G3BP1 - G3BP1
Protein vázající protein Ras GTPázu 1 je enzym že u lidí je kódován G3BP1 gen.[4][5][6]
Tento gen kóduje jeden z DNA odvíjejících se enzymů, který preferuje částečně odvíjené 3'-ocasní substráty a může také odvíjet částečné duplexy RNA / DNA a RNA / RNA způsobem závislým na ATP. Tento enzym je členem heterogenních proteinů vázajících nukleární RNA a je také prvkem signální transdukční dráhy Ras. Původně bylo hlášeno, že se specificky váže na protein aktivující Ras-GTPázu spojením s jeho doménou SH3, ale tato interakce byla nedávno zpochybněna.[7] Bylo popsáno několik alternativně sestřižených variant transkriptu tohoto genu, ale povaha celé délky některých z těchto variant nebyla stanovena.[6]
G3BP1 může zahájit stresová granule tvorba a značený G3BP1 se běžně používá jako marker stresových granulí.[8]
Interakce
G3BP1 bylo prokázáno komunikovat s USP10.[9]Interaguje také s SND1 [5].
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145907 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Parker F, Maurier F, Delumeau I, Duchesne M, Faucher D, Debussche L, Dugue A, Schweighoffer F, Tocque B (červenec 1996). „Protein vázající na Ras-GTPázu SH3 doménu. Mol Cell Biol. 16 (6): 2561–9. doi:10.1128 / MCB.16.6.2561. PMC 231246. PMID 8649363.
- ^ Costa M, Ochem A, Staub A, Falaschi A (březen 1999). „Lidská DNA helikáza VIII: DNA a RNA helikáza odpovídající proteinu G3BP, prvek transdukční dráhy ras“. Nucleic Acids Res. 27 (3): 817–21. doi:10.1093 / nar / 27.3.817. PMC 148252. PMID 9889278.
- ^ A b "Entrez Gene: G3BP1 GTPáza aktivující protein (SH3 doména) vazebný protein 1".
- ^ Annibaldi, A; Dousse, A; Martin, S; Tazi, J; Widmann, C (2011). „Přehodnocení G3BP1 jako proteinu vázajícího se na RasGAP: Senzitizace nádorových buněk na chemoterapii sekvencí RasGAP 317-326 nezahrnuje G3BP1“. PLOS ONE. 6 (12): e29024. Bibcode:2011PLoSO ... 629024A. doi:10.1371 / journal.pone.0029024. PMC 3242762. PMID 22205990.
- ^ Mahboubi, Hicham; Stochaj, Ursula (01.04.2017). „Cytoplazmatický stresový granulát: Dynamické modulátory buněčné signalizace a nemoci“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molekulární základ choroby. 1863 (4): 884–895. doi:10.1016 / j.badis.2016.12.022. ISSN 0925-4439. PMID 28095315.
- ^ Soncini, C; Berdo I; Draetta G (červen 2001). „Ras-GAP SH3 doména vázající protein (G3BP) je modulátor USP10, nové proteázy specifické pro lidský ubikvitin“. Onkogen. Anglie. 20 (29): 3869–79. doi:10.1038 / sj.onc.1204553. ISSN 0950-9232. PMID 11439350.
[5] Gao X, Ge L, Shao J, Su C, Zhao H, Saarikettu J, Yao X, Yao Z, Silvennoinen O, Yang J., Tudor-SN interaguje s G3BP ve stresových granulích pod stresem Podmínky. FEBS Letters, svazek 584, vydání 16, strany 3525-3532.
Další čtení
- Irvine K, Stirling R, Hume D, Kennedy D (2005). „Rasputin, promiskuitnější než kdy jindy: recenze G3BP“. Int. J. Dev. Biol. 48 (10): 1065–77. doi:10,1387 / ijdb.041893ki. PMID 15602692.
- Onno M, Nakamura T, Hillova J, Hill M (1993). „Přesmyk lidského tre onkogenu homologní rekombinací mezi Alu repetice nukleotidových sekvencí ze dvou různých chromozomů“. Onkogen. 7 (12): 2519–23. PMID 1461655.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Gallouzi IE, Parker F, Chebli K a kol. (1998). „Nová aktivita RNázy závislá na fosforylaci vazebného proteinu GAP-SH3: potenciální spojení mezi transdukcí signálu a stabilitou RNA“. Mol. Buňka. Biol. 18 (7): 3956–65. doi:10.1128 / MCB.18.7.3956. PMC 108980. PMID 9632780.
- Kociok N, Esser P, Unfried K, et al. (1999). „Upregulace proteinu vázajícího RAS-GTPázu (GAP) (G3BP) v proliferujících RPE buňkách“. J. Cell. Biochem. 74 (2): 194–201. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19990801) 74: 2 <194 :: AID-JCB5> 3.0.CO; 2-M. PMID 10404389.
- Soncini C, Berdo I, Draetta G (2001). „Ras-GAP SH3 doména vázající protein (G3BP) je modulátor USP10, nové proteázy specifické pro lidský ubikvitin“. Onkogen. 20 (29): 3869–79. doi:10.1038 / sj.onc.1204553. PMID 11439350.
- Tourrière H, Gallouzi IE, Chebli K a kol. (2001). „Endoribonukleáza asociovaná s RasGAP: G3BP: Selektivní degradace RNA a lokalizace závislá na fosforylaci“. Mol. Buňka. Biol. 21 (22): 7747–60. doi:10.1128 / MCB.21.22.7747-7760.2001. PMC 99945. PMID 11604510.
- Barnes CJ, Li F, Mandal M a kol. (2002). „Heregulin indukuje expresi, aktivitu ATPázy a nukleární lokalizaci G3BP, signální složky Ras, v lidských nádorech prsu“. Cancer Res. 62 (5): 1251–5. PMID 11888885.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Tourrière H, Chebli K, Zekri L a kol. (2003). „Endoribonukleáza G3BP spojená s RasGAP sestavuje stresové granule“. J. Cell Biol. 160 (6): 823–31. doi:10.1083 / jcb.200212128. PMC 2173781. PMID 12642610.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB a kol. (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Katsafanas GC, Moss B (2005). „Transkripce v mezistupni viru vakcínie je doplněna proteinem vázajícím se na SH3 doménu (G3BP) aktivujícím Ras-GTPázu a proteinem spojeným s cytoplazmatickou aktivací / proliferací (p137) samostatně nebo jako heterodimer. J. Biol. Chem. 279 (50): 52210–7. doi:10,1074 / jbc.M411033200. PMID 15471883.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Ong SE, Mittler G, Mann M (2005). "Identifikace a kvantifikace methylačních míst in vivo těžkým methyl SILAC". Nat. Metody. 1 (2): 119–26. doi:10.1038 / nmeth715. PMID 15782174. S2CID 6654604.
externí odkazy
- G3BP1 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
- G3BP1 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |