 (7): 466–71. doi:10.3109/07853890109002095. PMID  11680794.
  13. ^ Niklasson B, Samsioe A, Papadogiannakis N, Kawecki A, Hörnfeldt B, Saade GR, Klitz W (2007). „Sdružení zoonotického viru Ljungan s intrauterinními úmrtími plodu“. Část A: Výzkum vrozených vad: Klinická a molekulární teratologie. 79 (6): 488–93. doi:10.1002 / bdra.20359. PMID  17335057.
  14. ^ Niklasson B, Heller KE, Schonecker B, Bildsoe M, Daniels T, Hampe CS, Widlund P, Simonson WT, Schaefer JB, Rutledge E, Bekris L, Lindberg AM, Johansson S, Örtqvist E, Persson B, Lernmark Å (2003) . „Vývoj diabetu 1. typu u hrabošů divokých bank spojený s autoprotilátkami na ostrůvcích a novým virem ljungan“. Int. J. Exp. Diabezita. Res. 4 (1): 35–44. doi:10.1080/15438600303733. PMC  2480497. PMID  12745669.
  15. ^ Stanway, G. & Hyypiä, T. (1999). "Parechoviry". Journal of Virology. 73 (7): 5249–5254.
  16. ^ Pringle, C.R. (1996). "Virus Taxonomy 1996". Archivy virologie. 141 (11): 2251–2256. doi:10.1007 / BF01718231. PMC  7086844. PMID  8992952.
  17. ^ Niklasson B, Kinnunen L, Hörnfeldt B, Hörling J, Benemar C, Hedlund KO, Matskova L, Hyypiä T, Winberg G (1999). "Nový pikornavirus izolovaný z hrabošů obecných (Clethrionomys glareolus)". Virologie. 255 (1): 86–93. doi:10.1006 / viro.1998.9557. PMID  10049824.
  18. ^ „Parechovirus.com“. Parechovirový výzkum. Citováno 2016-01-15.
  19. ^ „Virová meningitida u dětí v Kansas City sondována“. Hvězda v Kansas City. Associated Press. 13. srpna 2014.

externí odkazy