Protein související s patogenezí - Pathogenesis-related protein
Proteiny související s patogenezí (PR) jsou bílkoviny vyrobeno v rostliny v případě a patogen Záchvat.[1] Oni jsou indukovaný jako část systémová získaná rezistence. Infekce aktivují geny, které produkují PR proteiny. Některé z těchto proteinů jsou antimikrobiální a útočí na molekuly v buněčné stěně bakterie nebo houby. Jiné mohou fungovat jako signály, které šíří „zprávy“ o infekci do okolních buněk. Infekce také stimulují zesíťování molekul v buněčné stěně a ukládání lignin „Odpovědi, které vytvářejí místní barikádu, která zpomaluje šíření patogenu do dalších částí rostliny.[2]
Kyselina salicylová hraje roli v odpor na patogeny indukcí produkce proteinů souvisejících s patogenezí.[3] Mnoho bílkoviny nacházející se ve víně jsou proteiny související s hroznovými patogeny.[4] Mezi ně patří thaumatin -jako proteiny a chitinázy.
Mnoho proteinových rodin souvisejících s patogenezí se také shoduje se skupinami lidských alergenů, i když alergie nemusí mít nic společného s obrannou funkcí proteinů.[5] Seskupení těchto proteinů podle jejich sekvenčních vlastností umožňuje najít potenciální alergenní proteiny ze sekvenovaných rostlinných genomů, což je obor přezdívaný „alergenomika ".[6]
Klasifikace
Tato sekce chybí informace o odkazech na články.Květen 2019) ( |
Od roku 2014[Aktualizace], 17 rodin PR proteinů bylo pojmenováno:[5]
Rodina | Klasifikace domén | Proteiny | Funkce | Alergeny |
---|---|---|---|---|
PR-1 | IPR034111 | PR-1 a, PR-1 b a PR-1 c | Antifungální (VÍČKO ) | Cuc m 3 (muškátový oříšek; P83834) —Ororální alergie |
PR-2 | (GH17 ) | β-1,3-glukanázy | Štěpí β-1,3-glukany |
|
PR-3 | IPR016283 | Chitináza typu I, II, IV, V, VI a VII | Endochitináza |
|
PR-4 | IPR001153 | Doména Barwin chitináza I / II | Antifungální a chitináza | Proheveiny: Hev b 6 - kontaktní dermatitida |
PR-5 | IPR001938 | Thaumatin -jako | Protiplísňový |
|
PR-6 | IPR000864 | Bramborová proteáza I | Inhibitor proteináz | |
PR-7 | (Subtilisin -jako) | Rajčatová endoproteináza P69 (O82007) | Endoproteináza | |
PR-8 | (GH18 ) | Okurková chitináza | Chitináza III | |
PR-9 | (Haemová peroxidáza III) | Tabaková ligninotvorná peroxidáza (P11965) | Peroxidáza | |
PR-10 | IPR024949 | Petržel "PR-1" | Ribonukleáza |
|
PR-11 | (GH18 ) | Chitináza tabáku V (Q43576) | Chitináza | |
PR-12 | IPR008176 | Ředkvička Rs-AFP3 (O24332) | Defensin rostlin | |
PR-13 | IPR001010 | Arabidopsis THI2.1 (Q42596) | Thionin | |
PR-14 | IPR000528 | Proteiny pro přenos lipidů | Shuttling fosfolipidů a mastných kyselin |
|
PR-15 | IPR001929 | Ječmen OxOa (P45850) | klíčit; Oxalát oxidáza | |
PR-16 | IPR001929 | Ječmen OxOLP (O49871) | germinální | |
PR-17 | IPR007541 | Tabák NtPRp27 (Q9XIY9) | odolnost proti plísni (?)[7] |
Identifikace
Protože PR proteiny jsou produkovány, když je stresována rostlinná tkáň, používají se různé způsoby stresové signalizace k „návnadě“ rostliny k expresi PR genů pro identifikaci. Užitečné stresory zahrnují skutečnou infekci nebo jednoduše obranné signály, jako je salicylát a methyl jasmonát. Proteiny lze identifikovat izolací, štěpením peptidy a porovnáním s genomovými sekvencemi (sekvenování proteinů ). Získané sekvence lze poté porovnat se známými rodinami proteinových PR za účelem kategorizace.[8][9]
Viz také
- Acibenzolar-S-methyl
- Slovníček fytopatologie
- R gen, nesouvisející proteiny rezistence
Reference
- ^ Loon LC (1985). "Proteiny související s patogenezí". Molekulární biologie rostlin. 4 (2–3): 111–116. doi:10.1007 / BF02418757. PMID 24310747.
