Tequintavirus - Tequintavirus - Wikipedia
| Tequintavirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Demerecviridae |
| Podčeleď: | Markadamsvirinae |
| Rod: | Tequintavirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Escherichia T5 | |
Tequintavirus (synonyma Fágy podobné T5, Viry podobné T5, T5likevirus) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Demerecviridae. Bakterie slouží jako přirozený hostitel s přenosem dosaženým pasivní difúzí. V současné době existuje 22 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Virus Escherichia T5.[1][2][3]
Taxonomie
Rozeznávají se tyto druhy:[2]
- Virus Escherichia AKFV33
- Virus Escherichia BF23
- Virus Escherichia chee24
- Virus Escherichia DT5712
- Virus Escherichia DT57C
- Virus Escherichia FFH1
- Virus Escherichia Gostya9
- Virus Escherichia H8
- Virus Escherichia mar004NP2
- Virus Escherichia OSYSP
- Virus Escherichia phiAPCEc03
- Viry Escherichia phiLLS
- Virus Escherichia slur09
- Virus Escherichia T5
- Virus Salmonella NR01
- Virus Salmonella S131
- Virus Salmonella Shivani
- Virus Salmonella SP01
- Virus Salmonella SP3
- Virus Salmonella SPC35
- Virus Shigella SHSML45
- Virus Shigella SSP1
Struktura
Tequintaviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava je ikosaedrální (T = 13) a má průměr asi 90 nm. Ocas je dlouhý asi 180 nm, široký 9 nm. Má tři dlouhá, zauzlená koncová vlákna o délce přibližně 120 nm a jedno přímé centrální vlákno připojené ke kónickému hrotu.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Tequintavirus | Hlava-ocas | T = 13 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Genom
Genomy jsou lineární, mají délku kolem 121 kB.[1] Druhy typu, Enterobacteria phage T5 a několik dalších druhů byly plně sekvenovány. Genomy se pohybují mezi zhruba 108-121 tisíci nukleotidů, přičemž se předpokládá přibližně 140 až 170 otevřené čtecí rámce. K dispozici jsou kompletní genomy a další dva podobné neklasifikované genomy tady.[3][4]
Životní cyklus
Virus se připojuje k adhezním receptorům hostitelské buňky pomocí svých koncových vláken a degraduje buněčnou stěnu pomocí virového exolysinu natolik, aby virovou DNA vysunul do cytoplazmy hostitele prostřednictvím dlouhý flexibilní systém vyhazování ocasu. Replikace sleduje vytěsnění řetězce DNA pomocí modelu replikativní transpozice. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Jakmile jsou virové geny replikovány, je prokapsid shromážděn a zabalen. Ocas se poté sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tequintavirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Dějiny
Podle ICTV je Zpráva z roku 1996 rod T5likevirus byl poprvé přijat pod jménem Fágy podobné T5, přiřazeno pouze rodině Siphoviridae. Celá rodina byla přesunuta na objednávku Caudovirales v roce 1998 a rod byl přejmenován na Viry podobné T5 v ICTV 7. zpráva v roce 1999. V 2012, bylo opět přejmenováno na T5likevirus.[2] Rod byl později přejmenován na Tequintavirus a umístěny do nově založené rodiny Demerecviridae.
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 11. března 2015.
- ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 5. května 2020.
- ^ A b NCBI. „T5likevirus Complete Genomes“. Citováno 11. března 2015.
- ^ Rabsch, W .; Ma, L .; Wiley, G .; Najar, F. Z .; Kaserer, W .; Schuerch, D. W .; Klebba, J. E .; Roe, B. A .; Gomez, J. A. L .; Schallmey, M .; Newton, S. M. C .; Klebba, P. E. (25. května 2007). „Bakteriofág H8 závislý na FepA a TonB: Vazba na receptory a genomová sekvence“. Journal of Bacteriology. 189 (15): 5658–5674. doi:10.1128 / JB.00437-07. PMC 1951831. PMID 17526714.