Cephalodiscidae mitochondriální kód - Cephalodiscidae mitochondrial code
The Cephalodiscidae mitochondriální kód (překladová tabulka 33) je genetický kód používá mitochondriální genom Cephalodiscidae (Pterobranchia ). Pterobranchia jsou jednou ze dvou skupin v Hemichordata které spolu s Ostnokožci a Chordata tvoří hlavní subtypy deuterostomy.
Kód 33 je velmi podobný mitochondriální kód 24 pro Pterobranchia, která také patří k Hemichordata, kromě toho, že používá UAA pro tyrosin spíše než jako stop kodon.[1]
Tento kód sdílí s mnoha dalšími mitochondriálními kódy opětovné přiřazení UGA STOP tryptofan a AGG a AGA na jinou aminokyselinu než arginin. Postoupení AGG však na lysin u pterobranchiánních mitogenomů se nenachází jinde v mitochondriích deuterostomu, ale vyskytuje se u některých taxonů Arthropoda.[2]
Kód
AA = FFLLSSSSYYY * CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGGZačíná = --- M ------- * ------- M --------------- M ------------- --M ------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Základny: adenin (A), cytosin (C), guanin (G) a tymin (T) nebo uracil (U).
Aminokyseliny: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Kyselina asparagová (Asp, D), Cystein (Cys, C), Kyselina glutamová (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glycin (Gly, G), Histidin (Jeho, H), Isoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lysin (Lys, K), Methionin (Met, M), Fenylalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonin (Thr, T), Tryptofan (Trp, W), Tyrosin (Tyr, Y), Valine (Val, V).
Rozdíly od standardního kódu
| Kodony DNA | Kodony RNA | Tento kód (33) | Standardní kód (1) | |
|---|---|---|---|---|
| TAA | UAA | Tyr (Y) | STOP = Ter (*) | |
| TGA | UGA | Trp (Ž) | STOP = Ter (*) | |
| AGA | AGA | Ser (S) | Arg (R) | |
| AGG | AGG | Lys (K) | Arg (R) |
Viz také
Reference
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.[3]
- ^ Li, Yuanning; Kocot, Kevin M .; Tassia, Michael G .; Cannon, Johanna T .; Bernt, Matthias; Halanych, Kenneth M. (01.01.2019). „Mitogenomika odhaluje nový genetický kód v Hemichordata“. Biologie genomu a evoluce. 11 (1): 29–40. doi:10.1093 / gbe / evy254. PMC 6319601. PMID 30476024.
- ^ Perseke M, Hetmank J, Bernt M, Stadler PF, Schlegel M, Bernhard D (květen 2011). "Tajemný mitochondriální genom Rhabdopleura compacta (Pterobranchia) odhaluje pohled na výběr účinného systému tRNA a podporuje monofylii Ambulacraria “. BMC Evol Biol. 11 (134): 134. doi:10.1186/1471-2148-11-134. PMC 3121625. PMID 21599892.
- ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. „Genetické kódy“. Prohlížeč taxonomie. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine. Citováno 7. ledna 2019.