STIM1 - STIM1

STIM1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2K60, 3TEQ, 2MAJ, 2MAK, 4O9B
Identifikátory
Aliasy	STIM1, D11S4896E, GOK, IMD10, STRMK, TAM, TAM1, molekula stromální interakce 1
Externí ID	OMIM: 605921 MGI: 107476 HomoloGene: 20681 Genové karty: STIM1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	4,093,210 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	102,437,319 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • aktivita regulátoru kalciového kanálu; • mikrotubule plus-endová vazba; • vazba kovových iontů; • vazba proteázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • kortikální endoplazmatické retikulum; • sarkoplazmatické retikulum; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • endoplazmatické retikulum; • sarkoplazmatická retikulární membrána; • mikrotubuly; • cytoskelet; • buněčná membrána;
Biologický proces	• regulace srdečního vedení; • regulace transportu iontů vápníku; • iontový transport; • detekce iontu vápníku; • mineralizace skloviny; • aktivace aktivity vápníkového kanálu v obchodě; • transport iontů vápníku; • buněčná homeostáza iontů vápníku; • regulace vstupu vápníku z obchodu; • vstup vápníku provozovaný v obchodě; • pozitivní regulace angiogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6786
	20866
	ENSG00000167323
	ENSMUSG00000030987
	Q13586
	P70302
	NM_003156; NM_001277961; NM_001277962
	NM_009287; NM_001374058; NM_001374060
NP_001264890; NP_001264891; NP_003147; NP_001369495; NP_001369496;
	NP_001369497; NP_001369498; NP_001369499; NP_001369500; NP_001369501; NP_001369502; NP_001369503; NP_001369504; NP_001369505; NP_001369506; NP_001369507; NP_001369508; NP_001369509; NP_001369510
	NP_033313; NP_001360987; NP_001360989
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Molekula stromální interakce 1 je protein že u lidí je kódován STIM1 gen.^[5]^[6]^[7] STIM1 má jediný transmembránový doména a je lokalizována do domény endoplazmatické retikulum, a v menší míře i plazmatická membrána.^[8]

I když byl protein identifikován dříve, jeho funkce byla donedávna neznámá. V roce 2005 bylo zjištěno, že STIM1 funguje jako senzor vápníku v endoplazmatické retikulum.^[9]^[10] Po aktivaci Receptor IP3, koncentrace vápníku v endoplazmatickém retikulu klesá, což je snímáno STIM1, prostřednictvím jeho EF ruka doména. STIM1 aktivuje "provozováno v obchodě" ORAI1 vápník iontové kanály v plazmatické membráně prostřednictvím intracelulárního pohybu STIM1, shlukování pod plazmatickou membránou a interakce proteinu s izoformami ORAI.^[11]^[12]^[13] Je vyžadován vstup vápníku zprostředkovaný STIM1 trombin -indukovaná demontáž VE-kadherin dodržuje spojení.^[14] 2-Aminoethoxydifenylborát (2-APB) a 4-chlor-3-ethylfenol (4-CEP) způsobují shlukování STIM1 v buňce a zabraňují pohybu STIM1 směrem k plazmatické membráně.^[15]

