Odpor telurového iontu - Tellurium ion resistance

The Rodina Tellurium Ion Resistance (TerC) (TC # 2.A.109 ) je součástí Nadrodina lysinu (LysE). Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny TerC lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.[1]

TerC

Rodina TerC (Pfam 03741 ) zahrnuje E-coli TerC protein (TC # 2.A.109.1.1 ), který se podílí na odolnosti vůči teluru.[2] Předpokládá se, že bude katalyzovat odtok iontů telluru.[2][3] TerC je kódován plazmidem pTE53 z klinického izolátu z E-coli. Má 346 aminoacylových zbytků (aas) a 9 domnělých transmembránových segmentů (TMS) s velkou hydrofilní smyčkou mezi TMS 5 a 6.[2]

Homolog v Arabidopsis thaliana (TC # 9.A.30.2.1 ) může fungovat v biogenizaci prothylakoidní membrány během časného vývoje chloroplastů.[4] Má 384 aas a 7-8 domnělých TMS. v E-coliTerC tvoří membránový komplex s TerB a také s DctA, PspA, HslU a RplK. Komplex TerB / TerC může spojovat různé funkční moduly s biochemickými aktivitami transportu C4-dikarboxylátu, vnitřní stresovou odezvou membrány (regulační komplex proteinu fágového šoku), aktivitou ATPázy / chaperonu a proteosyntézou.[5] Může to být součást systému reakce na stres snímaného kovem.[6] Společná přítomnost TerC a TerE, ale ne TerF, koreluje s telluritovou rezistencí, když bylo testováno několik stovek bakteriálních kmenů.[7]

Funkce

Reakce, která má být katalyzována TerC, je:

ionty teluru (dovnitř) → ionty teluru (ven).

Viz také

Další čtení

  • Taylor, D. E. (1999). "Bakteriální odolnost vůči teluritu". Trendy v mikrobiologii. 7 (3): 111–115. doi:10.1016 / s0966-842x (99) 01454-7. PMID  10203839.
  • Kazanov, M.D .; Vitreschak, A.G .; Gelfand, M.S. (2007). „Hojnost a funkční rozmanitost riboswitchů v mikrobiálních komunitách“. BMC Genomics. 8: 347. doi:10.1186/1471-2164-8-347. PMC  2211319. PMID  17908319.
  • Kwon, K.C .; Cho, M.H. (2008). „Odstranění produktu genu AtTerC lokalizovaného v chloroplastech u Arabidopsis thaliana vede ke ztrátě tylakoidní membrány a k letalitě sazenic.“ Rostlina J. 55 (3): 428–442. doi:10.1111 / j.1365-313X.2008.03523.x. PMID  18429937.
  • Meyer, M.M .; Hammond, M.C .; Salinas, Y .; Roth, A .; Sudarsan, N .; Breaker, R.R. (2011). „Výzvy identifikace ligandu pro kandidáty na riboswitch“. RNA Biol. 8 (1): 5–10. doi:10,4161 / rna.8.1.13865. PMC  3142362. PMID  21317561.

Reference

  1. ^ „2.A.109 Rodina Tellurium Ion Resistance (TerC)“. Databáze klasifikace transportérů. Citováno 2016-02-26.
  2. ^ A b C Burian, J .; Tu, N .; Kl'ucár, L .; Guller, L .; Lloyd-Jones, G .; Stuchlík, S .; Fejdi, P .; Siekel, P .; Turna, J. (01.01.1998). „Klonování in vivo a in vitro a fenotypová charakterizace determinantu rezistence vůči telluritu udělená plazmidem pTE53 klinického izolátu Escherichia coli“. Folia Microbiologica. 43 (6): 589–599. doi:10.1007 / bf02816374. ISSN  0015-5632. PMID  10069007. S2CID  44237747.
  3. ^ Kormutakova, R .; Klucar, L .; Turna, J. (06.06.2000). "DNA sekvenční analýza determinantu rezistence vůči telluritu z klinického kmene Escherichia coli a identifikace esenciálních genů". BioMetals. 13 (2): 135–139. doi:10.1023 / A: 1009272122989. ISSN  0966-0844. PMID  11016400. S2CID  22672098.
  4. ^ Kwon, Kwang-Chul; Cho, Myeon Haeng (2008-08-01). „Odstranění produktu genu AtTerC lokalizovaného v chloroplastech u Arabidopsis thaliana vede ke ztrátě tylakoidní membrány a k letalitě sazenic.“ The Plant Journal. 55 (3): 428–442. doi:10.1111 / j.1365-313X.2008.03523.x. ISSN  1365-313X. PMID  18429937.
  5. ^ Turkovicova, L .; Smidak, R .; Jung, G .; Turna, J .; Lubec, G .; Aradska, J. (01.01.2016). „Proteomická analýza TerC internomomu: Nové vazby na odolnost vůči telluritu a patogenitu“. Journal of Proteomics. 136: 167–73. doi:10.1016 / j.jprot.2016.01.003. ISSN  1876-7737. PMID  26778143.
  6. ^ Anantharaman, Vivek; Iyer, Lakshminarayan M .; Aravind, L. (2012-10-30). „Ter-dependentní systémy reakce na stres: nové cesty související se snímáním kovů, produkcí metabolitu podobného nukleosidům a zpracováním DNA“. Molekulární biosystémy. 8 (12): 3142–3165. doi:10.1039 / c2mb25239b. ISSN  1742-2051. PMC  4104200. PMID  23044854.
  7. ^ Orth, Dorothea; Grif, Katharina; Dierich, Manfred P .; Würzner, Reinhard (01.03.2007). „Variabilita rezistence vůči telluritu a shluku ter genů mezi bakteriemi Escherichia coli produkujícími Shiga toxin izolované z lidí, zvířat a potravin“. Výzkum v mikrobiologii. 158 (2): 105–111. doi:10.1016 / j.resmic.2006.10.007. ISSN  0923-2508. PMID  17317110.