SND1 - SND1
Protein obsahující stafylokokovou nukleázovou doménu 1 také známý jako 100 kDa koaktivátor nebo Protein obsahující tudorovskou doménu 11 (TDRD11) je a protein že u lidí je kódován SND1 gen.[5][6][7][8] SND1 je hlavní součástí RISC komplex[9] a hraje důležitou roli v miRNA funkce.[10][11] SND1 je Tudorova doména obsahující protein a tudorovy proteiny jsou vysoce konzervované proteiny a dokonce se vyskytují v Drosophila melanogaster.[12] SND1 se také podílí na autismu.[13]
Klinický význam
SND1 funguje jako onkogen u mnoha druhů rakoviny[14][15][16] a v hepatocelulární karcinom postup.[10][11] SND1 podporuje nádorovou angiogenezi v lidském hepatocelulárním karcinomu prostřednictvím nové dráhy, která zahrnuje NF-kappaB a miR-221.[17] SND1 podporuje migraci a invazi prostřednictvím receptoru angiotensinu II typu 1 a signalizace TGFβ.[18] Exprese SND1 je regulována Mir-184 v gliomy.[19]
Interakce
SND1 bylo prokázáno komunikovat s MYB,[20]
SND1 také interaguje s G3BP (stresový granulovaný protein)[25] a AEG-1.[10][11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197157 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001424 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Tong X, Drapkin R, Yalamanchili R, Mosialos G, Kieff E (září 1995). „Jaderný protein 2, kyselá doména viru Epstein-Barrové tvoří komplex s novým buněčným koaktivátorem, který může interagovat s TFIIE“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (9): 4735–44. doi:10,1128 / mcb.15.9.4735. PMC 230717. PMID 7651391.
- ^ Callebaut I, Mornon JP (leden 1997). „The human EBNA-2 coactivator p100: multidomain organization and relationship to the staphylococcal nuklease fold and to the tudor protein involved in Drosophila melanogaster development“. The Biochemical Journal. 321 (1): 125–32. doi:10.1042 / bj3210125. PMC 1218045. PMID 9003410.
- ^ Paukku K, Yang J, Silvennoinen O (září 2003). „Tudorové a nukleázové domény obsahující protein p100 fungují jako koaktivátory pro signální měnič a aktivátor transkripce 5“. Molekulární endokrinologie. 17 (9): 1805–14. doi:10.1210 / me.2002-0256. PMID 12819296.
- ^ „Entrez Gene: SND1 stafylokoková nukleáza a tudorovská doména obsahující 1“.
- ^ Tsuchiya N, Ochiai M, Nakashima K, Ubagai T, Sugimura T, Nakagama H (říjen 2007). „SND1, součást komplexu umlčování vyvolaného RNA, je up-regulován u lidských rakovin tlustého střeva a podílí se na časném stádiu karcinogeneze“. Výzkum rakoviny. 67 (19): 9568–76. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2707. PMID 17909068.
- ^ A b C Yoo BK, Santhekadur PK, Gredler R, Chen D, Emdad L, Bhutia S, Pannell L, Fisher PB, Sarkar D (květen 2011). „Zvýšená aktivita umlčovacího komplexu indukovaného RNA (RISC) přispívá k hepatocelulárnímu karcinomu“. Hepatologie. 53 (5): 1538–48. doi:10.1002 / hep.24216. PMC 3081619. PMID 21520169.
- ^ A b C Yoo BK, Emdad L, Lee SG, Su ZZ, Santhekadur P, Chen D, Gredler R, Fisher PB, Sarkar D (duben 2011). „Gen-1 zvýšený astrocyty (AEG-1): multifunkční regulátor normální a abnormální fyziologie“. Farmakologie a terapeutika. 130 (1): 1–8. doi:10.1016 / j.pharmthera.2011.01.008. PMC 3043119. PMID 21256156.
- ^ Ying, Muying; Chen, Dahua (1. ledna 2012). "Proteiny Dudophila melanogaster obsahující doménu Tudor". Vývoj, růst a diferenciace. 54 (1): 32–43. doi:10.1111 / j.1440-169X.2011.01308.x. PMID 23741747. S2CID 23227910.
- ^ Holt R, Barnby G, Maestrini E, Bacchelli E, Brocklebank D, Sousa I, Mulder EJ, Kantojärvi K, Järvelä I, Klauck SM, Poustka F, Bailey AJ, Monaco AP (září 2010). „Propojení a studie kandidátních genů poruch autistického spektra v evropských populacích“. European Journal of Human Genetics. 18 (9): 1013–9. doi:10.1038 / ejhg.2010.69. PMC 2987412. PMID 20442744.
