Kvasnicový mitochondriální kód - Yeast mitochondrial code
The kvasnicový mitochondriální kód (překladová tabulka 3) je genetický kód používá mitochondriální genom kvasinek, zejména Saccharomyces cerevisiae, Candida glabrata, Hansenula saturnus, a Kluyveromyces thermotolerans.[1]
Kód
AA = FFLLSSSSYY ** CCWWTTTTPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGGZačíná = --- M --------------- M --------------- M ------------- --M ------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Základy: adenin (A), cytosin (C), guanin (G) a tymin (T) nebo uracil (U).
Aminokyseliny: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Kyselina asparagová (Asp, D), Cystein (Cys, C), Kyselina glutamová (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glycin (Gly, G), Histidin (Jeho, H), Isoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lysin (Lys, K), Methionin (Met, M), Fenylalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonin (Thr, T), Tryptofan (Trp, W), Tyrosin (Tyr, Y), Valine (Val, V).
Rozdíly od standardního kódu
| Kodony DNA | Kodony RNA | Tento kód (3) | Standardní kód (1) | |
|---|---|---|---|---|
| ATA | AUA | Setkal (M) | Ile (I) | |
| CTT | CUU | Thr (T) | Leu (L) | |
| CTC | CUC | Thr (T) | Leu (L) | |
| CTA | CUA | Thr (T) | Leu (L) | |
| CTG | CUG | Thr (T) | Leu (L) | |
| TGA | UGA | Trp (Ž) | STOP = Ter (*) | |
| CGA | CGA | Nepřítomen | Arg (R) | |
| CGC | CGC | Nepřítomen | Arg (R) |
- Zbývající CGN kodony jsou vzácné Saccharomyces cerevisiae [2] a chybí v Candida glabrata.
- Kodon AUA je v genu běžný var1 kódování pro jediný mitochondriální ribozomální protein, ale vzácné v genech kódujících enzymy.
- Přiřazení kódování AUA (Met nebo Ile) a CUU (případně Leu, ne Thr) jsou nejisté Hansenula saturnus.
- Přiřazení kódování Thr k CUN je nejisté Kluyveromyces thermotolerans.
Viz také
Reference
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.[3]
- ^ Clark-Walker, G. D .; Weiller, G. F. (1994). "Struktura malé mitochondriální DNA Kluyveromyces thermotolerans pravděpodobně odráží pořadí genů předků v houbách “. Journal of Molecular Evolution. 38 (6): 593–601. doi:10.1007 / bf00175879. PMID 8083884.
- ^ Susan G. Bonitz, Roberta Berlani, Gloria Coruzzi, May Li, Giuseppe Macino, Francisco G. Nobrega, Marina P. Nobrega, Arbara E. Thalenfeld a Alexander Tzagoloff (červen 1980). „Pravidla pro rozpoznávání kodonů v kvasinkových mitochondriích“ (PDF). Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 77 (6): 3167–3170. doi:10.1073 / pnas.77.6.3167. PMC 349575. PMID 6997870.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
- ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. „Genetické kódy“. Prohlížeč taxonomie. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine. Citováno 30. dubna 2015.