Hpunavirus - Hpunavirus
| Hpunavirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Myoviridae |
| Podčeleď: | Peduovirinae |
| Rod: | Hpunavirus |
| Zadejte druh | |
| Haemophilus phage HP1 | |
Hpunavirus (synonyma HP1likevirus a Hpunalikevirus) je rod viry v rodině Myoviridae v rámci podčeledi Peduovirinae. Bakterie slouží jako přirozený hostitel s přenosem dosaženým pasivní difúzí. V současné době existují tři druhy tohoto rodu, včetně druhů typu Haemophilus phage HP1.[1][2][3]
Taxonomie
Druh:
Struktura
Hpunalikeviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava má průměr přibližně 60 nm a je podlouhlá icosahedral symetrie (T = 7), složená ze 60 hexamerů a 12 pentamerů (celkem 72 kapsomerů). Ocas je dlouhý asi 135 nm, široký 18 nm, má 6 dlouhých koncových vláken, 6 krátkých hrotů a malou základní desku. Ocas je uzavřen v pouzdře, které se při kontrakci uvolňuje a klouže kolem jádra ocasu.[1]
Genom
Všech šest druhů bylo plně sekvenováno. Pohybují se v rozmezí 30 až 34 tisíc nukleotidů s 37 až 45 proteiny. Všech šest úplných genomů je k dispozici od NCBI[3]
Životní cyklus
Virus se připojuje k hostitelské buňce pomocí svých koncových vláken a používá virový exolyzin k degradaci buněčné stěny natolik, aby vysunul virovou DNA do hostitelské cytoplazmy kontrakcí ocasního obalu. Jakmile jsou virové geny replikovány, je prokapsid shromážděn a zabalen. Ocas se poté sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy.[1]
Dějiny
Podle ICTV Zpráva 2010–11, rod Hpunalikevirus byl poprvé přijat pod jménem HP1likevirus. Byl to nový rod, přijímaný ve stejné době jako všech šest jeho obsažených druhů a také jeho podčeleď Peduovirinae. Název byl změněn v následující zprávě (2012). Tyto návrhy jsou k dispozici tady a tady, resp.[2] Název byl později přejmenován na Hpunavirus a tři z jeho druhů byly odstraněny.
Reference
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 11. února 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2013 Release“. Citováno 11. února 2015.
- ^ A b NCBI. „Hpunalikevirus Complete Genomes“. Citováno 11. února 2015.