Marseilleviridae - Marseilleviridae

Marseilleviridae
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Varidnaviria
Království:Bamfordvirae
Kmen:Nucleocytoviricota
Třída:Megaviricetes
Objednat:Pimascovirales
Rodina:Marseilleviridae
Rody

Marseilleviridae je rodina z viry poprvé jmenován v roce 2012.[1] The genomy z těchto virů jsou dvouvláknová DNA. Améba jsou často hostitelé, ale existují důkazy, že se nacházejí v lidé také.[2][3][4][5] Od roku 2016 se Mezinárodní výbor pro taxonomii virů rozpoznat čtyři druhy v této rodině rozdělené mezi 2 rody.[6][7] Je členem nukleocytoplazmatické velké DNA viry clade.

Taxonomie

Skupina: dsDNA

[7]

Související viry

Obrázky zmrazeného zmrazení Marseilleviridae částice (vlevo a uprostřed) a zvětšený diagram struktury blízko vrcholu. Černé šipky označují velká hustá těla. Bílé šipky označují lipidovou dvojvrstvu.

Od té doby byly uznány další druhy.[1] První člen této uznané rodiny byl jmenován Acanthamoeba polyphaga marseillevirus. Druhým členem je Acanthamoeba castellanii lausannevirus. Byly izolovány dva další viry, ale je třeba je pojmenovat. Další člen této rodiny byl izolován od dárců krve.[4] Izolát od hmyzu -Insectomime virus - byl také hlášen.[8]

Zdá se, že viry spadají do nejméně 3 linií: (1) Marseillevirus a Cannes8virus (2) Insectomime a Tunisvirus a (3) Lausannevirus. Šestý potenciální člen této rodiny -Melbournevirus—Zdá se, že souvisí s Marseillevirus/Cannes8virus clade.[9]

Byl hlášen sedmý virus - brazilský marseillevirus -.[10] Zdá se, že tento virus patří do čtvrté linie virů v této rodině.

Byl také hlášen další virus - tokokyovirus.[11]

Dalším členem této rodiny je Kurlavirus.[12]


Tento taxon byl revidován.[13] V současné době je rozpoznáno pět linií (A-E).

Počet řádků A

Linie B

Linie C.

Linie D.

Linie E.

Dalším domnělým členem této rodiny je Marseillevirus Šanghaj. Pokud je tento virus potvrzen, patřil by do linie A.

Struktura

Viry v Marseilleviridae mají ikosahedrální geometrii. Průměr je kolem 250 nm. Genomy jsou kruhové, dlouhé přibližně 372 kB. Genom má 457 otevřených čtecích rámců.[6]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
NepřiřazenoHlava-ocasT = 16NeobalenéLineárníMonopartitní
MarseillevirusIcosahedralOběžník

Životní cyklus

Transkripce se šablonami DNA je metoda transkripce. Améba slouží jako přirozený hostitel.[6]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
MarseillevirusAmébaŽádnýFúzeLyzaCytoplazmaCytoplazmaDifúze ve vodě

Genomika

Bylo zjištěno, že promotorová sekvence - AAATATTT - je spojena s 55% identifikovaných genů v tomto viru.[14] Většina z těchto sekvencí se vyskytuje ve více kopiích.

Dějiny

Jeden z prvních členů této rodiny byl popsán v roce 2009.[15] Další členové popsaní přibližně v té době (2007) a od té doby byli zdokumentováni.[16]

