Transportéry NicO - NicO transporters
The Rodina nikl / kobaltových transportérů (NicO) (TC # 2.A.113 ) je členem Nadrodina lysinu (LysE).[1] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny NicO lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.[2]
Homologie
Homologové rodiny NicO mají různé předpovídané topologie: 6, 7 a 8 TMS. Jeden takový homolog, RcnA (YohM; TC # 2.A.113.1.1 ) z E-coli (274 aas) má 6 domnělých transmembránových segmentů (TMS) v uspořádání 3 + 3 s velkou hydrofilní smyčkou mezi domnělými TMS 3 a 4.[3] Několik homologů RcnA (např. RcnA homolog z Ralstonia solanacearum; TC # 2.A.113.1.3; CAD17703) mají 7 domnělých TMS (4 + 3). Ještě další homolog, UreH z Methanocaldococcus janaschii (TC # 2.A.113.1.4 ) má 6 domnělých TMS v charakterističtějším uspořádání 3 + 3 TMS. Rodina NicO v rámci LysE nadčeleď může mít společný původ s TOG superrodina poté, co ztratil TMS 1 a 4 v topologii 8 nadřízených TMS TOG.[2]
Funkce
Předpokládá se, že tento protein katalyzuje Co2+ a Ni2+ výtok.[3]
Celková reakce katalyzovaná proteiny rodiny NicO je pravděpodobně:
[Ni2+ nebo Co.2+] (v) → [Ni2+ nebo Co.2+] (ven).
Viz také
- Rodina NiCoT, rodina transportérů niklu / kobaltu v nadrodině TOG
- Nikl
- Kobalt
- Databáze klasifikace transportérů
- Transportní protein
Další čtení
- Iwig, Jeffrey S .; Rowe, Jessica L .; Chivers, Peter T. (10.10.2006). „Homeostáza niklu v Escherichia coli - efluxní cesta rcnR-rcnA a její vazba na funkci NikR“. Molekulární mikrobiologie 62 (1): 252–262.doi:10.1111 / j.1365-2958.2006.05369.x. ISSN 1365-2958.
- Marrero, Jeannette; Auling, Georg; Coto, Orquidea; Nies, Dietrich H. (01.01.2007). „Vysoká odolnost vůči kobaltu a niklu, ale pravděpodobně bez odtoku transenvelope: Kovová rezistence v kubánském kmeni Serratia marcescens C-1“. Mikrobiální ekologie 53 (1): 123–133. doi:10.1007 / s00248-006-9152-7. ISSN 0095-3628. PMID 17186148.
- Protchenko, Olga; Rodriguez-Suarez, Roberto; Androphy, Rachel; Bussey, Howard; Philpott, Caroline C. (2006-07-28). „Obrazovka pro zachycení genů hemu identifikuje rodinu FLC potřebnou pro import FAD do endoplazmatického retikula“. The Journal of Biological Chemistry 281 (30): 21445–21457.doi:10,1074 / jbc.M512812200. ISSN 0021-9258.PMID 16717099.
Reference
- ^ Tsu, Brian V .; Saier, Milton H. (01.01.2015). „Nadrodina transportních proteinů LysE podílejících se na buněčné fyziologii a patogenezi“. PLOS ONE. 10 (10): e0137184. Bibcode:2015PLoSO..1037184T. doi:10.1371 / journal.pone.0137184. ISSN 1932-6203. PMC 4608589. PMID 26474485.
- ^ A b „Rodina nikl / kobaltový transportér (NicO)“. Databáze klasifikace transportérů. Citováno 2016-02-29.
- ^ A b Rodrigue, Agnès; Effantin, Géraldine; Mandrand-Berthelot, Marie-Andrée (2005-04-15). „Identifikace rcnA (yohM), genu pro rezistenci na nikl a kobalt v Escherichia coli“. Journal of Bacteriology. 187 (8): 2912–2916. doi:10.1128 / JB.187.8.2912-2916.2005. ISSN 0021-9193. PMC 1070376. PMID 15805538.
 | Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |