NDUFB11 - NDUFB11
| ESSS podjednotka NADH: ubichinon oxidoreduktáza (komplex I) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ESSS | ||||||||
| Pfam | PF10183 | ||||||||
| InterPro | IPR019329 | ||||||||
| |||||||||
NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta subkomplex podjednotka 11, mitochondriální (NADH-ubichinon oxidoreduktáza ESSS podjednotka) je enzym že u lidí je kódován NDUFB11 gen.[5][6][7] NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplexní podjednotka 11 je doplňkovou podjednotkou NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex, který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána. Je také známý jako Komplex I. a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.[8] NDUFB11 mutace byly spojeny s lineárními kožními defekty s více vrozenými anomáliemi 3 a nedostatkem mitochondriálního komplexu I.[7]
Gen
Gen NDUFB11 je lokalizován na p rameni chromozom X na pozici 11,23 a je dlouhý 2 994 párů bází.[9][10]
Protein
NDUFB11 protein váží 17 kDa a je složen ze 153 aminokyselin.[9][10] NDUFB11 je podjednotka enzymu NADH dehydrogenáza (ubichinon), největší z dýchacích komplexů.
Struktura
Konstrukce je ve tvaru L s dlouhou, hydrofobní transmembránový doména a hydrofilní doména pro periferní rameno, která zahrnuje všechna známá redoxní centra a vazebné místo NADH.[8] Bylo poznamenáno, že N-terminál hydrofobní doména má potenciál být složena do alfa šroubovice přes vnitřní mitochondriální membrána s C-terminál hydrofilní doména interagující s globulárními podjednotkami komplexu I. Vysoce konzervovaný dvoudoménová struktura naznačuje, že tato vlastnost je zásadní pro funkci proteinu a že hydrofobní doména působí jako kotva pro NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex na vnitřní mitochondriální membráně.[7]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je doplňkovou podjednotkou více podjednotky NADH: ubichinon oxidoreduktáza (komplex I ), který se přímo nepodílí na katalýze. Savčí komplex I se skládá ze 45 různých podjednotek. Najde se na mitochondriální vnitřní membrána. Tento proteinový komplex má aktivitu NADH dehydrogenázy a aktivitu oxidoreduktázy. Přenáší elektrony z NADH do dýchací řetězec. Předpokládá se, že okamžitý akceptor elektronů pro enzym ubichinon. Alternativní sestřih dochází v tomto místě a byly identifikovány dvě varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.[7] Zpočátku, NADH váže se na komplex I a přenáší dva elektrony na isoalloxazinový kruh z flavin mononukleotid (FMN) protetické rameno k vytvoření FMNH2. Elektrony jsou přenášeny řadou klastry železo-síra (Fe-S) v protetickém rameni a nakonec na koenzym Q10 (CoQ), který je redukován na ubichinol (CoQH2). Tok elektronů mění redoxní stav proteinu, což vede ke konformační změně a strK. posun ionizovatelného postranního řetězce, který pumpuje čtyři vodíkové ionty z mitochondriální matrice.[8]
Klinický význam
Mutace v lidském genu jsou spojeny s lineárními kožními defekty s nedostatkem mitochondriálního komplexu I a mikroftalmie se syndromem lineárních kožních defektů.[7] Nedostatek mitochondriálního komplexu I je porucha mitochondriálního respiračního řetězce, která způsobuje širokou škálu klinických projevů od smrtelného novorozeneckého onemocnění až po neurodegenerativní poruchy začínající u dospělých.[11][12] V případech patogenních NDUFB11 mutace, s komplexním nedostatkem laktátová acidóza a sideroblastická anémie bylo zjištěno, že se vyskytuje.[13] Mutace v NDUFB11 byly také spojeny s mikroftalmií s lineárním syndromem kožních defektů s neurologickými a srdečními abnormalitami.[14]
Interakce
Ukázalo se, že NDUFB11 má 55 binárních interakce protein-protein včetně 32 společných interakcí. Zdá se, že NDUFB11 interaguje s OSUD 1, GPR42, CLDN7, GJB1, HIBÁD, EBP, GPR152, GPR101, TIMMDC1, TIMMDC1, PPBP, a CRELD2.[15]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147123 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031059 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Cui Y, Yu L, Gong R, Zhang M, Fan Y, Yue P, Zhao S (červen 1999). "Klonování a tkáňová expresivní charakterizace plné délky cDNA kódující lidský neuronový protein P17.3". Biochemická genetika. 37 (5–6): 175–85. doi:10.1023 / A: 1018734605214. PMID 10544803. S2CID 35325476.
- ^ Carroll J, Shannon RJ, Fearnley IM, Walker JE, Hirst J (prosinec 2002). "Definice jaderně kódovaného proteinového složení mitochondriálního komplexu bovinního srdce I. Identifikace dvou nových podjednotek". The Journal of Biological Chemistry. 277 (52): 50311–7. doi:10,1074 / jbc.M209166200. PMID 12381726.
- ^ A b C d E „Entrez Gene: NDUFB11 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 11, 17,3 kDa“.
Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména. - ^ A b C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
- ^ A b Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ A b „NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 11“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
- ^ „NDUFB11 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 beta podkomplex podjednotka 11, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - gen a protein NDUFB11“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-24.
Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence. - ^ „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ Torraco A, Bianchi M, Verrigni D, Gelmetti V, Riley L, Niceta M a kol. (Březen 2017). „Nová mutace v NDUFB11 odhaluje nový klinický fenotyp spojený s laktátovou acidózou a sideroblastickou anémií“. Klinická genetika. 91 (3): 441–447. doi:10.1111 / cge.12790. PMID 27102574. S2CID 5518038.
- ^ van Rahden VA, Fernandez-Vizarra E, Alawi M, značka K, Fellmann F, Horn D, Zeviani M, Kutsche K (duben 2015). „Mutace v NDUFB11 kódující složitou I složku mitochondriálního respiračního řetězce způsobují mikroftalmii se syndromem lineárních kožních defektů“. American Journal of Human Genetics. 96 (4): 640–50. doi:10.1016 / j.ajhg.2015.02.002. PMC 4385192. PMID 25772934.
- ^ NDUFB11 "Bylo nalezeno 55 binárních interakcí pro hledaný výraz NDUFB11" Šek
| url =hodnota (Pomoc). Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-25.
Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v 
Další čtení
- Petruzzella V, Tessa A, Torraco A, Fattori F, Dotti MT, Bruno C a kol. (Březen 2007). „Gen NDUFB11 není modifikátorem Leberovy dědičné optické neuropatie“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 355 (1): 181–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.01.140. PMID 17292333.
- Kohda M, Tokuzawa Y, Kishita Y, Nyuzuki H, Moriyama Y, Mizuno Y a kol. (Leden 2016). „Komplexní genomická analýza odhaluje genetickou krajinu nedostatků komplexu mitochondriálních dýchacích řetězců“. Genetika PLOS. 12 (1): e1005679. doi:10.1371 / journal.pgen.1005679. PMC 4704781. PMID 26741492.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.