Protein vázající lipopolysacharid - Lipopolysaccharide binding protein

LBP
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4M4D
Identifikátory
Aliasy	LBP, BPIFD2, protein vázající lipopolysacharid
Externí ID	OMIM: 151990 MGI: 1098776 HomoloGene: 3055 Genové karty: LBP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	38,377,013 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	158,332,852 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vázání kyseliny lipoteichoové; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba lipidů; • vazba na receptory; • vázání lipopolysacharidů; • vazba lipopeptidů;
Buněčná složka	• membrána; • extracelulární exosom; • extracelulární oblast; • povrch buňky; • extracelulární;
Biologický proces	• detekce molekuly bakteriálního původu; • transport lipidů; • signální dráha podobná mýtnému receptoru 4; • proces imunitního systému; • chemotaxe leukocytů podílející se na zánětlivé reakci; • buněčná obranná odpověď; • buněčná odpověď na kyselinu lipoteichoovou; • obranná reakce na bakterii; • transport lipopolysacharidů; • pozitivní regulace produkce interleukinu-8; • pozitivní regulace produkce interleukinu-6; • pozitivní regulace chemotaxe neutrofilů; • pozitivní regulace signální dráhy podobného mýtnému receptoru 4; • pozitivní regulace produkce chemokinů; • negativní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • lipopolysacharidem zprostředkovaná signální dráha; • opsonizace; • obranná odpověď na gramnegativní bakterii; • pozitivní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • reakce na lipopolysacharid; • aktivace makrofágů zapojených do imunitní odpovědi; • pozitivní regulace respiračního výbuchu podílejícího se na zánětlivé reakci; • reakce v akutní fázi; • vrozený imunitní systém; • obranná reakce na grampozitivní bakterii; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • pozitivní regulace aktivace makrofágů; • signální dráha podobná mýtnému receptoru; • lokalizace makromolekul; • pozitivní regulace cytolýzy; • doprava; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3929
	16803
	ENSG00000129988
	ENSMUSG00000016024
	P18428
	Q61805
	NM_004139
	NM_008489
	NP_004130
	NP_032515
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající lipopolysacharid je protein že u lidí je kódován LBP gen.^[5]^[6]

LBP je rozpustný protein akutní fáze který se váže na bakteriální lipopolysacharid (nebo LPS) k vyvolání imunitních odpovědí prezentací LPS na důležitém buněčném povrchu receptory rozpoznávání vzoru volala CD14 a TLR4.^[7]

Protein kódovaný tímto genem se podílí na akutní fázi imunologické odpovědi na gramnegativní bakteriální infekce. Gramnegativní bakterie obsahují na své vnější buněčné stěně glykolipid, lipopolysacharid (LPS). Dohromady s protein zvyšující baktericidní permeabilitu (BPI), kódovaný protein váže LPS a interaguje s receptorem CD14, pravděpodobně hraje roli v regulaci LPS-závislých monocytových odpovědí. Studie na myších naznačují, že kódovaný protein je nezbytný pro rychlou reakci akutní fáze na LPS, ale nikoli pro odstranění LPS z oběhu. Tento protein je součástí rodiny strukturně a funkčně příbuzných proteinů, včetně BPI, proteinu pro přenos cholesterylesteru v plazmě (CETP) a proteinu pro přenos fosfolipidů (PLTP). Nakonec se tento gen nachází na chromozomu 20, bezprostředně za genem BPI.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein vázající lipopolysacharid komunikovat s CD14, TLR2, TLR4 a ko-receptor MD-2.^[8]^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129988 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016024 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gray PW, Corcorran AE, Eddy RL Jr, Byers MG, Show TB (březen 1993). „Geny pro lipopolysacharid vázající protein (LBP) a protein zvyšující baktericidní permeabilitu (BPI) jsou kódovány ve stejné oblasti lidského chromozomu 20“. Genomika. 15 (1): 188–90. doi:10.1006 / geno.1993.1030. PMID 8432532.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LBP lipopolysacharid binding protein“.
^ Muta T, Takeshige K (2001). „Základní role CD14 a proteinu vázajícího lipopolysacharidy pro aktivaci toll-like receptoru (TLR) 2 a také TLR4 Rekonstituce aktivace TLR2 a TLR4 rozlišitelnými ligandy v přípravcích LPS.“ Eur. J. Biochem. 268 (16): 4580–9. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02385.x. PMID 11502220.
^ Thomas, Celestine J; Kapoor Mili; Sharma Shilpi; Bausinger Huguette; Zyilan Umit; Lipsker Dan; Hanau Daniel; Surolia Avadhesha (listopad 2002). „Důkaz trimolekulárního komplexu zahrnujícího LPS, protein vázající LPS a rozpustný CD14 jako efektor odpovědi LPS“. FEBS Lett. 531 (2): 184–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03499-3. ISSN 0014-5793. PMID 12417309. S2CID 25135963.
^ Yu, B; Wright SD (1995). „LPS závislá interakce proteinu vázajícího Mac-2 s imobilizovaným CD14“. J. Inflamm. 45 (2): 115–25. ISSN 1078-7852. PMID 7583357.
^ Erridge, C; Pridmore, A; Eley, A; Stewart, J; Poxton, IR (2004). „Lipopolysacharidy Bacteroides fragilis, Chlamydia trachomatis a Pseudomonas aeruginosa signalizují prostřednictvím mýtného receptoru 2“. Journal of Medical Microbiology. 53 (Pt 8): 735–40. doi:10.1099 / jmm.0.45598-0. PMID 15272059.

