Picobirnavirus - Picobirnavirus
Picobirnavirus | |
---|---|
![]() | |
Elektronový mikrofotografie částic lidského picobirnaviru | |
Klasifikace virů ![]() | |
(bez hodnocení): | Virus |
Oblast: | Riboviria |
Království: | Orthornavirae |
Kmen: | Pisuviricota |
Třída: | Duplopiviricetes |
Objednat: | Durnavirales |
Rodina: | Picobirnaviridae |
Rod: | Picobirnavirus |
Zadejte druh | |
Lidský picobirnavirus |
Picobirnavirus je rod dvouvláknové RNA viry. Je to jediný rod z rodiny Picobirnaviridae.[1] Ačkoli amniotes Předpokládá se, že tyto viry, zejména savci, slouží jako hostitelé, že tyto viry mohou infikovat bakterie a možná i některé další bezobratlé.[2][3] V současné době existují tři druhy v tomto rodu, včetně druhů druhů lidský picobirnavirus. Přidružené příznaky zahrnují gastroenteritida u zvířat a lidí, ačkoli asociace nemocí je nejasná.[4][5]
Etymologie
Picobirnavirus je malý (pico, španělština pro malý), bisegmentovaný (bi, latinský pro dva), dvouvláknový RNA virus. Picobirnaviry byly původně považovány za viry podobné birně a název byl odvozen od birnaviru (bisegmentovaná RNA), ale viriony jsou mnohem menší (průměr 35 nm vs. 65 nm). [6] Picobirnaviry byly poprvé detekovány u lidí a potkanů z rýžovité rýže v roce 1988.[7]
Struktura
Viry rodu picobirnavirus jsou neobalené, s ikosahedrickou geometrií a T = 3 symetrií. Průměr je kolem 35–40 nm.[5][4]
Genom

The genom je lineární, bipartitní a skládá se z dvouvláknových RNA. Zahrnuje a segment 1 což je 2,2–2,7 kilobáze (kb) na délku a segment 2 což je 1,2–1,9 kB. Genom kóduje tři až čtyři proteiny.[4] Gen kapsidového proteinu je kódován druhým otevřeným čtecím rámcem většího genomového segmentu 1.[4]
Picobirnaviry jsou rozděleny do dvou genoskupin na základě sekvence segment 2. The RNA-dependentní RNA polymeráza (RdRp) je kódován pomocí segment 2. Skupinové viry byly izolovány z lidí a jiných savců, stejně jako ptáků a ptáků squamaty.[8]
Životní cyklus

Picobirnaviry cílí na střevní tkáň. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Jakmile se nachází v hostitelské buňce, je virová replikace cytoplazmatická. Replikace sleduje model replikace dvouvláknového viru RNA. Transkripce dvouvláknového viru RNA je metoda transkripce. Viry se uvolňují z buňky očkováním. Savci slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou fekálně-orální.[5][4]
Taxonomie
Picobirnaviry byly původně považovány za členy rodiny Birnaviridae, ale později bylo potvrzeno, že se liší co se týče hostitele, velikosti virionu, kapsidy, RNA-dependentní RNA polymerázy, velikosti genomu a organizace.[9] Rodina Picobirnaviridae je nyní klasifikován zřetelně a skládá se z jednoho rodu Picobirnavirus, který má tři druhy:[10]
- Beihai picobirnavirus
- Picobirnavirus koní
- Lidský picobirnavirus
Reference
- ^ Delmas, B; Attoui, H; Ghosh, S; Malik, YS; Mundt, E; Vakharia, VN; Zpráva ICTV, konsorcium (únor 2019). "Profil taxonomie viru ICTV: Picobirnaviridae". The Journal of General Virology. 100 (2): 133–134. doi:10.1099 / jgv.0.001186. PMID 30484763.
- ^ Krishnamurthy, Siddharth R .; Wang, David (1. března 2018). „Rozsáhlá konzervace prokaryotických ribozomálních vazebných míst u známých i nových pikobirnavirů“. Virologie. 516: 108–114. doi:10.1016 / j.virol.2018.01.006. ISSN 0042-6822. PMID 29346073.
- ^ Yinda, Claude Kwe; Ghogomu, Stephen Mbigha; Conceição-Neto, Nádia; Beller, Leen; Deboutte, Ward; Vanhulle, Emiel; Maes, Piet; Van Ranst, Marc; Matthijnssens, Jelle (leden 2018). „Kamerunští ovocní netopýři skrývají odlišné viry, včetně rotaviru H, bastrovirů a picobirnavirů pomocí alternativního genetického kódu“. Evoluce virů. 4 (1): vey008. doi:10.1093 / ve / vey008. ISSN 2057-1577. PMC 5888411. PMID 29644096.
- ^ A b C d E „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ A b C „Zpráva ICTV: Picobirnaviridae“.
- ^ Malik, Yashpal S .; Ghosh, Souvik (leden 2020). "Etymologia: Picobirnavirus". Vznikající infekční nemoci. 26 (1). doi:10.3201 / eid2601.et2601.
- ^ Pereira, HG; Flewett, TH; Candeias, JAN; Barth, OM (1988). „Virus s bisegmentovaným dvouvláknovým genomem RNA ve střevech potkanů (Oryzomys nigripes)“. J Gen Virol. 69 (11): 2749–2754. doi:10.1099/0022-1317-69-11-2749. PMID 3053986.
- ^ Smits, SL; van Leeuwen, M; Schapendonk, CM; Schürch, AC; Bodewes, R; Haagmans, BL; Osterhaus, AD (2012). "Picobirnaviry v dýchacích cestách člověka". Vznikající infekční nemoci. 18 (9): 1539–40. doi:10,3201 / eid1809,120507. PMC 3437736. PMID 22932227.
- ^ Malik, YS; Kumar, N; Sharma, K; Dhama, K; Shabbir, MZ; Ganesh, B; Kobayashi, N; Banyai, K (2014). „Epidemiologie, fylogeneze a vývoj vznikajících enterických pikobirnavirů živočišného původu a jejich vztah k lidským kmenům“. Biomed Res. Int. 2014: 1–13. doi:10.1155/2014/780752. PMC 4124650. PMID 25136620.
- ^ „Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV)“. talk.ictvonline.org. Citováno 8. října 2020.
externí odkazy
- Malik, YS (2014). „Epidemiologie, fylogeneze a vývoj vznikajících enterických pikobirnavirů živočišného původu a jejich vztah k lidským kmenům“. Biomed Res Int. 2014: 1–13. doi:10.1155/2014/780752. PMC 4124650. PMID 25136620.
- Chandra, R (1997). „Picobirnavirus, nová skupina nepopsaných virů savců a ptáků: Minireview“. Acta Virologica. 41 (1): 59–62. PMID 9199719.
- Rosen, B; Fang, ZY; Sklo, RI; Monroe, SS (2000). „Klonování genomových segmentů lidského pikobirnaviru a vývoj detekčního testu RT-PCR“. Virologie. 277 (2): 316–29. doi:10.1006 / viro.2000.0594. PMID 11080479.
- Taxonomický návrh pro picobirnaviridae na ICTV
- Viralzone: Picobirnavirus
- Zpráva ICTV: Picobirnaviridae