Reference

  1. ^ A b Colson, Philippe; Pagnier, Isabelle; Yoosuf, Niyaz; Fournous, Ghislain; La Scola, Bernard; Raoult, Didier (2012). "'Marseilleviridae, nová rodina obřích virů infikujících améby “. Archivy virologie. 158 (4): 915–20. doi:10.1007 / s00705-012-1537-r. PMID  23188494.
  2. ^ La Scola, Bernard (2014). "Pohled na protisty jako na zdroj patogenních virů". Mikrobiální patogeneze. 77: 131–5. doi:10.1016 / j.micpath.2014.09.005. PMID  25218687.
  3. ^ Colson, Philippe; Fancello, Laura; Gimenez, Gregory; Armougom, Fabrice; Desnues, Christelle; Fournous, Ghislain; Yoosuf, Niyaz; Million, Matthieu; La Scola, Bernard; Raoult, Didier (2013). "Důkazy megaviromu u lidí". Journal of Clinical Virology. 57 (3): 191–200. doi:10.1016 / j.jcv.2013.03.018. PMID  23664726.
  4. ^ A b Popgeorgiev, Nikolay; Boyer, Mickaël; Fancello, Laura; Monteil, Sonia; Robert, Catherine; Rivet, Romain; Nappez, Claude; Azza, řekl; Chiaroni, Jacques; Raoult, Didier; Desnues, Christelle (2013). „Virus podobný marseilleviru získaný z krve darované asymptomatickými lidmi“. The Journal of Infectious Diseases. 208 (7): 1042–50. doi:10.1093 / infdis / jit292. PMID  23821720.
  5. ^ Aherfi, Sarah; Colson, Philippe; Audoly, Gilles; Nappez, Claude; Xerri, Luc; Valensi, Audrey; Million, Matthieu; Lepidi, Hubert; Costello, Regis; Raoult, Didier (2016). "Marseillevirus v lymfomu: obr v lymfatické uzlině". Infekční nemoci Lancet. 16 (10): e225 – e234. doi:10.1016 / S1473-3099 (16) 30051-2. PMID  27502174.
  6. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 12. srpna 2015.
  7. ^ A b „Virus Taxonomy: 2016 Release“. ICTV. Citováno 6. července 2017.
  8. ^ Boughalmi, Mondher; Pagnier, Isabelle; Aherfi, Sarah; Colson, Philippe; Raoult, Didier; La Scola, Bernard (2013). „První izolace marseilleviru u Diptera Syrphidae Eristalis tenax ". Intervirologie. 56 (6): 386–94. doi:10.1159/000354560. PMID  24157885.
  9. ^ Doutre, G; Philippe, N; Abergel, C; Claverie, J.-M (2014). „Analýza genomu prvního zástupce Marseilleviridae z Austrálie naznačuje, že většina jeho genů přispívá k virové kondici“. Journal of Virology. 88 (24): 14340–9. doi:10.1128 / JVI.02414-14. PMC  4249118. PMID  25275139.
  10. ^ Dornas, Fábio; Assis, Felipe; Aherfi, Sarah; Arantes, Thalita; Abrahão, Jônatas; Colson, Philippe; La Scola, Bernard (2016). „Brazilský Marseillevirus je zakládajícím členem linie v rodině Marseilleviridae“. Viry. 8 (3): 76. doi:10,3390 / v8030076. PMC  4810266. PMID  26978387.
  11. ^ Takemura, Masaharu (2016). "Návrh sekvence genomu Tokyovirus, člen rodiny Marseilleviridae Izolovaný od řeky Arakawa v Tokiu, Japonsko ". Oznámení o genomu. 4 (3): e00429–16. doi:10.1128 / genomA.00429-16. PMC  4901213. PMID  27284144.
  12. ^ Chatterjee, Anirvan; Kondabagil, Kiran (2017). "Complete genome sequence of Kurlavirus, a new member of the čeled Marseilleviridae isolated in Mumbai, India". Archivy virologie. 162 (10): 3243. doi:10.1007 / s00705-017-3469-z. PMID  28685284.
  13. ^ Fabre E, Jeudy S, Santini S, Legendre M, Trauchessec M, Claverie J-M a kol. (2017). Replikace noumeaviru závisí na přechodném dálkovém ovládání hostitelského jádra. Nat Commun 8: 15087
  14. ^ Oliveira, Graziele Pereira; Lima, Maurício Teixeira; Arantes, Thalita Souza; Assis, Felipe Lopes; Rodrigues, Rodrigo Araújo Lima; Da Fonseca, Flávio Guimarães; Bonjardim, Cláudio Antônio; Kroon, Erna Geessien; Colson, Philippe; La Scola, Bernard; Abrahão, Jônatas Santos (2017). „Vyšetřování sekvencí promotorů marseillevirů zdůrazňuje pozoruhodnou hojnost motivu AAATATTT v mezgenických regionech“. Journal of Virology. 91 (21): e01088–17. doi:10.1128 / JVI.01088-17. PMC  5640848. PMID  28794030.
  15. ^ Boyer, M; Yutin, N; Pagnier, I; Barrassi, L; Fournous, G; Espinosa, L; Robert, C; Azza, S; Sun, S; Rossmann, M.G; Suzan-Monti, M; La Scola, B; Koonin, E. V; Raoult, D (2009). „Giant Marseillevirus zdůrazňuje roli améb jako tavícího kotle při vzniku chimérických mikroorganismů“. Sborník Národní akademie věd. 106 (51): 21848–53. Bibcode:2009PNAS..10621848B. doi:10.1073 / pnas.0911354106. PMC  2799887. PMID  20007369.
  16. ^ Aherfi, Sarah; La Scola, Bernard; Pagnier, Isabelle; Raoult, Didier; Colson, Philippe (2014). „Rozšiřující se rodina Marseilleviridae“. Virologie. 466-467: 27–37. doi:10.1016 / j.virol.2014.07.014. PMID  25104553.

externí odkazy