Triadin - Triadin

TRDN
Identifikátory
AliasyTRDN, CPVT5, TDN, TRISK, triadin
Externí IDOMIM: 603283 MGI: 1924007 HomoloGene: 38137 Genové karty: TRDN
Umístění genu (člověk)
Chromozom 6 (lidský)
Chr.Chromozom 6 (lidský)[1]
Chromozom 6 (lidský)
Genomické umístění pro TRDN
Genomické umístění pro TRDN
Kapela6q22.31Start123,216,339 bp[1]
Konec123,637,093 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

10345

76757

Ensembl

ENSG00000186439

ENSMUSG00000019787

UniProt

Q13061

E9Q9K5

RefSeq (mRNA)

NM_001251987
NM_001256020
NM_001256021
NM_001256022
NM_006073

NM_029726
NM_001364696
NM_001364697

RefSeq (protein)

NP_084002
NP_001351625
NP_001351626

Místo (UCSC)Chr 6: 123,22 - 123,64 MbChr 10: 33,08 - 33,48 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Triadin, také známý jako TRDN, je člověk gen[5] spojené s uvolňováním iontů vápníku z sarkoplazmatické retikulum spouštění svalové kontrakce uvolňování vápníku indukované vápníkem. Triadin je rodina více proteinů, která vzniká při odlišném zpracování genu TRDN chromozom 6.[6] Jedná se o transmembránový protein na sarkoplazmatickém retikulu díky dobře definované hydrofobní části[7][8] a tvoří kvartérní komplex se srdcem ryanodinový receptor (RYR2 ), calsequestrin (CASQ2 ) a junktin bílkoviny.[7][8][9][10] The luminální (vnitřní část sarkoplazmatického retikula) část Triadinu má oblasti vysoce nabitých aminokyselinových zbytků, které působí jako luminální Ca2+ receptory.[7][8][10] Triadin je také schopen vnímat luminální Ca2+ koncentrace zprostředkováním interakcí mezi RYR2 a CASQ2.[9] Triadin má několik různé formy; Trisk 95 a Trisk 51, které jsou exprimovány v kosterním svalu, a Trisk 32 (CT1), který je exprimován hlavně v srdečním svalu.[11]


Interakce

TRDN bylo prokázáno komunikovat s RYR1.[12][13][14][15]

Triadin je povinen fyzicky propojit RYR2 a proteiny CASQ2, takže aktivitu kanálu RYR2 lze regulovat pomocí CASQ2.[16] K vazbě RYR2 s CASQ2 dochází prostřednictvím vysoce nabitých luminálních sekcí triadinu[10] které jsou charakterizovány jako střídající se pozitivně a negativně nabité aminokyseliny, známé jako motiv KEKE.[8][9][10][17]

Luminální koncentrace Ca2+ jsou snímány pomocí CSQ a tyto informace jsou přenášeny do RyR přes Triadin. Při nízkém luminálním Ca2+ koncentrací je triadin vázán na RYR2 i CASQ2, takže CSQ brání otevření RYR2. Při vysokém luminálním Ca2+ koncentrace, Ca2+ vazebná místa na CASQ2 jsou obsazena Ca2+, což vede k oslabené interakci mezi CASQ2 a Triadinem. Tím se odstraní schopnost CASQ2 mít inhibiční účinek na aktivitu kanálu RYR2. Jako více Ca2+ vazebná místa na CASQ2 jsou obsazena, zvyšuje se pravděpodobnost otevření kanálu RYR2. Nakonec se CASQ2 úplně disociuje od triadinu a kanál RYR2 se stává zcela bez zábran, i když triadin zůstává vázán na RYR2 při všech luminálních koncentracích Ca2+.[16]

Vztah ke katecholaminergní polymorfní komorové tachykardii

Většina mutací, které vedou k CPVT se nacházejí v genech RYR2 nebo CASQ2, avšak třetina pacientů s CPVT nemá mutace v žádném z těchto proteinů, takže mutace v Triadinu je nejpravděpodobnější příčinou[18] Protože triadin je nezbytný při regulaci Ca2+ uvolnění kanálem RyR během srdeční kontrakce, mutace, která brání vzniku triadinu, způsobí, že CASQ2 nebude schopen inhibovat aktivitu kanálu RYR2, což umožní Ca2+ úniky a vývoj CPVT.[18]

