Nodaviridae - Nodaviridae

Nodaviridae
Vakuoly v sítnici australské larvy basy experimentálně infikované „betanodavirem“
Vakuovačky v sítnice z Australský bas larva experimentálně infikovaná Betanodavirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Kitrinoviricota
Třída:Magsaviricetes
Objednat:Nodamuvirales
Rodina:Nodaviridae

Nodaviridae je rodina bez obalu pozitivní viry RNA.[1] Obratlovci a bezobratlí slouží jako přirození hostitelé. Mezi nemoci spojené s touto rodinou patří: virové encefalopatie a retinopatie v rybách. V rodině je devět druhů rozdělených mezi dva rody.[2][3]

Dějiny

Název rodiny je odvozen od japonský vesnice Nodamura, Prefektura Iwate odkud byl virus Nodamura poprvé izolován Culex tritaeniorhynchus komáři.

Virologie

Struktura

Virus není obalen a má ikosahedrální kapsidu (triangulační číslo = 3) o průměru od 29 do 35 nm. The kapsid je vyroben z 32 kapsomerů.[2]

Genom

Virus Flock House genom a funkční mapa replika protein A.

Genom je lineární, pozitivní smysl, bipartitní (složený ze dvou segmentů - RNA1 a RNA2) jednovláknový RNA skládající se z 4500 nukleotidy s 5 'terminálem methylovaný víčko a nepolyadenylovaný 3 'terminál.[2]

RNA1, která má délku ~ 3,1 kilobází, kóduje protein, který má více funkčních domén: mitochondriální cílovou doménu, transmembránovou doménu, RNA-dependentní RNA polymerázovou (RdRp) doménu, doménu pro vlastní interakci a doménu zakončující RNA. Kromě toho RNA1 kóduje subgenomickou RNA3, která kóduje protein B2, inhibitor umlčování RNA.[2]

RNA2 kóduje protein α, prekurzor virového kapsidového proteinu, který se automaticky štěpí na dva zralé proteiny, 38 kDa β protein a 5 kDa γ protein, při konzervované Asn /Ala během sestavování viru.[2]

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace následuje model replikace pozitivního řetězce viru RNA. Transkripce pozitivního řetězce viru RNA pomocí interního iniciačního modelu transkripce subgenomické RNA je metodou transkripce. Obratlovci a bezobratlí slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou kontakt a kontaminace.[2][3]

Taxonomie

Členové rodu Alphanodavirus byly původně izolovány z hmyzu, zatímco z rodu Betanodavirus byly izolovány z ryb. Zdá se, že malý počet nodovirů leží mimo některý z těchto subtypů.[2] Zatímco NoV zůstává typovým druhem Alphanodavirus, Flock house virus (FHV) je nejlépe studovaným z nodavirů.[2] V této rodině je devět druhů rozdělených mezi dva rody:[2]

Reference

  1. ^ Sahul Hameed, AS; Ninawe, AS; Nakai, T; Chi, SC; Johnson, KL; Zpráva ICTV, konsorcium (leden 2019). „Profil taxonomie viru ICTV: Nodaviridae“. The Journal of General Virology. 100 (1): 3–4. doi:10.1099 / jgv.0.001170. PMID  30431412.
  2. ^ A b C d E F G h i "Zpráva ICTV Nodaviridae".
  3. ^ A b „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.

externí odkazy