Další čtení

Schumann RR, Leong SR, Flaggs GW a kol. (1990). "Struktura a funkce lipopolysacharidového vazebného proteinu". Věda. 249 (4975): 1429–31. Bibcode:1990Sci ... 249.1429S. doi:10.1126 / science.2402637. PMID 2402637.
Wilde CG, Seilhamer JJ, McGrogan M a kol. (1994). "Baktericidní / protein zvyšující permeabilitu a protein vázající lipopolysacharid (LPS). Vazebné vlastnosti LPS a účinky na aktivaci buněk zprostředkovanou LPS". J. Biol. Chem. 269 (26): 17411–6. PMID 7517398.
Park CT, Wright SD (1996). „Bylo zjištěno, že protein vázající lipopolysacharid na plazmu je spojen s částicemi obsahujícími apolipoprotein A-I, fosfolipidy a proteiny související s faktorem H“. J. Biol. Chem. 271 (30): 18054–60. doi:10.1074 / jbc.271.30.18054. PMID 8663389.
Nanbo A, Nishimura H, Nagasawa S (1997). "Lipopolysacharid vázající protein z normální lidské plazmy purifikovaný s vysokou účinností". Protein Expr. Purif. 10 (1): 55–60. doi:10.1006 / prep.1996.0712. PMID 9179291.
Hubacek JA, Büchler C, Aslanidis C, Schmitz G (1997). „Genomická organizace genů pro lidský protein vázající lipopolysacharid (LBP) a protein zvyšující baktericidní permeabilitu (BPI) je vysoce zachována.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 236 (2): 427–30. doi:10.1006 / bbrc.1997.6970. PMID 9240454.
Jack RS, Fan X, Bernheiden M a kol. (1997). „Protein vázající lipopolysacharid je nezbytný pro potírání myší gramnegativní bakteriální infekce.“ Příroda. 389 (6652): 742–5. Bibcode:1997 Natur.389..742J. doi:10.1038/39622. PMID 9338787. S2CID 205027151.
Kirschning CJ, Au-Young J, Lamping N a kol. (1998). „Podobné uspořádání genů vázajících lipopolysacharidový protein (LBP) a fosfolipidový přenosový protein (PLTP) naznačuje společnou genovou rodinu proteinů vázajících lipidy.“ Genomika. 46 (3): 416–25. doi:10.1006 / geno.1997.5030. PMID 9441745.
Beamer LJ, Carroll SF, Eisenberg D (1998). „Rodina proteinů BPI / LBP: strukturální analýza konzervovaných oblastí“. Protein Sci. 7 (4): 906–14. doi:10.1002 / pro.5560070408. PMC 2143972. PMID 9568897.
Sato M, Saeki Y, Tanaka K, Kaneda Y (1999). „Protein asociovaný s ribozomy LBP / p40 se váže na protein S21 ribosomu 40S: analýza pomocí kvasinkového dvouhybridního systému“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 256 (2): 385–90. doi:10.1006 / bbrc.1999.0343. PMID 10079194.
Vreugdenhil AC, Dentener MA, Snoek AM a kol. (1999). „Lipopolysacharid vázající protein a sérový amyloid A sekrece lidskými intestinálními epiteliálními buňkami během reakce akutní fáze“. Journal of Immunology. 163 (5): 2792–8. PMID 10453023.
Vesy CJ, Kitchens RL, Wolfbauer G a kol. (2000). „Protein vázající lipopolysacharidy a fosfolipidové proteiny uvolňující lipopolysacharidy z gramnegativních bakteriálních membrán“. Infikovat. Immun. 68 (5): 2410–7. doi:10.1128 / IAI.68.5.2410-2417.2000. PMC 97439. PMID 10768924.
Labéta MO, Vidal K, Nores JE a kol. (2000). „Vrozené rozpoznávání bakterií v lidském mléce je zprostředkováno vysoce vyjádřeným receptorem pro rozpoznávání vzorů odvozeným od mléka, rozpustným Cd14“. J. Exp. Med. 191 (10): 1807–12. doi:10.1084 / jem.191.10.1807. PMC 2193148. PMID 10811873.
Dentener MA, Vreugdenhil AC, Hoet PH a kol. (2000). "Produkce proteinu akutní fáze vázajícího lipopolysacharidový protein dýchacími epitelovými buňkami typu II: důsledky pro lokální obranu proti bakteriálním endotoxinům". Dopoledne. J. Respir. Cell Mol. Biol. 23 (2): 146–53. doi:10.1165 / ajrcmb.23.2.3855. PMID 10919979.
Nagaoka I, Hirota S, Niyonsaba F a kol. (2001). „Katahelicidinová rodina antibakteriálních peptidů CAP18 a CAP11 inhibuje expresi TNF-alfa blokováním vazby LPS na CD14 (+) buňky“. Journal of Immunology. 167 (6): 3329–38. doi:10,4049 / jimmunol.167.6.3329. PMID 11544322.
Gutsmann T, Müller M, Carroll SF a kol. (2001). „Dvojí role lipopolysacharidu (LPS) vázajícího proteinu při neutralizaci LPS a zesílení LPS indukované aktivace mononukleárních buněk“. Infikovat. Immun. 69 (11): 6942–50. doi:10.1128 / IAI.69.11.6942-6950.2001. PMC 100074. PMID 11598069.
Iovine N, Eastvold J, Elsbach P a kol. (2002). „Karboxylová koncová doména úzce příbuzných proteinů vázajících endotoxin určuje cíl komplexů protein-lipopolysacharid“. J. Biol. Chem. 277 (10): 7970–8. doi:10,1074 / jbc.M109622200. PMID 11773072.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001 Natur.414..865D. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Kaden J, Zwerenz P, Lambrecht HG, Dostatni R (2002). „Protein vázající lipopolysacharidy jako nový a spolehlivý marker infekce po transplantaci ledviny“. Transpl. Int. 15 (4): 163–72. doi:10.1007 / s00147-002-0392-2. PMID 11976738. S2CID 23593715.
Reyes O, Vallespi MG, Garay HE a kol. (2002). "Identifikace jednotlivých aminokyselinových zbytků nezbytných pro vazbu lipopolysacharidů (LPS) na zbytky vazebného proteinu LPS (LBP) 86-99 pomocí Ala-skenovací knihovny". J. Pept. Sci. 8 (4): 144–50. doi:10,1002 / psc.375. PMID 11991204.

