Benjamin Cravatt III - Benjamin Cravatt III

Benjamin F Cravatt
Známý jakoProteomika
Vědecká kariéra
PoleChemická biologie
InstituceVýzkumný ústav Scripps
Vividion Therapeutics
ActivX Biosciences
Dodržujte terapeutika
Doktorští poradciDale L. Boger, Richard Lerner

Benjamin Franklin Cravatt III je profesorem na katedře chemie na Výzkumný ústav Scripps v La Jolla, Kalifornie.[1] Považován za spoluautor vynálezu na základě aktivity proteomika a významně přispívá k výzkumu na internetu endokanabinoidní systém, je prominentní osobností v rodící se oblasti chemická biologie. Cravatt byl zvolen do Národní akademie věd v roce 2014,[1] a Americká akademie umění a věd v roce 2016.[2] Je Gilula předsedou chemické biologie, Cope Scholar a Searle Scholar.

Cravattův otec byl zubař a jeho matka a dentální hygienista, oba v Cravattu jako dítě vzbudili zájem o biologii.[1]

Cravatt vstoupil Stanfordská Univerzita v roce 1988, kterou ukončil v roce 1992 a BS v biologických vědách a BA v historii.[1][3] Poté obdržel a PhD v makromolekulární a buněčné struktuře a chemii z Výzkumný ústav Scripps v roce 1996,[1] kde pracoval pod společným dohledem Dale L. Boger a Richard Lerner. Jeho rané příspěvky do kanabinoid pole zahrnuje identifikaci a charakterizaci endokanabinoid-zakončujícího enzymu amid mastné kyseliny hydroláza (FAAH),[1] stejně jako izolace nové uspávací sloučeniny oleamid z mozkomíšní mok.[4][5]

Cravatt a jeho kolegové byli průkopníky profilování proteinů na základě aktivity (ABPP) chemická proteomická technologie, kterou použili v roce 2010 k objasnění určitých globálních proteomických rysů cysteinů.[1] Cravattova laboratoř od té doby kombinuje technologii ABPP s metabolomika.[1]

Mezi ocenění, která Cravatt získal, patří TR100 Cena v roce 2002, Cena Eli Lilly v biologické chemii v roce 2004 Cena ASBMB-Merck v roce 2014 a Sato Memorial Award v roce 2015.[1] Cravatt také obdržel NCI VÝHODY grant v roce 2009.[1]

Cravatt je spoluzakladatelem společnosti Vividion Therapeutics, Dodržujte terapeutika a ActivX Biosciences. V současné době působí jako pomocný redaktor pro Journal of the American Chemical Society a dříve sloužil ve stejné funkci pro Chemická věda.

PROTOMAP

PROTOMAP je nedávno vyvinutý proteomický technologie pro identifikaci změn proteinů, které se projeví změnou jednorozměrné migrace SDS-PAGE. Je to koncepčně podobné dvourozměrná gelová elektroforéza a diferenční gelová elektroforéza v tom, že umožňuje globální identifikaci změněných proteinů elektroforetický migrace vyplývající například z proteolýza nebo posttranslační modifikace. Je však jedinečný v tom, že všechny proteiny jsou sekvenovány pomocí hmotnostní spektrometrie který poskytuje informace o sekvenčním pokrytí detekovaném v každé izoformě každého proteinu, čímž usnadňuje interpretaci proteolytických událostí.[6]

PROTOMAP se provádí řešením kontrolních a experimentálních vzorků v samostatných drahách 1D SDS-PAGE gel. Každý pruh je rozřezán na rovnoměrně rozmístěné pásy (obvykle 15-30 pásů) a proteiny v těchto pásmech jsou sekvenovány pomocí brokovnice proteomika. Sekvenční informace ze všech těchto pásem jsou bioinformaticky integrovaný do vizuálního formátu zvaného a peptograf který vykresluje migraci gelu ve svislé dimenzi (vysoká až nízkomolekulární hmotnost, shora dolů) a pokrytí sekvence ve vodorovné dimenzi (N- na C-konec, zleva doprava). Pro každý protein ve vzorku je generován peptograf (tisíce peptografů jsou generovány z jednoho experimentu) a tento datový formát umožňuje rychlou identifikaci proteinů podstupujících proteolytické štěpení provedením evidentních změn v migraci gelu, které jsou doprovázeny změněnou topografií.

PROTOMAP znamená Platforma TOpografie a analýza migrace proteinů a byl vynalezen a vyvinut společností Ben Cravatt a kolegové v Výzkumný ústav Scripps.[7]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C d E F G h i j Viegas, Jennifer (2. února 2016). „Profil Benjamina Cravatta“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (5): 1109–11. doi:10.1073 / pnas.1525099113. PMC  4747733. PMID  26811454.
  2. ^ „Členové Národní akademie věd a zvolení zahraniční spolupracovníci“ (Tisková zpráva). USA: Národní akademie věd. 29. dubna 2014. Archivovány od originál dne 18. srpna 2015. Citováno 2016-12-31. Cravatt, Benjamin F .; profesor a předseda katedry chemické fyziologie, The Scripps Research Institute, La Jolla, Kalifornie.
  3. ^ Bogyo, Matthew; Cravatt, Benjamin F. (únor 2007). „Genomika a proteomika: Od genů k funkcím: pokrok v aplikacích chemické a systémové biologie“. Aktuální názor na chemickou biologii (Redakční přehled). 11: 1–3. doi:10.1016 / j.cbpa.2006.12.029.
  4. ^ Cravatt, B.F .; Giang, D.K .; Mayfield, S.P .; Boger, D.L .; Lerner, R.A. (7. listopadu 1996). „Molekulární charakterizace enzymu, který degraduje neuromodulační amidy mastných kyselin“. Příroda. 384 (6604): 83–7. doi:10.1038 / 384083a0. PMID  8900284.
  5. ^ Cravatt, BF; Prospero-Garcia, O; Siuzdak, G; Gilula, NB; Henriksen, SJ; Boger, DL; Lerner, RA (9. června 1995). "Chemická charakterizace rodiny mozkových lipidů, které indukují spánek". Věda. 268 (5216): 1506–9. doi:10.1126 / science.7770779. PMID  7770779.
  6. ^ Johnson CE, Kornbluth S (září 2008). "Štěpení Caspase není pro každého". Buňka. 134 (5): 720–1. doi:10.1016 / j.cell.2008.08.019. PMID  18775303.
  7. ^ Dix MM, Simon GM, Cravatt BF (srpen 2008). „Globální mapování topografie a rozsahu proteolytických událostí u apoptózy“. Buňka. 134 (4): 679–91. doi:10.1016 / j.cell.2008.06.038. PMC  2597167. PMID  18724940.

externí odkazy