FERM doména - FERM domain
| FERM N-koncová doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura fermové domény merlina, tumor supresorového proteinu neurofibromatózy 2. | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | FERM_N | ||||||||
| Pfam | PF09379 | ||||||||
| Pfam klan | CL0072 | ||||||||
| InterPro | IPR018979 | ||||||||
| SCOP2 | 1gc7 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| OPM nadčeleď | 49 | ||||||||
| OPM protein | 1gc6 | ||||||||
| Membranome | 161 | ||||||||
| |||||||||
| FERM centrální doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura vazebné domény membrány proteinu 4.1r | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | FERM_M | ||||||||
| Pfam | PF00373 | ||||||||
| InterPro | IPR019748 | ||||||||
| SCOP2 | 1gc7 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd14473 | ||||||||
| |||||||||
| FERM C-koncová doména podobná PH | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura domény radixinového komplexu s cytoplasmatickým ocasem nep | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | FERM_C | ||||||||
| Pfam | PF09380 | ||||||||
| Pfam klan | CL0266 | ||||||||
| InterPro | IPR018980 | ||||||||
| SCOP2 | 1ef1 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00836 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se FERM doména (F pro 4,1 proteinu, E pro ezrin, R pro radixin a M pro moesin ) je velmi rozšířený protein modul zapojený do lokalizace bílkoviny do plazmatická membrána.[1] FERM domén se nacházejí v řadě cytoskeletální - přidružené bílkoviny které se sdružují s různými proteiny na rozhraní mezi plazmatická membrána a cytoskelet. Doména FERM se nachází na N konec ve většině proteinů, ve kterých se nachází.[1][2]
Struktura a funkce
Ezrin, moesin a radixin jsou vysoce příbuzné proteiny (Rodina proteinů ERM ), ale ostatní proteiny, ve kterých se nachází doména FERM, nesdílejí žádnou oblast podobnosti mimo tuto doménu. ERM proteiny jsou vyrobeny ze tří domén, domény FERM, centrální spirálovitý doména a C-koncová koncová doména, která se váže F-aktin. Aminokyselina sekvence FERM domény je mezi proteiny ERM vysoce konzervativní a je za ni zodpovědný membrána asociace přímou vazbou na cytoplazmatickou doménu nebo ocas integrální membránové proteiny. ERM proteiny jsou regulovány intramolekulární asociací FERM a C-koncového ocasu domén které maskují jejich vazebná místa pro ostatní molekuly. Při síťování cytoskeletů a membrán se spící molekuly aktivují a doména FERM se připojí k membráně vazbou specifických membránových proteinů, zatímco posledních 34 zbytky vazu ocasu aktinová vlákna. Kromě vazby na membrány může aktivovaná FERM doména ERM proteinů také vázat guanin nukleotid inhibitor disociace Rho GTPáza (RhoDGI), což naznačuje, že kromě funkce síťovadla mohou proteiny ERM ovlivňovat Rho signální dráhy. The Krystalická struktura domény FERM ukazuje, že se skládá ze tří strukturální moduly (F1, F2 a F3), které společně tvoří kompaktní jetel struktura.[3] N-terminální modul je ubikvitin -jako. C-terminální modul je a PH podobná doména.
Doména FERM byla také nazývána aminoterminální doména, 30kDa doména, 4.1N30, membránově-cytoskeletální spojovací doména, ERM-podobná doména, ezrinová doména superrodiny pásma 4.1, konzervovaný N-koncová oblast a připojovací doména membrány.[1]
Příklady
Mezi proteiny obsahující FERM doménu patří:
- Pásmo 4.1, který spojuje spektrin -aktin cytoskelet z erytrocyty do plazmatická membrána.
- Ezrin, součást podsady mikrovilli plazmatická membrána.
- Moesin, který se pravděpodobně podílí na vazbě major cytoskeletální struktury k plazmatické membráně.
- Radixin, který se podílí na vázání ostnatého konce aktinová vlákna na plazmatickou membránu v podkladové vrstvě z buňky do buňky Adherens křižovatka.
- Talin, a cytoskeletální protein koncentrovaný v oblastech kontaktu buněčný substrát a v lymfocyty kontaktů buňka-buňka.
- Filopodin, a slizová forma protein, který váže aktin a která se podílí na kontrole pohyblivost buněk a chemotaxe.
- Merlin (nebo schwannomin).
- Protein NBL4.
- Nekonvenční myosiny X, VIIa a XV, které jsou zmutovaný v kongenitální hluchota.
- Kinázy s ohniskovou adhezí (FAK), cytoplazmatický proteinové tyrosinkinázy podílí se na signalizaci skrz integriny.
- Janus tyrosin kinázy (JAK), cytoplazmatický tyrosin kinázy které nejsou kovalentně spojeny s cytoplazmatickými konci ocasu receptory pro cytokiny nebo polypeptidové hormony.
- Nereceptorová tyrosin-protein kináza TYK2.
- Protein-tyrosin fosfatázy PTPN3 a PTPN4, enzymy které působí na spojích mezi membránou a cytoskeletem.
- Protein-tyrosin fosfatázy PTPN14 a PTP-D1, PTP-RL10 a PTP2E.
- Caenorhabditis elegans protein fosfatáza ptp-1.
Reference
- ^ A b C Chishti AH, Kim AC, Marfatia SM, Lutchman M, Hanspal M, Jindal H, Liu SC, Low PS, Rouleau GA, Mohandas N, Chasis JA, Conboy JG, Gascard P, Takakuwa Y, Huang SC, Benz EJ, Bretscher A Fehon RG, Gusella JF, Ramesh V, Solomon F, Marchesi VT, Tsukita S, Tsukita S, Hoover KB (srpen 1998). "FERM doména: jedinečný modul zapojený do vazby cytoplazmatických proteinů na membránu". Trends Biochem. Sci. 23 (8): 281–2. doi:10.1016 / S0968-0004 (98) 01237-7. PMID 9757824.
- ^ Pearson MA, Reczek D, Bretscher A, Karplus PA (duben 2000). "Struktura proteinu ERM moesinu odhaluje záhyb domény FERM maskovaný prodlouženou ocasovou doménou vázající ocas". Buňka. 101 (3): 259–70. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80836-3. PMID 10847681. S2CID 7119092.
- ^ Hamada K, Shimizu T, Matsui T, Tsukita S, Hakoshima T (září 2000). „Strukturální základ mechanismů zaměřování a demaskování membrány domény FERM radixinu“. EMBO J.. 19 (17): 4449–62. doi:10.1093 / emboj / 19.17.4449. PMC 302071. PMID 10970839.