Pterobranchia mitochondriální kód - Pterobranchia mitochondrial code

The mitochondriální kód pterobranchia (překladová tabulka 24) je genetický kód používá mitochondriální genom Rhabdopleura compacta (Pterobranchia ). Pterobranchia jsou jednou ze dvou skupin v Hemichordata které spolu s Ostnokožci a Chordata tvoří tři hlavní linie rodu deuterostomy. AUA překládá do isoleucin v Rhabdopleura jak to dělá v Echinodermata a Enteropneusta zatímco AUA kóduje methionin v Chordata. Přiřazení AGG k lysin se nenachází jinde v mitochondriích deuterostomu, ale vyskytuje se u některých taxonů Arthropoda.^[1] Tento kód sdílí s mnoha dalšími mitochondriálními kódy opětovné přiřazení UGA STOP tryptofan a AGG a AGA na jinou aminokyselinu než arginin. Zasvěcení kodony v Rhabdopleura compacta jsou ATG a GTG.^[1]

Kód 24 je velmi podobný mitochondriální kód 33 pro Pterobranchia.^[2]

Kód

AA = FFLLSSSSYY ** CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGG

Začíná = --- M --------------- M --------------- M ------------- --M ------------

Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGG

Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG

Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Základny: adenin (A), cytosin (C), guanin (G) a tymin (T) nebo uracil (U).

Aminokyseliny: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Kyselina asparagová (Asp, D), Cystein (Cys, C), Kyselina glutamová (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glycin (Gly, G), Histidin (Jeho, H), Isoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lysin (Lys, K), Methionin (Met, M), Fenylalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonin (Thr, T), Tryptofan (Trp, W), Tyrosin (Tyr, Y), Valine (Val, V)

Rozdíly od standardního kódu


Kodony DNA	Kodony RNA	Tento kód (24)	Standardní kód (1)
`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
`AGG`	`AGG`	`Lys` `(K)`	`Arg` `(R)`
`TGA`	`UGA`	`Trp` `(Ž)`	`STOP = Ter` `(*)`

Viz také

Seznam genetických kódů

Reference

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.^[3]

^ ^A ^b Perseke, Marleen; Hetmank, Joerg; Bernt, Matthias; Stadler, Peter F; Schlegel, Martin; Bernhard, Detlef (2011-05-20). „Enigmatický mitochondriální genom Rhabdopleura compacta (Pterobranchia) odhaluje pohled na výběr účinného systému tRNA a podporuje monofylii Ambulacraria“. BMC Evoluční biologie. 11 (1): 134. doi:10.1186/1471-2148-11-134. ISSN 1471-2148. PMC 3121625. PMID 21599892.
^ Li, Yuanning; Kocot, Kevin M .; Tassia, Michael G .; Cannon, Johanna T .; Bernt, Matthias; Halanych, Kenneth M. (01.01.2019). „Mitogenomika odhaluje nový genetický kód v Hemichordata“. Biologie genomu a evoluce. 11 (1): 29–40. doi:10.1093 / gbe / evy254. PMC 6319601. PMID 30476024.
^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. „Genetické kódy“. Prohlížeč taxonomie. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine. Citováno 28. června 2014.

externí odkazy

Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[Perseke2011-1] A ^b Perseke, Marleen; Hetmank, Joerg; Bernt, Matthias; Stadler, Peter F; Schlegel, Martin; Bernhard, Detlef (2011-05-20). „Enigmatický mitochondriální genom Rhabdopleura compacta (Pterobranchia) odhaluje pohled na výběr účinného systému tRNA a podporuje monofylii Ambulacraria“. BMC Evoluční biologie. 11 (1): 134. doi:10.1186/1471-2148-11-134. ISSN 1471-2148. PMC 3121625. PMID 21599892.

[Li2019-2] Li, Yuanning; Kocot, Kevin M .; Tassia, Michael G .; Cannon, Johanna T .; Bernt, Matthias; Halanych, Kenneth M. (01.01.2019). „Mitogenomika odhaluje nový genetický kód v Hemichordata“. Biologie genomu a evoluce. 11 (1): 29–40. doi:10.1093 / gbe / evy254. PMC 6319601. PMID 30476024.

[NCBI-3] Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. „Genetické kódy“. Prohlížeč taxonomie. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine. Citováno 28. června 2014.

[1]

[2]

[3]