ORAI1 - ORAI1

ORAI1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyORAI1, CRACM1, IMD9, ORAT1, TAM2, TMEM142A, ORAI modulátor vápníku aktivovaný uvolňováním vápníku 1
Externí IDOMIM: 610277 MGI: 1925542 HomoloGene: 13117 Genové karty: ORAI1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 12 (lidský)
Chr.Chromozom 12 (lidský)[1]
Chromozom 12 (lidský)
Genomická poloha pro ORAI1
Genomická poloha pro ORAI1
Kapela12q24.31Start121,626,550 bp[1]
Konec121,642,677 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_032790

NM_175423

RefSeq (protein)

NP_116179

NP_780632

Místo (UCSC)Chr 12: 121,63 - 121,64 MbChr 5: 123,02 - 123,03 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein vápníkového kanálu aktivovaný uvolňováním vápníku 1 je selektivní pro vápník iontový kanál že u lidí je kódován ORAI1 gen.[5][6][7] Orai kanály hrají důležitou roli při aktivaci T-lymfocyty. Ztráta funkční mutace Orai1 způsobuje závažná kombinovaná imunodeficience (SCID) u lidí[5] Rodina savčích orai má dvě další homology, Orai2 a Orai3. Orai proteiny nesdílejí žádnou homologii s žádnou jinou rodinou iontových kanálů jiných známých proteinů. Mají 4 transmembránový domény a tvoří hexamery.

Struktura a funkce

Orai kanály se aktivují po vyčerpání vnitřních zásob vápníku, kterému se říká „zásobní provoz“ nebo „kapacitní“ mechanismus.[8] Jsou to molekulární složky „proudů vápníku aktivovaných uvolňováním vápníku“ (ICRAC ). Po aktivaci fosfolipáza C různými receptory na povrchu buněk, inositol trisphosphate se tvoří, který uvolňuje vápník z endoplazmatické retikulum. Snížená koncentrace vápníku v endoplazmatickém retikulu je snímána pomocí STIM1 protein. STIM1 se shlukuje po vyčerpání zásob a forem vápníku "puncta "a přemisťuje se poblíž plazmatické membrány, kde aktivuje Orai1 prostřednictvím interakce protein-protein.[9][10][11][12]

V roce 2012 bylaangstrom (A) Krystalická struktura z Drosophila Kanál Orai, který sdílí 73% sekvenční identita s lidským Orai1 uvnitř transmembránová oblast, byl publikován.[13] Struktura, o které se předpokládá, že ukazuje uzavřený stav kanálu, odhalila, že jeden kanál se skládá ze šesti podjednotek Orai, přičemž transmembránové domény uspořádány v soustředných prstencích kolem centrálního vodného póru tvořeného výhradně první transmembránovou spirálou každé podjednotky. Transmembránové šroubovice 2 a 3 obklopují TM1 a předpokládá se, že ji budou chránit před okolím lipidová dvojvrstva a poskytnout strukturální podporu. Čtvrtá transmembránová spirála tvoří nejvzdálenější vrstvu.

Ligandy

Inhibitory

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276045 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049686 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b Feske S, Gwack Y, Prakriya M, Srikanth S, Puppel SH, Tanasa B, Hogan PG, Lewis RS, Daly M, Rao A (květen 2006). "Mutace v Orai1 způsobuje imunitní nedostatečnost zrušením funkce kanálu CRAC". Příroda. 441 (7090): 179–85. doi:10.1038 / nature04702. PMID  16582901. S2CID  1605392.
  6. ^ Vig M, Peinelt C, Beck A, Koomoa DL, Rabah D, Koblan-Huberson M, Kraft S, Turner H, Fleig A, Penner R, Kinet JP (květen 2006). „CRACM1 je plazmatický membránový protein nezbytný pro vstup Ca2 + do skladu“. Věda. 312 (5777): 1220–3. doi:10.1126 / science.1127883. PMC  5685805. PMID  16645049.
  7. ^ Zhang SL, Yeromin AV, Zhang XH, Yu Y, Safrina O, Penna A, Roos J, Stauderman KA, MD Cahalan (červen 2006). „Screening přítoku Ca (2+) v celém genomu RNAi identifikuje geny, které regulují aktivitu Ca (2+) aktivovaného Ca (2+) kanálu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (24): 9357–62. doi:10.1073 / pnas.0603161103. PMC  1482614. PMID  16751269.
  8. ^ Putney JW (září 2009). "Kapacitní vstup vápníku: od konceptu k molekulám". Imunologické recenze. 231 (1): 10–22. doi:10.1111 / j.1600-065X.2009.00810.x. PMID  19754887. S2CID  32303982.
  9. ^ Park CY, Hoover PJ, Mullins FM, Bachhawat P, Covington ED, Raunser S, Walz T, Garcia KC, Dolmetsch RE, Lewis RS (březen 2009). „STIM1 se shlukuje a aktivuje kanály CRAC přímou vazbou cytosolické domény na Orai1“. Buňka. 136 (5): 876–90. doi:10.1016 / j.cell.2009.02.014. PMC  2670439. PMID  19249086.
  10. ^ Zhou Y, Meraner P, Kwon HT, Machnes D, Oh-hora M, Zimmer J, Huang Y, Stura A, Rao A, Hogan PG (leden 2010). „STIM1 brání kalciový kanál ORAI1 provozovaný v obchodě in vitro“. Přírodní strukturní a molekulární biologie. 17 (1): 112–6. doi:10.1038 / nsmb.1724. PMC  2902271. PMID  20037597.
  11. ^ Gudlur A, Zhou Y, Hogan PG (01.01.2013). "Interakce STIM-ORAI, které řídí kanál CRAC". Aktuální témata v oblasti membrán. 71: 33–58. doi:10.1016 / b978-0-12-407870-3.00002-0. ISBN  9780124078703. PMID  23890110.
  12. ^ Zhou Y, Srinivasan P, Razavi S, Seymour S, Meraner P, Gudlur A, Stathopulos PB, Ikura M, Rao A, Hogan PG (srpen 2013). "Počáteční aktivace STIM1, regulátoru vstupu vápníku z obchodu". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 20 (8): 973–81. doi:10.1038 / nsmb.2625. PMC  3784406. PMID  23851458.
  13. ^ Hou X, Pedi L, Diver MM, Long SB (prosinec 2012). "Krystalová struktura vápníkového kanálu aktivovaného uvolňováním vápníku Orai". Věda. 338 (6112): 1308–13. doi:10.1126 / science.1228757. PMC  3695727. PMID  23180775.