Interakce

STIM1 bylo prokázáno komunikovat s ORAI1, TMEM110 (STIMÁT^[16]), SERCA, TMEM66 (SARAF ), a STIM2.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167323 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030987 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Parker NJ, Begley CG, Smith PJ, Fox RM (říjen 1996). "Molekulární klonování nového lidského genu (D11S4896E) v chromozomální oblasti 11p15.5". Genomika. 37 (2): 253–6. doi:10.1006 / geno.1996.0553. PMID 8921403.
^ ^A ^b Williams RT, Manji SS, Parker NJ, Hancock MS, Van Stekelenburg L, Eid JP, Senior PV, Kazenwadel JS, Shandala T, Saint R, Smith PJ, Dziadek MA (srpen 2001). „Identifikace a charakterizace rodiny genů STIM (molekula stromální interakce): kódování nové třídy transmembránových proteinů“. The Biochemical Journal. 357 (Pt 3): 673–85. doi:10.1042/0264-6021:3570673. PMC 1221997. PMID 11463338.
^ Williams RT, Senior PV, Van Stekelenburg L, Layton JE, Smith PJ, Dziadek MA (duben 2002). „Stromální interakční molekula 1 (STIM1), transmembránový protein s potlačující růstovou aktivitou, obsahuje extracelulární doménu SAM modifikovanou N-vázanou glykosylací“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - proteinová struktura a molekulární enzymologie. 1596 (1): 131–7. doi:10.1016 / S0167-4838 (02) 00211-X. PMID 11983428.
^ Soboloff J, Rothberg BS, Madesh M, Gill DL (září 2012). "Proteiny STIM: dynamické převodníky signálu vápníku". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 13 (9): 549–65. doi:10.1038 / nrm3414. PMC 3458427. PMID 22914293.
^ Roos J, DiGregorio PJ, Yeromin AV, Ohlsen K, Lioudyno M, Zhang S, Safrina O, Kozak JA, Wagner SL, Cahalan MD, Veliçelebi G, Stauderman KA (květen 2005). „STIM1, základní a konzervovaná součást funkce kanálu Ca2 + provozovaná v obchodě“. The Journal of Cell Biology. 169 (3): 435–45. doi:10.1083 / jcb.200502019. PMC 2171946. PMID 15866891.
^ Liou J, Kim ML, Heo WD, Jones JT, Myers JW, Ferrell JE, Meyer T (červenec 2005). „STIM je senzor Ca2 + nezbytný pro příliv Ca2 + vyvolaný vyčerpáním skladu Ca2 +“. Aktuální biologie. 15 (13): 1235–41. doi:10.1016 / j.cub.2005.05.055. PMC 3186072. PMID 16005298.
^ Putney JW (září 2009). "Kapacitní vstup vápníku: od konceptu k molekulám". Imunologické recenze. 231 (1): 10–22. doi:10.1111 / j.1600-065X.2009.00810.x. PMID 19754887. S2CID 32303982.
^ Zhou Y, Srinivasan P, Razavi S, Seymour S, Meraner P, Gudlur A, Stathopulos PB, Ikura M, Rao A, Hogan PG (srpen 2013). "Počáteční aktivace STIM1, regulátoru vstupu vápníku z obchodu". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 20 (8): 973–81. doi:10.1038 / nsmb.2625. PMC 3784406. PMID 23851458.
^ Ma G, Wei M, He L, Liu C, Wu B, Zhang SL, Jing J, Liang X, Senes A, Tan P, Li S, Sun A, Bi Y, Zhong L, Si H, Shen Y, Li M , Lee MS, Zhou W, Wang J, Wang Y, Zhou Y (2015-07-17). „Signalizace naruby Ca (2+) vyvolaná konformačním přepínačem STIM1“. Příroda komunikace. 6: 7826. doi:10.1038 / ncomms8826. PMC 4509486. PMID 26184105.
^ Soni D, Regmi SC, Wang DM, DebRoy A, Zhao YY, Vogel SM, Malik AB, Tiruppathi C (duben 2017). "Pyk2 fosforylace VE-PTP za vstupem Ca2 + indukovaným STIM1 reguluje demontáž adherenských spojení". American Journal of Physiology. Plicní buněčná a molekulární fyziologie. 312 (6): L1003 – L1017. doi:10.1152 / ajplung.00008.2017. PMC 5495943. PMID 28385807.
^ Zeng B, Chen GL, Xu SZ (říjen 2012). "Cesty nezávislé na obchodech pro klastrování cytosolického STIM1 v regulaci přílivu Ca (2+) v provozu". Biochemická farmakologie. 84 (8): 1024–35. doi:10.1016 / j.bcp.2012.07.013. PMID 22842488.
^ Jing J, He L, Sun A, Quintana A, Ding Y, Ma G, Tan P, Liang X, Zheng X, Chen L, Shi X, Zhang SL, Zhong L, Huang Y, Dong MQ, Walker CL, Hogan PG , Wang Y, Zhou Y (srpen 2015). „Proteomické mapování spojů ER-PM identifikuje STIMATE jako regulátor přílivu Ca (2+)“. Přírodní buněčná biologie. 17 (10): 1339–47. doi:10.1038 / ncb3234. PMC 4589512. PMID 26322679.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167323 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030987 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8921403-5] Parker NJ, Begley CG, Smith PJ, Fox RM (říjen 1996). "Molekulární klonování nového lidského genu (D11S4896E) v chromozomální oblasti 11p15.5". Genomika. 37 (2): 253–6. doi:10.1006 / geno.1996.0553. PMID 8921403.

[pmid11463338-6] A ^b Williams RT, Manji SS, Parker NJ, Hancock MS, Van Stekelenburg L, Eid JP, Senior PV, Kazenwadel JS, Shandala T, Saint R, Smith PJ, Dziadek MA (srpen 2001). „Identifikace a charakterizace rodiny genů STIM (molekula stromální interakce): kódování nové třídy transmembránových proteinů“. The Biochemical Journal. 357 (Pt 3): 673–85. doi:10.1042/0264-6021:3570673. PMC 1221997. PMID 11463338.

