Protein související s CDC45 - CDC45-related protein

CDC45
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5DGO
Identifikátory
Aliasy	CDC45, CDC45L, CDC45L2, PORC-PI-1, protein související s CDC45, cyklus buněčného dělení 45, MGORS7
Externí ID	OMIM: 603465 MGI: 1338073 HomoloGene: 2616 Genové karty: CDC45
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	19,520,612 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	18,811,987 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba chromatinu; • jednořetězcová vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba počátku replikace DNA; • GO: 0043140 3'-5 'aktivita DNA helikázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Preiniciační komplex replikace DNA; • centrosome; • nukleární pre-replikativní komplex; • komplex ochrany replikační vidlice; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• oprava dvouvláknového zlomu pomocí replikace vyvolané zlomem; • regulace transkripce podílející se na přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • pre-replikativní sestava komplexu zapojená do replikace DNA jaderného buněčného cyklu; • Kontrolní bod replikace DNA; • pozitivní regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • replikace DNA; • buněčný cyklus; • regulace umlčování chromatinu na telomerě; • shromáždění preiniciačního komplexu replikace mitotické DNA; • Odvíjení duplexu DNA; • Zahájení replikace DNA; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8318
	12544
	ENSG00000093009
	ENSMUSG00000000028
	O75419
	Q9Z1X9
	NM_001178010; NM_001178011; NM_003504; NM_001369291
	NM_001161623; NM_009862; NM_001358206
	NP_001171481; NP_001171482; NP_003495; NP_001356220
	NP_001155095; NP_033992; NP_001345135
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CDC45 je protein že u lidí je kódován CDC45L gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem byl identifikován podle jeho silné podobnosti s Saccharomyces cerevisiae Cdc45, esenciálního proteinu požadovaného k zahájení replikace DNA. Cdc45 je členem vysoce konzervativního multiproteinového komplexu včetně Cdc6 / Cdc18, údržba minichromozomů proteiny (MCM) a DNA polymeráza, což je důležité pro rané kroky replikace DNA u eukaryot. Ukázalo se, že tento protein interaguje s MCM7 a DNA polymerázou alfa. Studie podobného genu v Xenopus naznačuje, že tento protein hraje klíčovou roli v zavádění DNA polymerázy alfa na chromatin. Uvádí se více polyadenlyzačních míst tohoto genu.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein související s CDC45 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000093009 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000028 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Saha P, Thome KC, Yamaguchi R, Hou Z, Weremowicz S, Dutta A (srpen 1998). "Lidský homolog Saccharomyces cerevisiae CDC45". J. Biol. Chem. 273 (29): 18205–9. doi:10.1074 / jbc.273.29.18205. PMID 9660782.
^ McKie JM, Wadey RB, Sutherland HF, Taylor CL, Scambler PJ (září 1998). „Přímý výběr konzervovaných cDNA z kritické oblasti DiGeorge: izolace nového genu podobného CDC45“. Genome Res. 8 (8): 834–41. doi:10,1101 / gr. 8.8.834. PMC 310757. PMID 9724329.
^ Pollok S, Bauerschmidt C, Sänger J, Nasheuer HP, Grosse F (červenec 2007). "Human Cdc45 je antigen spojený s proliferací". FEBS J. 274 (14): 3669–84. doi:10.1111 / j.1742-4658.2007.05900.x. PMID 17608804.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDC45L CDC45 cyklus buněčného dělení podobný 45 (S. cerevisiae)".
^ ^A ^b ^C ^d ^E Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (březen 2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.
^ Kukimoto I, Igaki H, Kanda T (listopad 1999). „Lidský protein CDC45 se váže na protein udržující minichromozomy 7 a podjednotku p70 DNA polymerázy alfa“. Eur. J. Biochem. 265 (3): 936–43. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00791.x. PMID 10518787.

