Nanoviridae - Nanoviridae
| Nanoviridae | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Monodnaviria |
| Království: | Shotokuvirae |
| Kmen: | Cressdnaviricota |
| Třída: | Arfiviricetes |
| Objednat: | Mulpavirales |
| Rodina: | Nanoviridae |
| Rody | |
Nanoviridae je rodina viry. Rostliny slouží jako přirození hostitelé. V současné době je v této rodině 12 druhů rozdělených mezi 2 rody a jeden nepřiřazený druh. Mezi nemoci spojené s touto rodinou patří: zakrnění.[1][2] Jejich název je odvozen z řeckého slova νᾶνος (nanos; trpaslík), kvůli jejich malému genomu a jejich zakrnění účinkem na infikované rostliny.
Taxonomie
Uznávané rody jsou:
Nepřiřazený druh je Virus rozpadu kokosového listí.[2]
Struktura viru a genom
Viry v Nanoviridae jsou neobalené, s ikosahedrickou a kulatou geometrií a T = 1 symetrií. Průměr je kolem 18-19 nm.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Nanovirus | Icosahedral | T = 1 | Neobalené | Oběžník | Segmentované |
| Babuvirus | Icosahedral | T = 1 | Neobalené | Oběžník | Segmentované |
The genom se skládá z několika segmentů jednovláknového kruhu DNA každá ~ 1 kilobáze na délku (přibližně 81 kb v celkové délce[1]). Existuje 6 až 11 kruhových segmentů v závislosti na rodu. Každý ze segmentů kóduje jeden protein. V nekódující oblasti každého segmentu je domnělá struktura kmenové smyčky, která má na svém vrcholu konzervovanou 9-nukleotidovou sekvenci.
Každý člen má až 4 segmenty kódující replikační proteiny o ~ 33 kiloDaltonech (kDa). Ostatní segmenty kódují produkty o velikosti 10-20 kDa a zahrnují obalový protein o ~ 19 kDa a protein s retinoblastom vazba motiv.
Životní cyklus
Virová replikace je jaderná. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace následuje ssDNA model s postupným kruhem.[1] Po infekce hostitelské buňky fungují malé molekuly DNA, které byly enkapsidovány genomovou ssDNA primery. Váží se na komplementární oblasti a pomáhají při zahájení syntézy DNA hostitelem polymerázy. Po dokončení syntézy bude existovat dvouvláknový meziprodukt, který je přepsal jednosměrně. Většina jednotlivých částic nanoviru kóduje pouze jednu protein Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku exportem jaderných pórů a virovým pohybem vedeným tubulem. Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Virus se přenáší prostřednictvím vektoru (mšice).[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Nanovirus | Rostliny: luštěniny | Phloem | Virové hnutí; mechanické očkování | Vylučování; virové hnutí | Jádro | Jádro | Mšice |
| Babuvirus | Rostliny: druhy musa | Phloem | Virové hnutí; mechanické očkování | Vylučování; virové hnutí | Jádro | Jádro | Mšice |
Reference
- ^ A b C d E „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
externí odkazy
- Boettcher, Stefan; Percus, Allon (2000). "Přírodní způsob optimalizace". Umělá inteligence. 119 (1–2): 275–286. arXiv:cond-mat / 9901351. doi:10.1016 / S0004-3702 (00) 00007-2.
- Poznámky k Nanoviridae
- Viralzone: Nanoviridae
- ICTV