- ^ Tsuchiya N, Nakagama H (listopad 2010). „MicroRNA, SND1 a alterace translační regulace v karcinogenezi tlustého střeva“. Mutační výzkum. 693 (1–2): 94–100. doi:10.1016 / j.mrfmmm.2010.09.001. PMID 20883704.
- ^ Kuruma H, Kamata Y, Takahashi H, Igarashi K, Kimura T, Miki K, Miki J, Sasaki H, Hayashi N, Egawa S (červen 2009). „Protein 1 obsahující stafylokokovou nukleázovou doménu jako potenciální tkáňový marker pro rakovinu prostaty“. American Journal of Pathology. 174 (6): 2044–50. doi:10.2353 / ajpath.2009.080776. PMC 2684170. PMID 19435788.
- ^ Ho J, Kong JW, Choong LY, Loh MC, Toy W, Chong PK, Wong CH, Wong CY, Shah N, Lim YP (únor 2009). "Nové proteiny spojené s metastázami rakoviny prsu". Journal of Proteome Research. 8 (2): 583–94. doi:10.1021 / pr8007368. PMID 19086899.
- ^ Santhekadur PK, Das SK, Gredler R, Chen D, Srivastava J, Robertson C, Baldwin AS, Fisher PB, Sarkar D (duben 2012). „Multifunkční proteinová stafylokoková nukleázová doména obsahující 1 (SND1) podporuje angiogenezi tumoru v lidském hepatocelulárním karcinomu prostřednictvím nové cesty zahrnující nukleární faktor κB a miR-221“. The Journal of Biological Chemistry. 287 (17): 13952–8. doi:10.1074 / jbc.M111.321646. PMC 3340184. PMID 22396537.
- ^ Santhekadur PK, Akiel M, Emdad L, Gredler R, Srivastava J, Rajasekaran D, Robertson CL, Mukhopadhyay ND, Fisher PB, Sarkar D (2014). „Stafylokoková nukleázová doména obsahující-1 (SND1) podporuje migraci a invazi prostřednictvím receptoru angiotensinu II typu 1 (AT1R) a signalizace TGFβ“. FEBS Open Bio. 4: 353–61. doi:10.1016 / j.fob.2014.03.012. PMC 4050181. PMID 24918049.
- ^ Emdad L, Janjic A, Alzubi MA, Hu B, Santhekadur PK, Menezes ME, Shen XN, Das SK, Sarkar D, Fisher PB (březen 2015). „Potlačení miR-184 u maligních gliomů zvyšuje hladinu SND1 a podporuje agresivitu nádoru“. Neuro-onkologie. 17 (3): 419–29. doi:10.1093 / neuonc / nou220. PMC 4483100. PMID 25216670.
- ^ Dash AB, Orrico FC, Ness SA (srpen 1996). „Motiv EVES zprostředkovává jak intermolekulární, tak intramolekulární regulaci c-Myb“. Geny a vývoj. 10 (15): 1858–69. doi:10.1101 / gad.10.15.1858. PMID 8756344.
- ^ Leverson JD, Koskinen PJ, Orrico FC, Rainio EM, Jalkanen KJ, Dash AB, Eisenman RN, Ness SA (říjen 1998). "Pim-1 kináza a p100 spolupracují na zvýšení aktivity c-Myb". Molekulární buňka. 2 (4): 417–25. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80141-0. PMID 9809063.
- ^ A b Yang J, Aittomäki S, Pesu M, Carter K, Saarinen J, Kalkkinen N, Kieff E, Silvennoinen O (září 2002). „Identifikace p100 jako koaktivátoru pro STAT6, který přemosťuje STAT6 s RNA polymerázou II“. Časopis EMBO. 21 (18): 4950–8. doi:10.1093 / emboj / cdf463. PMC 126276. PMID 12234934.
- ^ Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Hayward SD (únor 2000). „Role SKIP v aktivaci EBNA2 promotorů potlačovaných CBF1“. Journal of Virology. 74 (4): 1939–47. doi:10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000. PMC 111672. PMID 10644367.
