Pelobacter acetylenicus - Pelobacter acetylenicus

Pelobacter acetylenicus
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Deltaproteobakterie
Objednat:
Desulfuromonadales
Rodina:
Pelobacteraceae
Rod:
Pelobacter
Druh:
P. acetylenicus
Binomické jméno
Pelobacter acetylenicus
Schink 1986[1]

Pelobacter acetylenicus je přísně anaerobní Gramnegativní tyčovitýsporeformování bakterie rodu Pelobacter. Byl izolován z mořských a sladkovodních sedimentů a lze jej použít acetylén (ethyn) jako jediný zdroj uhlíku a energie.[2]

Metabolismus

P. acetylenicus může růst acetylén, acetoin, ethanolamin, cholin, propylenglykol (1,2-propandiol), nebo glycerol, ačkoli poslední dvě podporují růst pouze za přítomnosti malého množství acetát. P. acetylenicus fermentuje substráty nepřiměřenost na acetát a ethanol nebo příslušné vyšší kyseliny a alkoholy.[2]

Genom

Genomy několika kmenů byly sekvenovány. Genom P. acetylenicus kmen DSM 3247 byl sestaven do kruhu 3 176 363 bp chromozóm zatímco kmen DSM 3246 má kruhový chromozom 3,192,352-bp. V anotaci DSM 3246 bylo identifikováno 2774 protein - kódující geny, 16 rRNA, 53 tRNA, pět nekódujících RNA a 132 pseudogeny. DSM 3247 kóduje 2 805 proteinů, devět rRNA, 51 tRNA, pět nekódujících RNA a 44 pseudogenů.[3]

Reference

  1. ^ Parte, A.C. "Pelobacter". LPSN.
  2. ^ A b Schink, Bernhard (01.08.1985). „Fermentace acetylenu obligátním anaerobem, Pelobacter acetylenicus sp. Nov“. Archiv mikrobiologie. 142 (3): 295–301. doi:10.1007 / bf00693407. ISSN  0302-8933.
  3. ^ Sutton, John M .; Baesman, Shaun M .; Fierst, Janna L .; Poret-Peterson, Amisha T .; Oremland, Ronald S .; Dunlap, Darren S .; Akob, Denise M. (02.02.2017). „Kompletní genomové sekvence dvou kmenů Pelobacter acetylenicus fermentujících acetylen“. Oznámení o genomu. 5 (6). doi:10.1128 / genomA.01572-16. PMC  5331499. PMID  28183759.

externí odkazy