Cyclin O - Cyclin O

CCNO
Identifikátory
Aliasy	CCNO, CCNU, CILD29, UDG2, Cyclin O
Externí ID	OMIM: 607752 MGI: 2145534 HomoloGene: 50171 Genové karty: CCNO
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	55,233,608 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	112,990,777 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita N-glykosylázy uracil DNA; • aktivita proteinkinázy; • aktivita regulátoru proteinu serin / threonin kinázy závislá na cyklinu; • vazba protein kinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • komplex cyklin-dependentní protein kinázy s holoenzymem;
Biologický proces	• organizace projekce buněk; • diferenciace epiteliálních buněk s více řasinkami; • reakce na drogu; • cilium morfogeneze; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • buněčný cyklus; • buněčné dělení; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • fosforylace bílkovin; • regulace mitotického jaderného dělení; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace buněčného cyklu; • fázový přechod mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10309
	218630
	ENSG00000152669
	ENSMUSG00000042417
	P22674
	P0C242
	NM_001024592; NM_021147
	NM_001081062
	NP_066970
	NP_001074531
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cyclin-O je protein že u lidí je kódován CCNO gen.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že cyklin O komunikovat s RPA2^[6] a PCNA.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000152669 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042417 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: CCNO cyklin O“.
^ ^A ^b Otterlei M, Warbrick E, Nagelhus TA, Haug T, Slupphaug G, Akbari M, Aas PA, Steinsbekk K, Bakke O, Krokan HE (červenec 1999). "Postreplikativní oprava základní excize v ohniscích replikace". Časopis EMBO. 18 (13): 3834–44. doi:10.1093 / emboj / 18.13.3834. PMC 1171460. PMID 10393198.
^ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.

Další čtení

Caradonna S, Muller-Weeks S (prosinec 2001). „Povaha enzymů zapojených do opravy uracil-DNA: izoformní charakteristiky proteinů odpovědných za jadernou a mitochondriální genomovou integritu“. Současná věda o proteinech a peptidech. 2 (4): 335–47. doi:10.2174/1389203013381044. PMID 12369930.
Muller SJ, Caradonna S (únor 1991). "Izolace a charakterizace lidské cDNA kódující uracil-DNA glykosylázu". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1088 (2): 197–207. doi:10.1016 / 0167-4781 (91) 90055-Q. PMID 2001396.
Muller SJ, Caradonna S (leden 1993). "Regulace buněčného cyklu lidského genu podobného cyklinu kódujícího uracil-DNA glykosylázu". The Journal of Biological Chemistry. 268 (2): 1310–9. PMID 8419333.
Otterlei M, Warbrick E, Nagelhus TA, Haug T, Slupphaug G, Akbari M, Aas PA, Steinsbekk K, Bakke O, Krokan HE (červenec 1999). "Postreplikativní oprava excize základny v ohniscích replikace". Časopis EMBO. 18 (13): 3834–44. doi:10.1093 / emboj / 18.13.3834. PMC 1171460. PMID 10393198.
Mer G, Bochkarev A, Gupta R, Bochkareva E, Frappier L, Ingles CJ, Edwards AM, Chazin WJ (říjen 2000). "Strukturální základna pro rozpoznání DNA opravných proteinů UNG2, XPA a RAD52 replikačním faktorem RPA". Buňka. 103 (3): 449–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00136-7. PMID 11081631. S2CID 16640087.
Kavli B, Sundheim O, Akbari M, Otterlei M, Nilsen H, Skorpen F, Aas PA, Hagen L, Krokan HE, Slupphaug G (říjen 2002). „hUNG2 je hlavní opravný enzym pro odstranění uracilu z U: A shod, U: G nesouladů a U v jednořetězcové DNA, s hSMUG1 jako záloha široké specificity“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (42): 39926–36. doi:10,1074 / jbc.M207107200. PMID 12161446.
Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
Priet S, Navarro JM, Gros N, Quérat G, Sire J (březen 2003). „Diferenciální inkorporace uracil DNA glykosylázy UNG2 do virových částic HIV-1, HIV-2 a SIV (MAC)“. Virologie. 307 (2): 283–9. doi:10.1016 / S0042-6822 (02) 00073-9. PMID 12667798.
Elder RT, Zhu X, Priet S, Chen M, Yu M, Navarro JM, Sire J, Zhao Y (červenec 2003). "Štěpný kvasnicový homolog lidské uracil-DNA-glykosylázy a jejich role při poškození DNA po nadměrné expresi". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 306 (3): 693–700. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01036-2. PMID 12810074.
Lu X, Bocangel D, Nannenga B, Yamaguchi H, Appella E, Donehower LA (srpen 2004). „Onkogenní fosfatáza PPM1D indukovaná p53 interaguje s glykosylázou DNA uracilu a potlačuje opravu základní excize“. Molekulární buňka. 15 (4): 621–34. doi:10.1016 / j.molcel.2004.08.007. PMID 15327777.
Hirst R, Gosden R, Miller D (červen 2006). „Cyklin-like uracil DNA glykosyláza (UDG) myších oocytů a její vztah k lidským a šimpanzím homologům“. Gen. 375: 95–102. doi:10.1016 / j.gene.2006.02.030. PMID 16697536.
Verma SC, Bajaj BG, Cai Q, Si H, Seelhammer T, Robertson ES (listopad 2006). „Jaderný antigen spojený s latencí herpesviru spojeného s Kaposiho sarkomem rekrutuje uracil DNA glykosylázu 2 na terminálních opakováních a je důležitý pro latentní persistenci viru. Journal of Virology. 80 (22): 11178–90. doi:10.1128 / JVI.01334-06. PMC 1642147. PMID 16928741.
Yang B, Chen K, Zhang C, Huang S, Zhang H (duben 2007). „Virion-asociovaná uracil DNA glykosyláza-2 a apurinová / apyrimidinová endonukleáza jsou zapojeny do degradace rodící se DNA HIV-1 upravené APOBEC3G“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (16): 11667–75. doi:10,1074 / jbc.M606864200. PMID 17272283.
Schröfelbauer B, Hakata Y, Landau NR (březen 2007). „Funkce HIV-1 Vpr je zprostředkována interakcí s poškozením specifickým proteinem vázajícím DNA DDB1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (10): 4130–5. doi:10.1073 / pnas.0610167104. PMC 1820720. PMID 17360488.
Pettersen HS, Sundheim O, Gilljam KM, Slupphaug G, Krokan HE, Kavli B (2007). „Uracil-DNA glykosylázy SMUG1 a UNG2 koordinují počáteční kroky opravy základní excize odlišnými mechanismy“. Výzkum nukleových kyselin. 35 (12): 3879–92. doi:10,1093 / nar / gkm372. PMC 1919486. PMID 17537817.

externí odkazy

CCNO umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CCNO podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000152669 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042417 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: CCNO cyklin O“.

[pmid10393198-6] A ^b Otterlei M, Warbrick E, Nagelhus TA, Haug T, Slupphaug G, Akbari M, Aas PA, Steinsbekk K, Bakke O, Krokan HE (červenec 1999). "Postreplikativní oprava základní excize v ohniscích replikace". Časopis EMBO. 18 (13): 3834–44. doi:10.1093 / emboj / 18.13.3834. PMC 1171460. PMID 10393198.

[pmid12171929-7] Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]