Spbetavirus - Spbetavirus

Spbetavirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Duplodnaviria
Království:Heunggongvirae
Kmen:Uroviricota
Třída:Caudoviricetes
Objednat:Caudovirales
Rodina:Siphoviridae
Rod:Spbetavirus
Zadejte druh
Bacillus virus SPbeta
Druh[1]

Bacillus virus SPbeta

Synonyma
  • Spbetalikevirus[2]
    • Fág Bacillus SPbeta[3]

Spbetavirus (dříve Spbetalikevirus a někdy Viry podobné SPbeta) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Siphoviridae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje pouze jeden druh v tomto rodu: druh druhu Bacillus virus SPbeta.[1][4][5][6]

Struktura

Spbetaviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava má průměr přibližně 81 nm. Ocas je dlouhý, ale poměrně tuhý, přibližně 355 nm dlouhý a 10 nm široký. Má šest koncových vláken ve tvaru klubu a bez límce.[4]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
SpbetavirusHlava-ocasT = 7NeobalenéLineárníMonopartitní

Genom

Genomy jsou lineární, mají délku přibližně 134 kB.[4] Typový typ, Bacillus phage SPbeta, byl plně sekvenován. Má asi 134 000 nukleotidů se 185 proteiny. K dispozici je celý genom tady[6]

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se připojuje k adhezním receptorům hostitelské buňky pomocí svého terminálního vlákna a degraduje buněčnou stěnu pomocí virového exolysinu natolik, aby virovou DNA vysunul do cytoplazmy hostitele prostřednictvím dlouhý flexibilní systém vyhazování ocasu. Replikace se řídí replikačním modelem transpozice. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Jakmile jsou virové geny replikovány, je prokapsid shromážděn a zabalen. Ocas se poté sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[4]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
SpbetavirusBakterieŽádnýInjekceLyzaCytoplazmaCytoplazmaPasivní difúze

Dějiny

Podle ICTV devátá zpráva,[7] rod Spbetalikevirus byl poprvé přijat pod jménem Viry podobné SPbeta, přiřazeno rodině Siphoviridae, objednat Caudovirales. Rod byl přejmenován na Spbetalikevirus v roce 2012.[8][9] Rod byl přejmenován Spbetalikevirus v roce 2015.[2]

Reference

  1. ^ A b „Virus Taxonomy: 2018b Release“ (html). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Březen 2019. Citováno 17. září 2019.
  2. ^ A b Ackermann, Hans-Wolfgang; et al. (Květen 2015). "Přejmenování všech rodů fágů" (PDF). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 17. září 2019.
  3. ^ Krupovic, Mart; et al. (Květen 2015). „Přejmenovat všechny (522) existující bakteriální viry a 2 druhy viru archaeal“ (PDF). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 17. září 2019.
  4. ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
  5. ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 1. července 2015.
  6. ^ A b NCBI. "Spbetalikevirus Complete Genomes". Citováno 18. února 2015.
  7. ^ http://ictvonline.org/proposals/2005.166-70B.v2.SPBeta.pdf
  8. ^ http://ictvonline.org/proposals/2011.010aB.A.v2.Caudovirales_genus-ren.pdf
  9. ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2013 Release“. Citováno 18. února 2015.

externí odkazy