Tunavirus - Tunavirus
| Tunavirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Drexlerviridae |
| Podčeleď: | Tunavirinae |
| Rod: | Tunavirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Escherichia T1 | |
Tunavirus (synonyma Fágy podobné T1, Viry podobné T1, Tunalikevirus) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Drexlerviridae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje 14 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Virus Escherichia T1.[1][2][3]
Taxonomie
Rozeznávají se tyto druhy:[2]
- Virus Escherichia ADB2
- Virus Escherichia BIFF
- Virus Escherichia IME18
- Virus Escherichia JMPW1
- Virus Escherichia JMPW2
- Virus Escherichia SH2
- Virus Escherichia T1
- Virus Shigella 008
- Virus Shigella ISF001
- Virus Shigella PSf2
- Virus Shigella Sfin1
- Virus Shigella SH6
- Virus Shigella Shfl1
- Virus Shigella ISF002
Struktura
Tunaviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava má průměr asi 60 nm. Ocas je asi 151 nm dlouhý, 8 nm široký. Je nekontrakční, flexibilní a má čtyři krátká zauzlená koncová vlákna.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Tunavirus | Hlava-ocas | T = 7 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Genom
Genomy jsou kruhové a mají délku přibližně 50 kB.[1] Typový druh, Virus Escherichia T1a pět dalších druhů bylo plně sekvenováno. Pohybují se mezi 45–51 000 nukleotidy s 45–87 proteiny. K dispozici jsou kompletní genomy a další dva podobné neklasifikované genomy tady.[3]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se pomocí svých koncových vláken váže na adhezní receptor hostitelské buňky FhuA a prostřednictvím virové DNA vysílá do hostitelské cytoplazmy dlouhý flexibilní systém vyhazování ocasu. Replikace se řídí replikačním modelem transpozice. Transkripce založená na DNA je metoda transkripce. Jakmile jsou virové geny replikovány, je prokapsid shromážděn a zabalen. Ocas se poté sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy a proteinů holin / endolysin / spanin. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tunavirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Dějiny
Podle ICTV je Zpráva z roku 1996 rod Tunalikevirus byl poprvé přijat pod jménem Fágy podobné T1, přiřazeno pouze rodině Siphoviridae. Celá rodina byla přesunuta na objednávku Caudovirales v roce 1998 a rod byl přejmenován na Viry podobné T1 v ICTV 7. zpráva v roce 1999. V 2012, bylo opět přejmenováno na Tunalikevirus.[4] Rod byl později přejmenován na Tunavirus a umístěny do nově založené rodiny Drexlerviridae.
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 5. května 2020.
- ^ A b NCBI. "Tunalikevirus Complete Genomes". Citováno 11. března 2015.
- ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 11. března 2015.