Glykogenin-1 - Glycogenin-1 - Wikipedia

GYG1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyGYG1, GSD15, GYG, glykogenin 1
Externí IDOMIM: 603942 MGI: 1351614 HomoloGene: 31219 Genové karty: GYG1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 3 (lidský)
Chr.Chromozom 3 (lidský)[1]
Chromozom 3 (lidský)
Genomické umístění pro GYG1
Genomické umístění pro GYG1
Kapela3q24Start148,991,341 bp[1]
Konec149,027,668 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004130
NM_001184720
NM_001184721

NM_013755
NM_001355261

RefSeq (protein)

NP_001171649
NP_001171650
NP_004121

NP_038783
NP_001342190

Místo (UCSC)Chr 3: 148,99 - 149,03 MbChr 3: 20,12 - 20,16 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Glykogenin-1 je enzym který se podílí na biosyntéze glykogen. Je schopen samo-glukosylace, tvořící oligosacharid primer, který slouží jako substrát pro glykogensyntázu. To se děje prostřednictvím mechanismu mezi podjednotkami. Hraje také roli v regulaci metabolismu glykogenu. Rekombinantní lidský glykogenin-1 byl exprimován v E-coli a čistí se použitím konvenčních chromatografie techniky.[5]

Metabolismus glykogenu

Glykogen je vícevětvový polysacharid. Je to primární prostředek glukóza skladování v živočišných buňkách. V lidském těle jsou dvěma hlavními tkáněmi, které ukládají glykogen, játra a kosterní svalstvo.[6] Glykogen je obvykle více koncentrován v játrech, ale protože lidé mají mnohem více svalové hmoty, naše svaly ukládají asi tři čtvrtiny celkového glykogenu v našem těle.

Umístění glykogenu

Funkce jaterního glykogenu je udržovat homeostázu glukózy a generovat glukózu prostřednictvím glykogenolýza kompenzovat pokles hladiny glukózy, ke kterému může dojít mezi jídly. Díky přítomnosti glukóza-6-fosfatáza enzym, hepatocyty jsou schopné přeměnit glykogen na glukózu a uvolnit jej do krve, aby tomu zabránily hypoglykémie.

V kosterním svalu se glykogen používá jako zdroj energie pro svalovou kontrakci během cvičení. Díky různým funkcím glykogenu ve svalu nebo játrech se regulační mechanismy jeho metabolismu liší v každé tkáni.[7] Tyto mechanismy jsou založeny hlavně na rozdílech ve struktuře a na regulaci enzymů, které katalyzují syntézu, glykogen syntáza (GS) a degradace, glykogen fosforyláza (GF).

Syntéza glykogenu

Glykogenin je iniciátor biosyntézy glykogenu.[8][9] Tento protein je glykosyltransferáza, která má schopnost autoglykosilace pomocí UDP-glukózy,[10] který pomáhá v růstu sám, dokud nevytvoří oligosacharid vyrobený 8 glukosami. Glykogenin je oligomer a je schopen interakce s několika proteiny. V posledních letech byla identifikována rodina proteinů, GNIP (protein interagující s glykogeninem), který interaguje s glykogeninem a stimuluje jeho autoglykolitační aktivitu.

Glykogenin-1

U lidí dva izoformy glykogeninu lze vyjádřit: glykogenin-1 s molekulovou hmotností 37 kDa a kodifikováno genem GYG1, který je exprimován většinou ve svalech; a glykogenin-2, s molekulovou hmotností 66 kDa a kodifikovaný genem GYG2, který je exprimován hlavně v játrech, srdečním svalu a jiných typech tkání, ale ne v kosterním svalu.[11]Glykogenin-1 byl popsán analýzou glykogenu kosterního svalu. Bylo zjištěno, že tuto molekulu spojilo a kovalentní vazba ke každé zralé molekule svalového glykogenu.[12]

Umístění genu GYG-1 v chromozomu 3.

Gen

Struktura

Gen glykogeninu-1, který se rozprostírá přes 13 kb, se skládá ze sedmi exony a šest introny. Je to proximální promotér obsahuje a TATA box, a cyklický AMP responzivní prvek a dvě domnělá vazebná místa Sp1 v a CpG ostrov, oblast DNA s vysokou frekvencí CpG stránky. Je jich také devět E-boxy které váží základní šroubovice-smyčka-šroubovice svalových specifických transkripčních faktorů.[13]

Místo a přepis

Gen GYG1 se nachází na dlouhém rameni chromozom 3, mezi pozicemi 24 a 25, ze základního páru 148 709 194 na základní pár 148 745 455.[14]

Transkripce lidského glykogeninu-1 se zahajuje hlavně při 80bp a 86bp před translatorem kodon začátek. Faktory transkripce mají pro svůj vývoj různá vazebná místa, některými příklady jsou: GATA, aktivátorový protein 1 a 2 (AP-1 a AP-2) a řada potenciálních vazebných míst pro oktamer-1.[15]

Nedostatek

Nedostatek glykogeninu-1 vede k Nemoc skladování glykogenu typ XV.

