Přímé opakování - Direct repeat
Přímé opakování jsou typem genetické sekvence, která se skládá ze dvou nebo více opakování určité sekvence.[1] Jinými slovy, přímé opakování je nukleotid sekvence přítomné ve více kopiích v souboru genom. Přímé opakování obecně nastává, když se sekvence opakuje se stejným vzorem po směru toku.[1] S přímým opakováním není spojena žádná inverze ani reverzní komplement. Může nebo nemusí mít intervenující nukleotidy. Nukleotidová sekvence napsaná tučnými písmeny znamená opakovanou sekvenci.
- 5´ TTACGnnnnnnTTACG 3´
- 3´ AATGCnnnnnnAATGC 5´
Jazykově je typické přímé opakování srovnatelné se slovy „bye-bye“.[1]
Typy
Existuje několik typů opakovaných sekvencí:
- Proložené (nebo rozptýlené) repetice DNA (proložené opakující se sekvence) jsou kopie transponovatelné prvky rozptýleny po celém genomu.
- Lemující (nebo terminální) repetice (terminální repetiční sekvence) jsou sekvence, které se opakují na obou koncích sekvence, například dlouhé opakování terminálu (LTR) zapnuto retroviry. Přímé koncové repetice jsou ve stejném směru a invertované koncové repetice jsou proti sobě ve směru.
- Tandemové opakování (tandemové opakované sekvence) jsou opakované kopie, které leží vedle sebe. Mohou to být také přímé nebo obrácené opakování. The ribozomální RNA a přenos RNA geny patří do třídy střední repetitivní DNA.
Viz také
Reference
- ^ A b C Ussery, David W .; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano (22. 12. 2008). "Frekvence slov, opakování a struktury související s opakováním v bakteriálních genech". Výpočet pro srovnávací mikrobiální genomiku: Bioinformatika pro mikrobiology. Výpočetní biologie. 8 (1. vyd.). Springer. str. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8.
 | Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |