Phikzvirus - Phikzvirus
| Phikzvirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Myoviridae |
| Rod: | Phikzvirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Pseudomonas phiKZ | |
Phikzvirus (synonymum: Viry podobné PhiKZ, Phikzlikevirus před rokem 2015) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Myoviridae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existují tři druhy v tomto rodu, včetně druhů typu Virus Pseudomonas phiKZ (aka Fág Pseudomonas phiKZ ).[1][2][3]
Fágy v tomto rodu jsou považovány za velké fágy. Je známo, že tři fágy tohoto rodu (φKZ, φPA3 a 201φ2-1) sestavují strukturu „fágového jádra“ podobnou funkci eukaryotické buněčné jádro který uzavírá DNA i replikační a transkripční aparát. Tyto konstrukce jsou postaveny z a tubulin -jako PhuZ protein a gp105 skořápkový protein. Poskytuje imunitu proti obraně hostitele restrikční enzymy a CRISPR -Casové systémy.[4]
Taxonomie
Skupina: dsDNA
- Rodina: Myoviridae
- Rod: Phikzvirus (dříve Phikzlikevirus)
Struktura
Fikzviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Hlava má ikosahedrickou symetrii (T = 27), s relativně velkým průměrem asi 140 nm. Ocas je dlouhý asi 160 nm, široký 35 nm.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Phikzvirus | Hlava-ocas | T = 27 | Neobalené | Oběžník | Monopartitní |
Genom
Genomy jsou kruhové, asi 280 kb dlouhé.[1] Dva ze tří druhů byly plně sekvenovány a jsou k dispozici u ICTV; vyloučení je Fág Pseudomonas Lin68. Pohybují se v rozmezí 211 až 280 tisíc nukleotidů s 201 až 306 proteiny. K dispozici jsou úplné genomy spolu s jedním dalším podobným, ale neklasifikovaným genomem tady.[3]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se připojuje k hostitelské buňce pomocí svých koncových vláken a vysune virovou DNA do hostitelské cytoplazmy kontrakcí ocasního obalu. Transkripce založená na DNA je metoda transkripce. Jakmile jsou virové geny replikovány, je prokapsid shromážděn a zabalen. Ocas se poté sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Phikzvirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Dějiny
Podle ICTV Zpráva z roku 2009, rod Viry podobné PhiKZ byl poprvé přijat jako nový rod, ve stejné době jako všechny tři jeho obsažené druhy. Tento návrh je k dispozici tady. V roce 2012 byl název změněn na Phikzlikevirus. Tento návrh je k dispozici tady.[5] Rod byl později přejmenován Phikzvirus.
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b NCBI. "Phikzlikevirus Complete Genomes". Citováno 17. února 2015.
- ^ Chaikeeratisak, V; Nguyen, K; Egan, ME; Erb, ML; Vavilina, A; Pogliano, J (15. srpna 2017). „Fágové jádro a tubulinové vřeteno jsou zachovány mezi velkými fágy pseudomonas“. Zprávy buněk. 20 (7): 1563–1571. doi:10.1016 / j.celrep.2017.07.064. PMC 6028189. PMID 28813669.
- ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2013 Release“. Citováno 17. února 2015.