Mutace

Nedostatek glykogeninu-1 je detekován v sekvenci genu pro glykogenin-1, GYG1, který odhalil nesmyslnou mutaci v jednom alela a a missense mutace, Thr83Met, ve druhé. Missense mutace vedla k inaktivaci autoglykosylace glykogeninu-1, která je nezbytná pro aktivaci syntézy glykogenu ve svalu. Autoglykosylace glykogeninu-1 probíhá na Tyr195 vazbou gulosa-1-O-tyrosin. Indukovaná missense mutace tohoto zbytku vede k inaktivované autoglykosylaci. Bylo však také prokázáno, že missense mutace ovlivňující některé další zbytky glykogeninu-1 eliminuje autoglykosilaci.

Důsledky

Fenotypové rysy kosterního svalu u pacienta s touto poruchou jsou vyčerpání svalového glykogenu, mitochondriální proliferace a výrazná převaha pomalých oxidačních svalových vláken. Mutace v genu pro glykogenin-1 GYG1 jsou také příčinou kardiomyopatie a arytmie.[11]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163754 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019528 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Podrobnosti o glykogeninu-1, 1-333 aa, rekombinantní protein. [1].
  6. ^ Alonso MD, Lomako J, Lomako WM, Whelan WJ (červen 1995). „Katalytické aktivity glykogeninu navíc k autokatalytické auto-glukosylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (25): 15315–9. doi:10.1074 / jbc.270.25.15315. PMID  7797519.
  7. ^ Newsholme EA a Start C. (1973). V regulaci v metabolismu J. Wiley a synové. eds. Londýn Kapitola 3.
  8. ^ Lomako J, Lomako WM, Whelan WJ (prosinec 1988). „Self-glukosylační protein je základem pro biosyntézu glykogenu králičího svalu“. FASEB Journal. 2 (15): 3097–103. doi:10.1096 / fasebj.2.15.2973423. PMID  2973423. S2CID  24083688.
  9. ^ Viskupic E, Cao Y, Zhang W, Cheng C, DePaoli-Roach AA, Roach PJ (prosinec 1992). "Králičí kosterní sval glykogenin. Molekulární klonování a produkce plně funkčního proteinu v Escherichia coli". The Journal of Biological Chemistry. 267 (36): 25759–63. PMID  1281472.
  10. ^ Skurat AV, Roach PJ (leden 1996). „Několik mechanismů pro fosforylaci C-koncových regulačních míst v glykogensyntáze králičího svalu exprimovaných v buňkách COS“. The Biochemical Journal. 313 (Pt 1) (Pt 1): 45–50. doi:10.1042 / bj3130045. PMC  1216907. PMID  8546708.
  11. ^ A b Moslemi AR, Lindberg C, Nilsson J, Tajsharghi H, Andersson B, Oldfors A (duben 2010). „Nedostatek glykogeninu-1 a inaktivovaná aktivace syntézy glykogenu“. The New England Journal of Medicine. 362 (13): 1203–10. doi:10.1056 / NEJMoa0900661. PMID  20357282.
  12. ^ Zhai L, Dietrich A, Skurat AV, Roach PJ (leden 2004). „Strukturně-funkční analýza GNIP, proteinu interagujícího s glykogeniny“. Archivy biochemie a biofyziky. 421 (2): 236–42. doi:10.1016 / j.abb.2003.11.017. PMID  14984203.
  13. ^ van Maanen MH, Fournier PA, Palmer TN, Abraham LJ (červenec 1999). "Charakterizace lidského genu pro glykogenin-1: identifikace svalové specifické regulační domény". Gen. 234 (2): 217–26. doi:10.1016 / s0378-1119 (99) 00211-5. PMID  10395894.
  14. ^ „Kde se nachází gen GYG1?“ [2].
  15. ^ van Maanen M, Fournier PA, Palmer TN, Abraham LJ (říjen 1999). "Charakterizace myšího glykogeninu-1 cDNA a promotorové oblasti". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1447 (2–3): 284–90. doi:10.1016 / s0167-4781 (99) 00159-1. PMID  10542328.

externí odkazy

  • van Maanen M, Fournier PA, Palmer TN, Abraham LJ (říjen 1999). "Charakterizace myšího glykogeninu-1 cDNA a promotorové oblasti". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1447 (2–3): 284–90. doi:10.1016 / s0167-4781 (99) 00159-1. PMID  10542328.
  • van Maanen MH, Fournier PA, Palmer TN, Abraham LJ (červenec 1999). "Charakterizace lidského genu pro glykogenin-1: identifikace svalové specifické regulační domény". Gen. 234 (2): 217–26. doi:10.1016 / s0378-1119 (99) 00211-5. PMID  10395894.