externí odkazy

lipopolysacharid vázající + protein v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129988 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016024 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8432532-5] Gray PW, Corcorran AE, Eddy RL Jr, Byers MG, Show TB (březen 1993). „Geny pro lipopolysacharid vázající protein (LBP) a protein zvyšující baktericidní permeabilitu (BPI) jsou kódovány ve stejné oblasti lidského chromozomu 20“. Genomika. 15 (1): 188–90. doi:10.1006 / geno.1993.1030. PMID 8432532.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LBP lipopolysacharid binding protein“.

[7] Muta T, Takeshige K (2001). „Základní role CD14 a proteinu vázajícího lipopolysacharidy pro aktivaci toll-like receptoru (TLR) 2 a také TLR4 Rekonstituce aktivace TLR2 a TLR4 rozlišitelnými ligandy v přípravcích LPS.“ Eur. J. Biochem. 268 (16): 4580–9. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02385.x. PMID 11502220.

[pmid12417309-8] Thomas, Celestine J; Kapoor Mili; Sharma Shilpi; Bausinger Huguette; Zyilan Umit; Lipsker Dan; Hanau Daniel; Surolia Avadhesha (listopad 2002). „Důkaz trimolekulárního komplexu zahrnujícího LPS, protein vázající LPS a rozpustný CD14 jako efektor odpovědi LPS“. FEBS Lett. 531 (2): 184–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03499-3. ISSN 0014-5793. PMID 12417309. S2CID 25135963.

[pmid7583357-9] Yu, B; Wright SD (1995). „LPS závislá interakce proteinu vázajícího Mac-2 s imobilizovaným CD14“. J. Inflamm. 45 (2): 115–25. ISSN 1078-7852. PMID 7583357.

[pmid15272059-10] Erridge, C; Pridmore, A; Eley, A; Stewart, J; Poxton, IR (2004). „Lipopolysacharidy Bacteroides fragilis, Chlamydia trachomatis a Pseudomonas aeruginosa signalizují prostřednictvím mýtného receptoru 2“. Journal of Medical Microbiology. 53 (Pt 8): 735–40. doi:10.1099 / jmm.0.45598-0. PMID 15272059.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]