Další čtení

Leatherwood J (1998). "Vznikající mechanismy iniciace replikace eukaryotické DNA". Curr. Opin. Cell Biol. 10 (6): 742–8. doi:10.1016 / S0955-0674 (98) 80117-8. PMID 9914182.
Mimura S, Takisawa H (1998). "Xenopus Cdc45 závislé nakládání DNA polymerázy alfa na chromatin pod kontrolou S-fáze Cdk". EMBO J.. 17 (19): 5699–707. doi:10.1093 / emboj / 17.19.5699. PMC 1170898. PMID 9755170.
Shaikh TH, Gottlieb S, Sellinger B, Chen F, Roe BA, Oakey RJ, Emanuel BS, Budarf ML (1999). "Charakterizace CDC45L: gen v deleční oblasti 22q11.2 exprimovaný během myšího a lidského vývoje". Mamm. Genom. 10 (3): 322–6. doi:10,1007 / s003359900996. PMID 10051334.
Kukimoto I, Igaki H, Kanda T (1999). „Lidský protein CDC45 se váže na protein udržující minichromozomy 7 a podjednotku p70 DNA polymerázy alfa“. Eur. J. Biochem. 265 (3): 936–43. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00791.x. PMID 10518787.
Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Ramachandran N, Hainsworth E, Bhullar B, Eisenstein S, Rosen B, Lau AY, Walter JC, LaBaer J (2004). „Self-assembling protein microarrays“. Věda. 305 (5680): 86–90. doi:10.1126 / science.1097639. PMID 15232106.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Liu P, Barkley LR, Day T, Bi X, Slater DM, Alexandrow MG, Nasheuer HP, Vaziri C (2006). „Kontrolní bod S-fáze zprostředkovaný Chk1 cílí na iniciační faktor Cdc45 prostřednictvím mechanismu nezávislého na Cdc25A / Cdk2“. J. Biol. Chem. 281 (41): 30631–44. doi:10,1074 / jbc.M602982200. PMID 16912045.
Masai H, Taniyama C, Ogino K, Matsui E, Kakusho N, Matsumoto S, Kim JM, Ishii A, Tanaka T, Kobayashi T, Tamai K, Ohtani K, Arai K (2006). „Fosforylace MCM4 kinázou Cdc7 usnadňuje jeho interakci s Cdc45 na chromatinu“. J. Biol. Chem. 281 (51): 39249–61. doi:10,1074 / jbc.M608935200. PMID 17046832.
Boskovic J, Coloma J, Aparicio T, Zhou M, Robinson CV, Méndez J, Montoya G (2007). „Molekulární architektura lidského komplexu GINS“. EMBO Rep. 8 (7): 678–84. doi:10.1038 / sj.embor.7401002. PMC 1905900. PMID 17557111.
Bauerschmidt C, Pollok S, Kremmer E, Nasheuer HP, Grosse F (2007). „Interakce lidského Cdc45 s komplexem Mcm2-7, komplexem GINS a DNA polymerázami delta a epsilon během fáze S“. Geny buňky. 12 (6): 745–58. doi:10.1111 / j.1365-2443.2007.01090.x. PMID 17573775.
Pollok S, Grosse F (2007). "Degradace Cdc45 během diferenciace a apoptózy". Biochem. Biophys. Res. Commun. 362 (4): 910–5. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.08.069. PMID 17767920.

externí odkazy

Člověk CDC45 umístění genomu a CDC45 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000093009 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000028 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9660782-5] Saha P, Thome KC, Yamaguchi R, Hou Z, Weremowicz S, Dutta A (srpen 1998). "Lidský homolog Saccharomyces cerevisiae CDC45". J. Biol. Chem. 273 (29): 18205–9. doi:10.1074 / jbc.273.29.18205. PMID 9660782.

[pmid9724329-6] McKie JM, Wadey RB, Sutherland HF, Taylor CL, Scambler PJ (září 1998). „Přímý výběr konzervovaných cDNA z kritické oblasti DiGeorge: izolace nového genu podobného CDC45“. Genome Res. 8 (8): 834–41. doi:10,1101 / gr. 8.8.834. PMC 310757. PMID 9724329.

[pmid17608804-7] Pollok S, Bauerschmidt C, Sänger J, Nasheuer HP, Grosse F (červenec 2007). "Human Cdc45 je antigen spojený s proliferací". FEBS J. 274 (14): 3669–84. doi:10.1111 / j.1742-4658.2007.05900.x. PMID 17608804.

[entrez-8] A ^b "Entrez Gene: CDC45L CDC45 cyklus buněčného dělení podobný 45 (S. cerevisiae)".

[pmid12614612-9] A ^b ^C ^d ^E Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (březen 2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.

[pmid10518787-10] Kukimoto I, Igaki H, Kanda T (listopad 1999). „Lidský protein CDC45 se váže na protein udržující minichromozomy 7 a podjednotku p70 DNA polymerázy alfa“. Eur. J. Biochem. 265 (3): 936–43. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00791.x. PMID 10518787.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]