- ^ Campbell, N.A. a Reece, J. B. (2005). Biologie (7. vydání). San Francisco: Benjamin Cummings.
- ^ Van Huijsduijnen RAMH; Alblas SW; De Rijk RH; Bol JF (1986). „Indukce proteinů souvisejících s patogenezí kyselinou salicylovou a odolnost vůči infekci mozaikovým vojtěškovým virem u různých druhů rostlin“. Journal of General Virology. 67 (10): 2135–2143. doi:10.1099/0022-1317-67-10-2135.
- ^ Waters EJ, Shirley NJ, Williams PJ (1996). „Znepokojující proteiny vína jsou proteiny související s hroznovou patogenezí“. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 44 (1): 3–5. doi:10.1021 / jf9505584.
- ^ A b Sinha, Mau; Singh, Rashmi Prabha; Kushwaha, Gajraj Singh; Iqbal, Naseer; Singh, Avinash; Kaushik, Sanket; Kaur, Punit; Sharma, Sujata; Singh, Tej P. (2014). „Aktuální přehled alergenů na rodiny proteinových proteinů souvisejících s patogenezí rostlin“. Vědecký světový deník. 2014: 543195. doi:10.1155/2014/543195. PMC 3947804. PMID 24696647. Tento článek obsahuje citace z tohoto zdroje, který je k dispozici pod Creative Commons Attribution 3.0 (CC BY 3.0) licence.
- ^ Di Girolamo, F; Muraca, M; Mazzina, O; Lante, I; Dahdah, L (červen 2015). "Proteomické aplikace v potravinové alergii: potravinová alergenomika". Aktuální názor na alergii a klinickou imunologii. 15 (3): 259–66. doi:10.1097 / ACI.0000000000000160. PMID 25899690.
- ^ Shi, X; Tian, Z; Liu, J; van der Vossen, EA; Xie, C (únor 2012). „Gen proteinu související s patogenezí brambor, StPRp27, přispívá k rasově nespecifické rezistenci proti Phytophthora infestans.“ Zprávy o molekulární biologii. 39 (2): 1909–16. doi:10.1007 / s11033-011-0937-5. PMID 21667110.
- ^ Elvira, M. I .; Galdeano, M. M .; Gilardi, P .; Garcia-Luque, I .; Serra, M. T. (19. března 2008). „Proteomická analýza proteinů souvisejících s patogenezí (PR) indukovaných kompatibilními a nekompatibilními interakcemi viru pepřové skvrnitosti (PMMoV) v rostlinách Capsicum chinense L3“. Journal of Experimental Botany. 59 (6): 1253–1265. doi:10.1093 / jxb / ern032. PMID 18375936.
- ^ Sabater-Jara, AB; Almagro, L; Belchí-Navarro, S; Barceló, AR; Pedreño, MA (březen 2011). „Methyl jasmonát indukuje proteiny související s extracelulární patogenezí v buněčných kulturách Capsicum chinense“. Signalizace a chování zařízení. 6 (3): 440–2. doi:10.4161 / psb.6.3.14451. PMC 3142433. PMID 21346408.
Další čtení
- Muthukrishnan S, Datta SP (1999). Proteiny související s patogenezí v rostlinách. Boca Raton: CRC Press. str.291. ISBN 0-8493-0697-3.
- „Proteiny vyšších rostlin související s obranou“. dmd.nihs.go.jp.
Tento článek zahrnuje text Mau Sinha, Rashmi Prabha Singh, Gajraj Singh Kushwaha, Naseer Iqbal, Avinash Singh, Sanket Kaushik, Punit Kaur, Sujata Sharma a Tej P. Singh dostupné pod CC BY 3.0 licence.
externí odkazy
- Nomenklatura alergenů WHO pro konverzi alergenů na specifické sekvence.
- UniProt klíčové slovo: KW-0568
- Genová ontologie mapování: GO: 0009607, GO: 0006952
Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |