Rodina proteinů odolných vůči akriflavinu - Acriflavine resistance protein family
| ACR_tran | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 strukturální základ vícenásobné vazebné kapacity acrb multidrug efluxní pumpy | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ACR_tran | ||||||||
| Pfam | PF00873 | ||||||||
| Pfam klan | CL0322 | ||||||||
| InterPro | IPR001036 | ||||||||
| SCOP2 | 1oy6 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 2.A.6 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 16 | ||||||||
| OPM protein | 2gif | ||||||||
| |||||||||
The Escherichia coli Rezistence na akriflavin (geny acrA a acrB) kódují více drog výtok systém, o kterém se předpokládá, že chrání bakterii před hydrofobizací inhibitory.[1] E. coli AcrB protein je přepravce která je napájena protonově-hnací silou a která je nejširší Podklad specifičnost mezi všemi známými multidrogovými pumpami, od většiny aktuálně používaných antibiotik, dezinfekčních prostředků, barviv a detergentů až po jednoduché rozpouštědla.
The struktura AcrB bez ligandů ukazuje, že se jedná o a homotrimer 110 kDa na podjednotku. Každá podjednotka obsahuje 12 transmembránový šroubovice a dvě velké periplazmatické domén (každý přesahuje 300 zbytků) mezi helixy 1 a 2 a helixy 7 a 8. rentgen analýza nadměrně vyjádřený Protein AcrB prokázal, že tři periplazmatické domén forma, ve středu, jako trychtýř struktura a připojený úzký (nebo uzavřený) pór. Pór se otevírá do periplazmy třemi vestibuly umístěnými na rozhraní podjednotky. Tyto předsíně byly navrženy tak, aby umožňovaly přímý přístup k léky z periplazmy i vnějšího letáku cytoplazmatická membrána. Strom transmembránové domény protromerů AcrB tvoří velkou centrální dutinu širokou 30A, která pokrývá cytoplazmatický membrána a rozšiřuje se na cytoplazma
Rentgenová krystalografická struktur trimerní pumpy AcrB od E. coli se čtyřmi strukturálně různorodý ligandy prokázal, že tři molekuly z ligand svázat současně do extrémně velké centrální dutiny 5000 kubických angstromů, primárně hydrofobními, aromatickými vrstvami a van der Waalsovými interakcemi. Každý ligand používá mírně odlišnou podmnožinu AcrB zbytky pro vazba. Svázaný ligand molekuly často komunikovat navzájem stabilizují vazbu.
Reference
- ^ Ma D, Cook DN, Alberti M, Pon NG, Nikaido H, Hearst JE (říjen 1993). "Molekulární klonování a charakterizace genů acrA a acrE Escherichia coli". J. Bacteriol. 175 (19): 6299–313. doi:10.1128 / jb.175.19.6299-6313.1993. PMC 206727. PMID 8407802.
externí odkazy
Média související s Rodina proteinů odolných vůči akriflavinu na Wikimedia Commons
Média související s