Fasciclinová doména - Fasciclin domain
| Fasciclin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura roztoku antigenního tb proteinu mpt70 / mpb70 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Fasciclin | ||||||||
| Pfam | PF02469 | ||||||||
| InterPro | IPR000782 | ||||||||
| SCOP2 | 1o70 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se fasciclinová doména (Doména FAS1) je extracelulární doména asi 140 aminokyselina zbytky. Bylo navrženo, že doména FAS1 představuje starodávnou buněčná adheze společná doména rostliny a zvířata;[1] související domény FAS1 se také nacházejí v doméně bakterie.[2]
The Krystalická struktura FAS1 domén 3 a 4 fasciclin I z Drosophila melanogaster (Ovocná muška) byla stanovena a odhalila novou doménu složit skládající se ze sedmivláknového beta klínu a alespoň pěti alfa helixy; dva dobře objednané N-acetylglukosamin skupiny připojené ke konzervované asparagin jsou umístěny v oblasti rozhraní mezi dvěma doménami FAS1.[3] Fasciclin I je hmyz neurální molekula buněčné adheze zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho axonální pokyny, které jsou připojeny k membrána podle a Ukotveno GPI protein.
FAS1 domény jsou přítomny v mnoha vylučováno a zakotven v membráně bílkoviny. Tyto proteiny jsou obvykle ukotveny pomocí GPI a skládají se z: (i) jedné domény FAS1, (ii) tandemového pole domén FAS1 nebo (iii) domén (domén) FAS1 proložené jinými doménami.
Mezi proteiny, o nichž je známo, že obsahují doménu FAS1, patří:
- Fasciclin I (4 domény FAS1).
- Člověk TGF-beta indukovaný Ig-H3 (BIgH3 ) protein (4 domény FAS1), kde domény FAS1 zprostředkovávají buněčná adheze prostřednictvím interakce s alfa3 / beta1 integrin; mutace v doménách FAS1 má za následek dystrofie rohovky.[4]
- Volvox hlavní protein buněčné adheze (2 domény FAS1).[1]
- Arabidopsis thaliana jako fasciklin arabinogalaktan proteiny (2 domény FAS1).[5]
- Savčí stabilizinový protein, rodina podobná fasciklinům hyaluronan receptor homology (7 domén FAS1).[6]
- Člověk extracelulární matrix protein periostin (4 domény FAS1).
- Bakteriální imunogenní protein MPT70 (1 doména FAS1).[7]
Bylo zjištěno, že domény FAS1 jak lidského periostinu, tak proteinů BIgH3 obsahují vitamin K. -závislý gama-karboxyglutamát zbytky.[8] Gama-karboxyglutamát zbytky jsou častěji spojovány s GLA domény, kde k nim dochází prostřednictvím posttranslační modifikace katalyzováno vitamínem K závislým enzym gama-glutamylkarboxyláza.
Viz také
Reference
- ^ A b Huber O, Sumper M (září 1994). „Algal-CAMs: isoforms of a cell adhesive molecule in embryos of the alga Volvox with homology to Drosophila fasciclin I“. EMBO J.. 13 (18): 4212–22. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06741.x. PMC 395348. PMID 7925267.
- ^ Ulstrup JC, Jeansson S, Wiker HG, Harboe M (únor 1995). „Vztah sekrečního vzoru a homologie MPB70 s faktorem specifickým pro osteoblast 2 k osteitidě po očkování Mycobacterium bovis BCG“. Infikovat. Immun. 63 (2): 672–5. doi:10.1128 / IAI.63.2.672-675.1995. PMC 173047. PMID 7822037.
- ^ Clout NJ, Tisi D, Hohenester E (únor 2003). „Nové skládání odhalené strukturou páru domén FAS1 z adhezní molekuly hmyzí buňky fasciclin I“. Struktura. 11 (2): 197–203. doi:10.1016 / S0969-2126 (03) 00002-9. PMID 12575939.
- ^ Kim JE, Kim SJ, Lee BH, Park RW, Kim KS, Kim IS (říjen 2000). "Identifikace motivů pro buněčnou adhezi v opakovaných doménách genu transformujícího růstový faktor-beta, betaig-h3". J. Biol. Chem. 275 (40): 30907–15. doi:10,1074 / jbc.M002752200. PMID 10906123.
- ^ Faik A, Abouzouhair J, Sarhan F (listopad 2006). „Předpokládané fasciclinové arabinogalaktanové proteiny (FLA) v pšenici (Triticum aestivum) a rýži (Oryza sativa): identifikace a bioinformatické analýzy“. Mol. Genet. Genomika. 276 (5): 478–94. doi:10.1007 / s00438-006-0159-z. PMID 16944204. S2CID 24825276.
- ^ Kzhyshkowska J, Gratchev A, Martens JH, Pervushina O, Mamidi S, Johansson S, Schledzewski K, Hansen B, He X, Tang J, Nakayama K, Goerdt S (prosinec 2004). „Stabilin-1 se lokalizuje na endosomy a trans-Golgiho síť v lidských makrofázích a interaguje s adaptéry GGA“. J. Leukoc. Biol. 76 (6): 1151–61. doi:10.1189 / jlb.0504300. PMID 15345724. S2CID 20040432.
- ^ Matsumoto S, Matsuo T, Ohara N, Hotokezaka H, Naito M, Minami J, Yamada T (březen 1995). „Klonování a sekvenování jedinečného antigenu MPT70 z Mycobacterium tuberculosis H37Rv a exprese v BCG s použitím kyvadlového vektoru E. coli-mykobakterie“. Scand. J. Immunol. 41 (3): 281–7. doi:10.1111 / j.1365-3083.1995.tb03565.x. PMID 7871388. S2CID 12514892.
- ^ Coutu DL, Wu JH, Monette A, Rivard GE, Blostein MD, Galipeau J (červen 2008). „Periostin, člen nové rodiny proteinů závislých na vitaminu K, je exprimován mezenchymálními stromálními buňkami“. J. Biol. Chem. 283 (26): 17991–8001. doi:10,1074 / jbc.M708029200. PMID 18450759.