Peduovirus - Peduovirus
| Peduovirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Myoviridae |
| Podčeleď: | Peduovirinae |
| Rod: | Peduovirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Escherichia P2 | |
Peduovirus (také známé jako P2-fágy a P2-podobné viry) je rod viry v pořadí Caudovirales, v rodině Myoviridae, v podčeledi Peduovirinae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé a přenos se dosahuje pasivní difúzí. V současné době existuje 6 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Virus Escherichia P2.[1][2][3]
Taxonomie
Jsou uznávány následující druhy:[2]
- Virus Escherichia fiAA91ss
- Virus Escherichia P2
- Virus Escherichia pro147
- Virus Escherichia pro483
- Virus Escherichia Wphi
- Virus Yersinia L413C
Struktura
Peduoviry jsou bez obalu, s hlavou a ocasem. Ikosahedrální hlava má průměr přibližně 60 nm a dextral symetrie (T = 7), složená ze 72 kapsomerů. Ocas je dlouhý asi 135 nm, široký 18 nm, má 6 krátkých, zauzlených vláken ocasu. Ocas je uzavřen v pouzdře, které se při kontrakci uvolňuje a klouže kolem jádra ocasu.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Peduovirus | Hlava-ocas | T = 7 dextro | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Genom
Devět z genomů třinácti virů bylo plně sekvenováno a je k dispozici na webových stránkách NCBI (ačkoli fág Salmonella Fage-2 je v současné době uveden jako nezařazený). Pohybují se v rozmezí 30 až 39 tisíc nukleotidů se 40 až 51 proteiny. Všech osm úplných genomů a několik dalších „nezařazených“ virových genomů je k dispozici na [1][3]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Virus se připojuje k hostitelské buňce pomocí ocasních vláken a ejekcí virové DNA do hostitelské cytoplazmy kontrakcí ocasního obalu. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Jakmile jsou virové geny replikovány, je prokapsid shromážděn a zabalen. Ocas se poté sestaví a zralé viriony se uvolní pomocí lýzy a proteinů holin / endolysin / spanin.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Peduovirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Dějiny
Podle ICTV Zpráva z roku 1996, rod P2likevirus byl poprvé přijat pod jménem Fágy podobné P2 v rodině Myoviridae, nepřiřazeno k podrodině. Název rodu byl změněn na Viry podobné P2 v 7. zprávě ICTV v roce 1999. Byla přesunuta do podrodiny Peduovirinae při svém vzniku v letech 2010-11. Následující rok (2012) byl rod přejmenován na P2likevirus. Tyto zprávy jsou k dispozici prostřednictvím ICTV zde: 1996, 1999, 2010, 2012.[2] Rod byl později přejmenován na Peduovirus ' a několik jeho druhů bylo odstraněno.
Reference
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 3. května 2020.
- ^ A b NCBI. „P2linkevirus Complete Genomes“. Citováno 13. února 2015.