Vymazání aminokyseliny v genu TRDN může vést k brzkému stop kodon.[18] Předčasné stop kodon může buď zabránit gen z translace na protein triadin, nebo může vést ke zkrácenému nefunkčnímu proteinu triadinu.[18] Náhrada aminokyseliny Arginin pro aminokyselinu Threonin v poloze 59 genu TRDN (pT59R) způsobuje nestabilitu triadinu, což vede k degradaci proteinu.[18] Jakákoli z těchto přirozeně se vyskytujících mutací vede k nepřítomnosti funkčního triadinového proteinu, což vede u pacientů k CPVT.[18]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000186439 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019787 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Entrez Gene: TRDN triadin“.
  6. ^ Thevenon, D .; Smida-Rezgui, S .; Chevessier, F .; Groh, S .; Henry-Berger, J .; Romero, N. B .; Villaz, M .; De Waard, M; Marty, I (2003). „Triadin lidského kosterního svalstva: genová organizace a klonování hlavní izoformy, Trisk 51“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (12): 669–675. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 00406-6. PMID  12659871.
  7. ^ A b C Kobayashi, Y. M .; Jones, L. R. (1999). „Identifikace triadinu 1 jako převládající izoformy triadinu exprimovaná v savčím myokardu“. J. Biol. Chem. 274 (40): 28660–28668. doi:10.1074 / jbc.274.40.28660. PMID  10497235.
  8. ^ A b C d Jones, L. R .; Zhang, L .; Sanborn, K .; Jorgensen, A. O .; Kelley., J. (1995). „Čištění, primární struktura a imunologická charakterizace 26-kDa proteinu vázajícího kalsequestrin (junktin) ze srdečního junkčního sarkoplazmatického retikula“. J. Biol. Chem. 270 (51): 30787–30796. doi:10.1074 / jbc.270.51.30787. PMID  8530521.
  9. ^ A b C Zhang, L .; Kelley, J .; Schmeisser, G .; Kobayashi, Y. M .; Jones, L. R. (1997). "Komplexní tvorba mezi junktinem, triadinem, kalsequestrinem a receptorem ryanodinu. Proteiny srdeční junkční sarkoplazmatické retikulární membrány". J. Biol. Chem. 272 (37): 23389–23397. doi:10.1074 / jbc.272.37.23389. PMID  9287354.
  10. ^ A b C d Kobayashi, Y. M .; Alseikhan, B. A .; Jones, L. R. (2000). „Lokalizace a charakterizace domény vázající kalsequestrin na triadin 1. Důkazy o nabitém beta-řetězci ve zprostředkování interakce protein-protein“. J. Biol. Chem. 275 (23): 17639–17646. doi:10,1074 / jbc.M002091200. PMID  10748065.
  11. ^ Marty, I .; Fauré, J .; Fourest-Lieuvin, A .; Vassilopoulos, S .; Oddoux, S .; Brocard, J. (2009). „Triadin: jaká možná funkce o 20 let později?“. J. Physiol. 587 (13): 3117–3121. doi:10.1113 / jphysiol.2009.171892. PMC  2727022. PMID  19403623.
  12. ^ Lee, Jae Man; Rho Seong-Hwan; Shin Dong Wook; Cho Chunghee; Park Woo Jin; Eom Soo Hyun; Ma Jianjie; Kim Do Han (únor 2004). „Negativně nabité aminokyseliny v intraluminální smyčce ryanodinového receptoru jsou zapojeny do interakce s triadinem“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 279 (8): 6994–7000. doi:10,1074 / jbc.M312446200. ISSN  0021-9258. PMID  14638677.
  13. ^ Caswell, AH; Motoike H K; Ventilátor H; Brandt NR (leden 1999). "Umístění vazebného místa receptoru ryanodinu na triadinu kosterního svalstva". Biochemie. Spojené státy. 38 (1): 90–7. doi:10.1021 / bi981306 +. ISSN  0006-2960. PMID  9890886.
  14. ^ Guo, W; Campbell KP (duben 1995). „Sdružení triadinu s receptorem ryanodinu a kalsequestrinem v lumenu sarkoplazmatického retikula“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 270 (16): 9027–30. doi:10.1074 / jbc.270.16.9027. ISSN  0021-9258. PMID  7721813.
  15. ^ Groh, S; Marty I; Ottolia M; Prestipino G; Kaple A; Villaz M; Ronjat M (duben 1999). „Funkční interakce cytoplazmatické domény triadinu s kostním ryanodinovým receptorem“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 274 (18): 12278–83. doi:10.1074 / jbc.274.18.12278. ISSN  0021-9258. PMID  10212196.
  16. ^ A b Gyorke, I .; Hester, N .; Jones, L. R .; Gyorke, S. (2004). „Role kalsequestrinu, triadinu a junktinu při poskytování reakce na srdeční Ryanodinový receptor na luminální vápník“. Biofyzikální deník. 86 (4): 2121–2128. Bibcode:2004BpJ .... 86,2121G. doi:10.1016 / S0006-3495 (04) 74271-X. PMC  1304063. PMID  15041652.
  17. ^ Shin, D. W .; Ma, J .; Kim, D. H. (2000). „Oblast bohatá na asp na karboxylovém konci kalsequestrinu se váže na Ca2+ a interaguje s triadinem ". FEBS Lett. 486 (2): 178–182. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02246-8. PMID  11113462. S2CID  3135618.
  18. ^ A b C d E F Roux-Buisson, N .; Cacheux, M .; Fourest-Lieuvin, A .; Fauconnier, J .; Brocard, J .; Denjoy, I .; Durand, P .; Guicheney, P .; Kyndt, F .; Leenhardt, A .; Le Marec, H .; Lucet, V .; Mabo, P .; Probst, V .; Monnier, N .; Ray, P.F .; Santoni, E .; Tremeaux, P .; Lacampagne, A .; Faure, J .; Lunardi, J .; Marty, I. (2012). „Absence triadinu, proteinu komplexu uvolňujícího vápník, je zodpovědná za srdeční arytmii s náhlou smrtí u člověka“. Lidská molekulární genetika. 21 (12): 2759–2767. doi:10,1093 / hmg / dds104. PMC  3363337. PMID  22422768.

Další čtení

externí odkazy