Vývozce lysinu - Lysine exporter - Wikipedia
| Vývozce D- a L-lysinu, histidinu a argininu (LysE) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | LysE aka CGL1262 | ||||||||
| Pfam | PF01810 | ||||||||
| InterPro | IPR001123 | ||||||||
| TCDB | 2.A.75 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 248 | ||||||||
| OPM protein | 2n4x | ||||||||
| |||||||||
Vývozci lysinu plocha nadčeleď z transmembránové proteiny [1][2] které exportují aminokyseliny, lipidy a těžký kov ionty.[2] Poskytují iontové homeostáza, hrát roli v obálka buňky montáž a chránit před nadměrnými koncentracemi těžkých kovů v cytoplazma. Nadčeleď byla pojmenována na základě raného objevu LysE nosný protein z Corynebacterium glutamicum.
Rodiny
2.A.75 - Rodina vývozců L-lysinu (LysE)
2.A.76 - Rodina rezistence na homoserin / threonin (RhtB)
2.A.77 - Rodina odolnosti proti kadmiu (CadD)
2.A.95 - Rodina 6TMS neutrálních transportérů aminokyselin (NAAT)
2.A.106 - Ca2+: H+ Rodina Antiporter-2 (CaCA2)
2.A.107 - The Mn2+ rodina vývozců (MntP)
2.A.108 - Rodina transportérů železa / olova (ILT)
2.A.109 - Rodina Tellurium Ion Resistance (TerC)
2.A.113 - Rodina nikl / kobaltových transportérů (NicO)
2.A.116 - Rodina peptidoglykolipidů adresujících proteiny (GAP)
5.A.1 - Rodina disulfidové vazebné oxidoreduktázy D (DsbD)
Rodina LysE
Dva členové rodiny LysE (LysE of Corynebacterium glutamicum (TC # 2.A.75.1.1 ) a ArgO z E-coli) byly funkčně charakterizovány, ale funkčně necharakterizované homology jsou kódovány v genomech mnoha bakterií včetně Bacillus subtilis, Mycobacterium tuberculosis, Aeromonas salmonicida, Helicobacter pylori, Vibrio cholerae a Yersinia pestis. Členové rodiny LysE se tedy nacházejí v široké distribuci Gramnegativní a Grampozitivní bakterie.
Struktura
Tyto proteiny jsou dlouhé 190-240 aminoacylových zbytků a mají šest hydrofobních oblastí. PhoA fúzní analýzy LysE z C. glutamicum poskytl důkazy o typologii transmembránového α-helikálního klíče (TMS) s N-koncem uvnitř a C-koncem venku.[3] Některé důkazy však naznačují topologii 6 TMS.[4]
Funkce
Zdá se, že LysE katalyzuje jednosměrný odtok L-lysinu (a dalších bazických aminokyselin, jako je L-arginin), a poskytuje jediný způsob vylučování L-lysinu. Předpokládá se, že zdrojem energie je hybná síla protonu (H+ antiport). The E-coli Homolog ArgO (TC # 2.A.75.1.2 ) výtoky arginin a možná lysin a kanavanin také.[5]
Dřívější studie ukázaly, že rodina LysE souvisí s rodinou RhtB (TC # 2.A.76 ) stejně jako rodina CadD (TC # 2.A.77 ) na základě podobných velikostí a topologií jejich členů a výsledků PSI-BLAST.[3]
Zobecněná transportní reakce
Zobecněná transportní reakce pro LysE je:
Lysin (v) + [nH+ (out) nebo nOH− (dovnitř)] Lysin (ven) + [nH+ (in) nebo nOH− (ven)].
Reference
Tento článek zahrnuje text k dispozici pod CC BY 4.0 licence.
- ^ Vrljic M, Garg J, Bellmann A, Wachi S, Freudl R, Malecki MJ, Sahm H, Kozina VJ, Eggeling L, Saier MH, Eggeling L, Saier MH (listopad 1999). „LysE superrodina: topologie lysinového exportéru LysE z Corynebacterium glutamicum, paradyme pro novou nadrodinu transmembránových solutních translokátorů“. Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 1 (2): 327–36. PMID 10943564.
- ^ A b Tsu BV, Saier MH (01.01.2015). „Nadrodina transportních proteinů LysE podílejících se na buněčné fyziologii a patogenezi“. PLOS ONE. 10 (10): e0137184. Bibcode:2015PLoSO..1037184T. doi:10.1371 / journal.pone.0137184. PMC 4608589. PMID 26474485.
- ^ A b Vrljic M, Sahm H, Eggeling L (prosinec 1996). „Nový typ transportéru s novým typem buněčné funkce: export L-lysinu z Corynebacterium glutamicum“. Molekulární mikrobiologie. 22 (5): 815–26. doi:10.1046 / j.1365-2958.1996.01527.x. PMID 8971704. S2CID 26112791.
- ^ Saier, MH ml. "2.A.75 Rodina vývozců L-lysinu (LysE)". Databáze klasifikace transportérů. Saier Lab Bioinformatics Group / SDSC.
- ^ Nandineni MR, Gowrishankar J (červen 2004). "Důkazy pro exportér argininu kódovaný yggA (argO), který je regulován transkripčním regulátorem typu LysR ArgP v Escherichia coli". Journal of Bacteriology. 186 (11): 3539–46. doi:10.1128 / JB.186.11.3539-3546.2004. PMC 415761. PMID 15150242.
