MYPN - MYPN
Myopalladin je protein že u lidí je kódován MYPN gen. Myopalladin je svalový protein zodpovědný za vázání bílkovin na Z-disk a pro komunikaci mezi sarkoméra a jádro v srdeční a kosterní sval[5][6][7]
Struktura
Myopalladin je protein 145,2 kDa složený z 1320 aminokyselin.[8][9] Myopalladin má pět Ig -jako opakování v proteinu a a prolin - bohatá doména. Myopalladin váže homologní doménu Src mlhovina a nebulin a napíná to alfa-aktinin přes jeho C-terminál vazba domény na EF ruka domény alfa-aktinin. The N-terminál oblast myopalladinu se váže na jaderný protein KAPR, o kterém je známo, že reguluje genová exprese ve svalu.[5] Bylo také prokázáno, že se váže ANKRD23.[10]
Funkce
Myopalladin má duální subcelulární lokalizaci, sídlící v obou jádro a sarkoméra /I-kapely ve svalu. V souladu s tím má myopalladin funkce jak při sestavování sarkomérů, tak při kontrole genové exprese.[5] Specifika těchto funkcí byla získána ze studií zahrnujících MYPN mutanti spojené s různými kardiomyopatie. Mutant myopalladinu Q529X prokázal nekompetentnost při náboru klíčových vazebných partnerů, jako je desmin, alfa-aktinin a KAPR do Z-disk během myofibrilogeneze. Naproti tomu mutant Y20C vedl ke snížené expresi vazebných partnerů.[11]
Klinický význam
Mutace v MYPN byly spojeny s dilatační kardiomyopatie, Hypertrofické kardiomyopatie a omezující kardiomyopatie.[11][12]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138347 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020067 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C Bang ML, Mudry RE, McElhinny AS, Trombitás K, Geach AJ, Yamasaki R, Sorimachi H, Granzier H, Gregorio CC, Labeit S (duben 2001). „Myopalladin, nový 145 kilodaltonový sarkomérní protein s více rolemi v proteinových sestavách Z-disku a I-pásma“. The Journal of Cell Biology. 153 (2): 413–27. doi:10.1083 / jcb.153.2.413. PMC 2169455. PMID 11309420.
- ^ Ma K, Wang K (prosinec 2002). "Interakce nebulinové SH3 domény s titinem PEVK a myopalladinem: důsledky pro signální a montážní roli titinu a nebulinu". FEBS Dopisy. 532 (3): 273–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03655-4. PMID 12482578. S2CID 18125444.
- ^ „Entrez Gene: MYPN myopalladin“.
- ^ Chung, Joon-Sub. „Informace o bílkovinách - myopalladin“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB). NHLBI Proteomics Center na UCLA. Citováno 2015-04-29.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ Miller MK, Bang ML, Witt CC, Labeit D, Trombitas C, Watanabe K, Granzier H, McElhinny AS, Gregorio CC, Labeit S (listopad 2003). „Svalové ankyrinové opakující se proteiny: CARP, ankrd2 / Arpp a DARP jako rodina molekul stresové reakce na bázi titinových vláken“. Journal of Molecular Biology. 333 (5): 951–64. doi:10.1016 / j.jmb.2003.09.012. PMID 14583192.
- ^ A b Purevjav E, Arimura T, Augustin S, Huby AC, Takagi K, Nunoda S, Kearney DL, Taylor MD, Terasaki F, Bos JM, Ommen SR, Shibata H, Takahashi M, Itoh-Satoh M, McKenna WJ, Murphy RT, Labeit S, Yamanaka Y, Machida N, Park JE, Alexander PM, Weintraub RG, Kitaura Y, Ackerman MJ, Kimura A, Towbin JA (květen 2012). „Molekulární základ pro klinickou heterogenitu u zděděných kardiomyopatií způsobených mutacemi myopalladinu“. Lidská molekulární genetika. 21 (9): 2039–53. doi:10,1093 / hmg / dds022. PMC 3315208. PMID 22286171.
- ^ Duboscq-Bidot L, Xu P, Charron P, Neyroud N, Dilanian G, Millaire A, Bors V, Komajda M, Villard E (leden 2008). „Mutace v genu pro protein myopalladinu v pásmu Z a idiopatická dilatovaná kardiomyopatie“. Kardiovaskulární výzkum. 77 (1): 118–25. doi:10.1093 / cvr / cvm015. PMID 18006477.
Další čtení
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Miller MK, Bang ML, Witt CC, Labeit D, Trombitas C, Watanabe K, Granzier H, McElhinny AS, Gregorio CC, Labeit S (listopad 2003). „Svalové ankyrinové opakující se proteiny: CARP, ankrd2 / Arpp a DARP jako rodina molekul stresové reakce na bázi titinových vláken“. Journal of Molecular Biology. 333 (5): 951–64. doi:10.1016 / j.jmb.2003.09.012. PMID 14583192.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (říjen 2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Přírodní biotechnologie. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.