[pmid11983428-7] Williams RT, Senior PV, Van Stekelenburg L, Layton JE, Smith PJ, Dziadek MA (duben 2002). „Stromální interakční molekula 1 (STIM1), transmembránový protein s potlačující růstovou aktivitou, obsahuje extracelulární doménu SAM modifikovanou N-vázanou glykosylací“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - proteinová struktura a molekulární enzymologie. 1596 (1): 131–7. doi:10.1016 / S0167-4838 (02) 00211-X. PMID 11983428.

[Soboloff_et_al-8] Soboloff J, Rothberg BS, Madesh M, Gill DL (září 2012). "Proteiny STIM: dynamické převodníky signálu vápníku". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 13 (9): 549–65. doi:10.1038 / nrm3414. PMC 3458427. PMID 22914293.

[pmid15866891-9] Roos J, DiGregorio PJ, Yeromin AV, Ohlsen K, Lioudyno M, Zhang S, Safrina O, Kozak JA, Wagner SL, Cahalan MD, Veliçelebi G, Stauderman KA (květen 2005). „STIM1, základní a konzervovaná součást funkce kanálu Ca2 + provozovaná v obchodě“. The Journal of Cell Biology. 169 (3): 435–45. doi:10.1083 / jcb.200502019. PMC 2171946. PMID 15866891.

[pmid16005298-10] Liou J, Kim ML, Heo WD, Jones JT, Myers JW, Ferrell JE, Meyer T (červenec 2005). „STIM je senzor Ca2 + nezbytný pro příliv Ca2 + vyvolaný vyčerpáním skladu Ca2 +“. Aktuální biologie. 15 (13): 1235–41. doi:10.1016 / j.cub.2005.05.055. PMC 3186072. PMID 16005298.

[pmid19754887-11] Putney JW (září 2009). "Kapacitní vstup vápníku: od konceptu k molekulám". Imunologické recenze. 231 (1): 10–22. doi:10.1111 / j.1600-065X.2009.00810.x. PMID 19754887. S2CID 32303982.

[12] Zhou Y, Srinivasan P, Razavi S, Seymour S, Meraner P, Gudlur A, Stathopulos PB, Ikura M, Rao A, Hogan PG (srpen 2013). "Počáteční aktivace STIM1, regulátoru vstupu vápníku z obchodu". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 20 (8): 973–81. doi:10.1038 / nsmb.2625. PMC 3784406. PMID 23851458.

[13] Ma G, Wei M, He L, Liu C, Wu B, Zhang SL, Jing J, Liang X, Senes A, Tan P, Li S, Sun A, Bi Y, Zhong L, Si H, Shen Y, Li M , Lee MS, Zhou W, Wang J, Wang Y, Zhou Y (2015-07-17). „Signalizace naruby Ca (2+) vyvolaná konformačním přepínačem STIM1“. Příroda komunikace. 6: 7826. doi:10.1038 / ncomms8826. PMC 4509486. PMID 26184105.

[Soni-14] Soni D, Regmi SC, Wang DM, DebRoy A, Zhao YY, Vogel SM, Malik AB, Tiruppathi C (duben 2017). "Pyk2 fosforylace VE-PTP za vstupem Ca2 + indukovaným STIM1 reguluje demontáž adherenských spojení". American Journal of Physiology. Plicní buněčná a molekulární fyziologie. 312 (6): L1003 – L1017. doi:10.1152 / ajplung.00008.2017. PMC 5495943. PMID 28385807.

[PMID_22842488-15] Zeng B, Chen GL, Xu SZ (říjen 2012). "Cesty nezávislé na obchodech pro klastrování cytosolického STIM1 v regulaci přílivu Ca (2+) v provozu". Biochemická farmakologie. 84 (8): 1024–35. doi:10.1016 / j.bcp.2012.07.013. PMID 22842488.

[16] Jing J, He L, Sun A, Quintana A, Ding Y, Ma G, Tan P, Liang X, Zheng X, Chen L, Shi X, Zhang SL, Zhong L, Huang Y, Dong MQ, Walker CL, Hogan PG , Wang Y, Zhou Y (srpen 2015). „Proteomické mapování spojů ER-PM identifikuje STIMATE jako regulátor přílivu Ca (2+)“. Přírodní buněčná biologie. 17 (10): 1339–47. doi:10.1038 / ncb3234. PMC 4589512. PMID 26322679.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]