GHITM - GHITM
| GHITM | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasy | GHITM, DERP2, HSPC282, MICS1, PTD010, TMBIM5, My021, transmembránový protein indukovatelný růstovým hormonem | ||||||||||||||||||||||||
| Externí ID | MGI: 1913342 HomoloGene: 8667 Genové karty: GHITM | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortology | |||||||||||||||||||||||||
| Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
| Místo (UCSC) | Chr 10: 84,14 - 84,15 Mb | n / a | |||||||||||||||||||||||
| PubMed Vyhledávání | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Transmembránový protein indukovatelný růstovým hormonem (GHITM), také známý jako transmembránový motiv inhibitoru BAX obsahující protein 5 (TMBIM5), je protein že u lidí je kódován GHITM gen na chromozomu 10.[4][5][6] Je členem BAX inhibitor rodina obsahující motiv (TMBIM) a lokalizuje do vnitřní mitochondriální membrána (IMM), stejně jako endoplazmatické retikulum (ER), kde hraje roli v apoptóza prostřednictvím zprostředkování mitochondriální morfologie a cytochrom c uvolnění.[7][8] Prostřednictvím své apoptotické funkce může být GHITM zapojen do nádor metastáza a vrozený antivirový odpovědi.[9][10]
Struktura
Tento gen kóduje protein 37 kDa, který údajně obsahuje šest až osm transmembránový domén. Jako člen rodiny TMBIM sdílí GHITM transmembránový BAX inhibitor motiv, polohydrofobní transmembránová doména a podobná terciární struktura s dalšími pěti členy. Na rozdíl od ostatních členů má však GHITM jedinečný kyselé (D) místo a základní (H nebo R) zbytek poblíž jeho druhé transmembránové domény, stejně jako další transmembránová doména, která poté výstřih za zbytek 57 (SREY | A), signály pro lokalizaci do IMM.[7][8][9] Je nicméně možné, že štěpení na různých místech (motiv podobný XXRR (LAAR) v N-terminál a motiv podobný KKXX (GNRK) v C-terminál ) nebo alternativní sestřih může odpovídat za pozorovanou lokalizaci proteinu do ER.[8][9]
Funkce
GHITM je mitochondriální protein a člen rodiny TMBIM a nadrodiny inhibitorů BAX 1 (BI1).[7][8] Je to všudypřítomně vyjádřeno, ale obzvláště hojné je v mozek, srdce, játra, ledviny, a kosterní sval a vzácné v střeva a brzlík.[8] Tento protein se specificky lokalizuje na IMM, kde reguluje apoptózu dvěma samostatnými procesy: (1) řízení mitochondriální morfologie nezávislé na BAX a (2) uvolňování cytochromu c. V prvním procesu udržuje GHITM cristae organizace a její downregulace má za následek mitochondriální fragmentace, pravděpodobně indukcí fúze struktur cristae, což vede k uvolňování proapoptotických proteinů, jako je cytochrom c, Smac, a Htra2. Mezitím ve druhém procesu je GHITM zodpovědný za zesíťování cytochromu c na IMM a upregulace GHITM je spojena se zpožděným uvolňováním cytochromu c, bez ohledu na vnější mitochondriální membrána permeabilizace. GHITM tedy řídí uvolňování cytochrom c z mitochondrií a může potenciálně interferovat s apoptotickým procesem na podporu přežití buněk.[7][8] Kromě toho může GHITM dále hrát roli v apoptóze udržováním iont vápníku homeostáza v pohotovostním režimu. Přestože nadměrná exprese ostatních proteinů TMBIM vykazuje antiapoptotické účinky snížením koncentrací iontů vápníku a tím zabráněním přetížení mitochondriálních iontů vápníku, depolarizace, ATP ztráta, reaktivní formy kyslíku produkce, uvolňování cytochromu c a nakonec buněčná smrt, nadměrná exprese GHITM má opačný účinek.[8]
Klinický význam
GHITM může být zapojen do nádorových metastáz prostřednictvím svých interakcí s Bcl-2 rodinné proteiny k regulaci apoptózy.[9][10] Jeho role apoptotického regulátoru jej může také spojovat s vrozenými antivirovými odpověďmi.[10] Byla také pozorována nadměrná exprese GHITM, která urychluje stárnutí zpracovat v HIV infikovaných pacientů.[11]
Interakce
GHITM bylo prokázáno komunikovat s cytochrom c.[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165678 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
- ^ Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
- ^ „Entrez Gene: GHITM růstový hormon indukovatelný transmembránový protein“.
- ^ A b C d E Oka T, Sayano T, Tamai S, Yokota S, Kato H, Fujii G, Mihara K (červen 2008). „Identifikace nového proteinu MICS1, který se podílí na udržování mitochondriální morfologie a apoptotickém uvolňování cytochromu c“. Molekulární biologie buňky. 19 (6): 2597–608. doi:10,1091 / mbc.E07-12-1205. PMC 2397309. PMID 18417609.
- ^ A b C d E F G Lisak DA, Schacht T, Enders V, Habicht J, Kiviluoto S, Schneider J, Henke N, Bultynck G, Methner A (září 2015). „Transmembránový motiv inhibitoru Bax (TMBIM) obsahující proteinovou rodinu: tkáňová exprese, intracelulární lokalizace a účinky na stav plnění ER CA (2 +)“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1853 (9): 2104–14. doi:10.1016 / j.bbamcr.2015.03.002. PMID 25764978.
- ^ A b C d Zhou J, Zhu T, Hu C, Li H, Chen G, Xu G, Wang S, Zhou J, Ma D (červen 2008). "Srovnávací genomika a funkční analýza rodiny BI1". Výpočetní biologie a chemie. 32 (3): 159–62. doi:10.1016 / j.compbiolchem.2008.01.002. PMID 18440869.
- ^ A b C Li S, Wang L, Berman M, Kong YY, Dorf ME (září 2011). "Mapování dynamické vrozené imunity proteinové interakční sítě regulující produkci interferonu typu I". Imunita. 35 (3): 426–40. doi:10.1016 / j.immuni.2011.06.014. PMC 3253658. PMID 21903422.
- ^ Moni MA, Liò P (24. října 2014). „Síťová analýza rizika komorbidit během infekce: případové studie SARS a HIV“. BMC bioinformatika. 15: 333. doi:10.1186/1471-2105-15-333. PMC 4363349. PMID 25344230.
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.