- ^ Hsieh JJ, Zhou S, Chen L, Young DB, Hayward SD (leden 1999). „CIR, korepresor spojující vazebný faktor DNA CBF1 s komplexem histon-deacetylázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (1): 23–8. doi:10.1073 / pnas.96.1.23. PMC 15086. PMID 9874765.
- ^ Gao X, Ge L, Shao J, Su C, Zhao H, Saarikettu J, Yao X, Yao Z, Silvennoinen O, Yang J (srpen 2010). „Tudor-SN interaguje s G3BP a lokalizuje je ve stresových granulích za stresových podmínek“. FEBS Dopisy. 584 (16): 3525–32. doi:10.1016 / j.febslet.2010.07.022. PMC 7127458. PMID 20643132.
Další čtení
- Dash AB, Orrico FC, Ness SA (srpen 1996). „Motiv EVES zprostředkovává jak intermolekulární, tak intramolekulární regulaci c-Myb“. Geny a vývoj. 10 (15): 1858–69. doi:10.1101 / gad.10.15.1858. PMID 8756344.
- Leverson JD, Koskinen PJ, Orrico FC, Rainio EM, Jalkanen KJ, Dash AB, Eisenman RN, Ness SA (říjen 1998). "Pim-1 kináza a p100 spolupracují na zvýšení aktivity c-Myb". Molekulární buňka. 2 (4): 417–25. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80141-0. PMID 9809063.
- Liénard P, Rivière M, Van Vooren P, Szpirer C, Szpirer J (2001). "Přiřazení SND1, genu kódujícího koaktivátor p100, k lidskému chromozomu 7q31.3 a potkanímu chromozomu 4q23 hybridizací in situ". Cytogenetika a genetika buněk. 90 (3–4): 253–4. doi:10.1159/000056783. PMID 11124528. S2CID 46217878.
- Rushton JJ, Ness SA (2001). „Konzervovaná doména vázající DNA zprostředkovává podobné regulační interakce pro transkripční faktory A-Myb, B-Myb a c-Myb“. Krevní buňky, molekuly a nemoci. 27 (2): 459–63. doi:10.1006 / bcmd.2001.0405. PMID 11259168.
- Broadhurst MK, Wheeler TT (listopad 2001). „Koaktivátor p100 je přítomen v jádrech epiteliálních buněk mléčné žlázy a jeho hojnost se zvyšuje v reakci na prolaktin v kultuře a v mléčné tkáni během laktace“. The Journal of Endocrinology. 171 (2): 329–37. doi:10.1677 / joe.0.1710329. PMID 11691653.
- Yang J, Aittomäki S, Pesu M, Carter K, Saarinen J, Kalkkinen N, Kieff E, Silvennoinen O (září 2002). „Identifikace p100 jako koaktivátoru pro STAT6, který přemosťuje STAT6 s RNA polymerázou II“. Časopis EMBO. 21 (18): 4950–8. doi:10.1093 / emboj / cdf463. PMC 126276. PMID 12234934.
- Tijms MA, Snijder EJ (září 2003). „Nestrukturní protein viru arteritidy koní 1, základní faktor pro syntézu subgenomů virů mRNA, interaguje s buněčným transkripčním kofaktorem p100“. The Journal of General Virology. 84 (Pt 9): 2317–22. doi:10.1099 / vir.0.19297-0. PMID 12917451.
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Broadhurst MK, Lee RS, Hawkins S, Wheeler TT (leden 2005). „Koaktivátor p100 EBNA-2: vysoce konzervovaný protein nacházející se v řadě exokrinních a endokrinních buněk a tkání u skotu“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1681 (2–3): 126–33. doi:10.1016 / j.bbaexp.2004.10.009. PMID 15627504.
- Välineva T, Yang J, Palovuori R, Silvennoinen O (duben 2005). „Transkripční koaktivátorový protein p100 rekrutuje aktivitu histon-acetyltransferázy na STAT6 a zprostředkovává interakci mezi proteinem vázajícím CREB a STAT6“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (15): 14989–96. doi:10,1074 / jbc.M410465200. PMID 15695802.
- Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, Watabe H, Yamaguchi H, Mangini NJ, Huang H, Canfield VA, Cheng KC, Yang F, Abe R, Yamagishi S, Shabanowitz J, Hearing VJ, Wu C, Appella E, Hunt DF (Listopad 2006). "Proteomická a bioinformatická charakterizace biogeneze a funkce melanosomů". Journal of Proteome Research. 5 (11): 3135–44. doi:10.1021 / pr060363j. PMID 17081065.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.