Doména Barwin - Barwin domain
| Barwin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 trojrozměrná struktura v roztoku barwinu, proteinu ze semen ječmene | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Barwin | ||||||||
| Pfam | PF00967 | ||||||||
| Pfam klan | CL0199 | ||||||||
| InterPro | IPR001153 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00619 | ||||||||
| SCOP2 | 1bw3 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se doména barwin je proteinová doména nalezený v barwin ("vyvolaný ječmenem"), a základní protein izolovaný od vodný výtažky z ječmen semena. Barwin je 125 aminokyseliny na délku a obsahuje šest cystein zbytky které dohromady tvoří tři disulfidové mosty. V protein související s patogenezí nomenklatura, je to PR-4.[1][2] Tato doména se nachází v úseku 122 aminokyselin v C-konci produktů dvou indukovaných ran geny (win1 a win2; P09761, P09762) z brambor, produktu z Pro-hevein gen kaučukovníků a protein 4 související s patogenezí tabák (P29062, P29063). Vysoká úroveň podobnosti mezi těmito proteiny a jejich schopnost svázat sacharidy, naznačují, že doména barwin může být zapojena do společného obranného mechanismu v rostliny.
Reference
- ^ Svensson B, Svendsen I, Hojrup P, Roepstorff P, Ludvigsen S, Poulsen FM (září 1992). „Primární struktura barwinu: protein ječmenného semene úzce souvisí s C-koncovou doménou proteinů kódovaných rostlinnými geny vyvolanými ranou“. Biochemie. 31 (37): 8767–70. doi:10.1021 / bi00152a012. PMID 1390663.
- ^ Ludvigsen S, Poulsen FM (září 1992). "Sekundární struktura v roztoku barwinu ze semen ječmene pomocí 1H nukleární magnetické rezonanční spektroskopie". Biochemie. 31 (37): 8771–82. doi:10.1021 / bi00152a013. PMID 1390664.